More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1719 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1719  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 116 aa  223  6e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241026 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2325  small multidrug resistance protein  45.71 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1863  small multidrug resistance protein  45.05 
 
 		 123 aa  107  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1102  small multidrug resistance protein  47.57 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3077  small multidrug resistance protein  44.33 
 
 		 106 aa  103  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1095  SMR drug efflux transporter  50.49 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.1863  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  49.04 
 
 		 106 aa  100  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0402  multidrug resistance protein, Smr family  48.08 
 
 		 107 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0151896  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0313  SMR family multidrug efflux pump  48.08 
 
 		 107 aa  99.4  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0296  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  48.08 
 
 		 107 aa  99.4  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0300  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  48.08 
 
 		 107 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0328  SMR family multidrug efflux pump  48.08 
 
 		 107 aa  99.4  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0308  small multidrug resistance protein  48.08 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0374  multidrug resistance protein, Smr family  48.08 
 
 		 107 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4946  multidrug resistance protein, Smr family  48.08 
 
 		 107 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0360  multidrug resistance protein, Smr family  47.12 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0357  SMR family multidrug efflux pump  47.12 
 
 		 107 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0307  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1177  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 109 aa  90.9  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000160416  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  44.23 
 
 		 120 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  44.23 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1476  SMR drug efflux transporter  46.15 
 
 		 108 aa  89.4  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  44.23 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  44.12 
 
 		 120 aa  88.6  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  44.12 
 
 		 120 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  43.27 
 
 		 120 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4701  small multidrug resistance protein  46.15 
 
 		 112 aa  87.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1079  small multidrug resistance protein  45.19 
 
 		 112 aa  86.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1535  small multidrug resistance protein  45.19 
 
 		 112 aa  86.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1559  small multidrug resistance protein  45.19 
 
 		 112 aa  86.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219332  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1481  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 112 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1460  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 112 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4755  small multidrug resistance protein  45.19 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.504307  normal  0.07446 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2091  small multidrug resistance protein  45.88 
 
 		 100 aa  84  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.818483  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 110 aa  83.6  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1673  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 112 aa  83.6  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107144 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  43.56 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1583  SMR family multidrug efflux transporter  43.56 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.352831  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1319  small multidrug resistance protein  51.81 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0145783  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  44.23 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  44.23 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0798  SMR family multidrug efflux transporter  41.24 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.621925  normal  0.0234862 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  43.81 
 
 		 105 aa  80.1  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  45.1 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  44.55 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  41.67 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2603  small multidrug resistance protein  41.75 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  39.62 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  39.62 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0871  small multidrug resistance protein  39.62 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1884  small multidrug resistance protein  47.42 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2505  SMR family multidrug efflux pump  41 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0657  small multidrug resistance protein  42.45 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1245  SMR family multidrug efflux pump  41.84 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1832  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  41.84 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.935098  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1984  SMR family multidrug efflux pump  41.84 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0388  SMR family multidrug efflux pump  41.84 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0774  SMR family multidrug efflux pump  41.84 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15362  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1730  SMR family multidrug efflux pump  41.84 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1815  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  41.84 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.701999  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1735  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  43.56 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1088  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2502  quaternary ammonium efflux pump, 4 TMS small multidrug resistance (SMR) family, GacE  38.46 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85484  normal  0.536214 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3464  small multidrug resistance protein  41.51 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.667657 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1659  small multidrug resistance protein  39.45 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119593  normal  0.110471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0828  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.251219  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 111 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2072  small multidrug resistance protein  39.62 
 
 		 114 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  42.42 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2083  small multidrug resistance protein  48.84 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000894022  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0450  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0731  small multidrug efflux pump  38.24 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  40.57 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3903  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3008  small multidrug resistance protein  36.79 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3259  small multidrug resistance protein  36.79 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  41.58 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  38.61 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40170  putative transporter  39.62 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  40.57 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  37.74 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0339  small multidrug resistance protein  36.79 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  36.36 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0281  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0987  small multidrug resistance efflux protein  42 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25874  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  38.83 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0627  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2320  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1769  small multidrug resistance protein  37.04 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4585  small multidrug resistance protein  43.21 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.631388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  41.58 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5069  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  36.54 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8958  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  42.57 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  38.68 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>