More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1177 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1177  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 109 aa  209  9e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000160416  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1102  small multidrug resistance protein  49.04 
 
 		 107 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1095  SMR drug efflux transporter  52.88 
 
 		 108 aa  110  5e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.1863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  47.17 
 
 		 120 aa  103  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1863  small multidrug resistance protein  46.15 
 
 		 123 aa  103  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  47.17 
 
 		 120 aa  102  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  47.17 
 
 		 120 aa  102  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  47.17 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3077  small multidrug resistance protein  49.51 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  47.17 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  45.28 
 
 		 120 aa  100  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2325  small multidrug resistance protein  46 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1319  small multidrug resistance protein  51.92 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0145783  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 106 aa  96.7  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0313  SMR family multidrug efflux pump  41.75 
 
 		 107 aa  94.7  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0296  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  41.75 
 
 		 107 aa  94.7  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0300  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  41.75 
 
 		 107 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0328  SMR family multidrug efflux pump  41.75 
 
 		 107 aa  94.7  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4755  small multidrug resistance protein  45.45 
 
 		 136 aa  94.4  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.504307  normal  0.07446 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0360  multidrug resistance protein, Smr family  40.78 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0402  multidrug resistance protein, Smr family  41.75 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0151896  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0308  small multidrug resistance protein  40.78 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0374  multidrug resistance protein, Smr family  40.78 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4946  multidrug resistance protein, Smr family  40.78 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1719  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 116 aa  90.9  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241026 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0357  SMR family multidrug efflux pump  40.78 
 
 		 107 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1476  SMR drug efflux transporter  49.04 
 
 		 108 aa  89.4  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0307  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  44.34 
 
 		 109 aa  87  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2083  small multidrug resistance protein  47 
 
 		 107 aa  86.7  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000894022  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2208  quaternary ammonium compound-resistance protein  40.57 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.831863  normal  0.342211 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1914  small multidrug resistance protein  40.57 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1804  multidrug resistance protein, SMR family protein  40.57 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  44.34 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3289  small multidrug resistance protein  41.51 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  44.34 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 111 aa  84  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  42.45 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2329  small multidrug resistance protein  40.91 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  37.74 
 
 		 116 aa  80.5  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  42 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0798  SMR family multidrug efflux transporter  39.81 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.621925  normal  0.0234862 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  39.62 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  40.57 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1583  SMR family multidrug efflux transporter  39.6 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.352831  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1659  small multidrug resistance protein  35.51 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119593  normal  0.110471 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2072  small multidrug resistance protein  38.14 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38630  cation/cationic drug transporter  42 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  39.42 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  38.68 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  36.54 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2091  small multidrug resistance protein  45.12 
 
 		 100 aa  75.5  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.818483  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0986  small multidrug resistance protein  36.11 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4068  small multidrug resistance protein  38.68 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2502  quaternary ammonium efflux pump, 4 TMS small multidrug resistance (SMR) family, GacE  37.96 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85484  normal  0.536214 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  36.11 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1501  multidrug transporter EmrE  39.05 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21028  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  37.37 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  37.37 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1774  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  38.1 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324074  normal  0.0937038 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0987  small multidrug resistance efflux protein  39.05 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25874  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2599  small multidrug resistance protein  34.91 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  0.505891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4585  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.631388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2320  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 106 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1684  multidrug transporter EmrE  37.14 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487331  normal  0.0413845 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1772  multidrug transporter EmrE  37.14 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.132035 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1835  multidrug transporter EmrE  37.14 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.997367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2603  small multidrug resistance protein  34.91 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1735  small multidrug resistance protein  36.11 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2692  small multidrug resistance protein  45.24 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  38.78 
 
 		 108 aa  72  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1298  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 		 105 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6952  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8958  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  36.79 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0627  small multidrug resistance protein  38.61 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1762  small multidrug resistance protein  47.52 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1884  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1079  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1559  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219332  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1535  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  40.21 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1815  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  37.25 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.701999  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1730  SMR family multidrug efflux pump  37.25 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1245  SMR family multidrug efflux pump  37.25 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0774  SMR family multidrug efflux pump  37.25 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15362  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1984  SMR family multidrug efflux pump  37.25 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1832  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  37.25 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.935098  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0388  SMR family multidrug efflux pump  37.25 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003631  quaternary ammonium compound-resistance protein  34.91 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  34.95 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0979  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3195  small multidrug resistance protein  37 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141243 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04008  SugE  36.27 
 
 		 104 aa  70.1  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  38.83 
 
 		 104 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2330  small multidrug resistance protein  38.82 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5069  small multidrug resistance protein  36.79 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02486  hypothetical protein  34.91 
 
 		 117 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5609  small multidrug resistance protein  37.74 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.329891  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  36.89 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>