More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6952 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6952  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 109 aa  199  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38630  cation/cationic drug transporter  58.49 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0987  small multidrug resistance efflux protein  52.34 
 
 		 107 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25874  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  49.06 
 
 		 110 aa  97.8  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  49.53 
 
 		 116 aa  97.1  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  50 
 
 		 110 aa  95.9  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  50 
 
 		 110 aa  95.9  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0627  small multidrug resistance protein  47.17 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4527  small multidrug resistance protein  55.14 
 
 		 107 aa  93.2  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2208  quaternary ammonium compound-resistance protein  48.57 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.831863  normal  0.342211 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  44.86 
 
 		 109 aa  92.8  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1914  small multidrug resistance protein  48.57 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1804  multidrug resistance protein, SMR family protein  48.57 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2946  small multidrug resistance protein  47.66 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2603  small multidrug resistance protein  49.52 
 
 		 110 aa  90.9  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  50.47 
 
 		 109 aa  90.5  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3008  small multidrug resistance protein  49.07 
 
 		 113 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1234  small multidrug resistance protein  45.71 
 
 		 113 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  48.6 
 
 		 110 aa  88.2  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3259  small multidrug resistance protein  48.11 
 
 		 113 aa  87.8  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2543  small multidrug resistance protein  52.88 
 
 		 109 aa  87.8  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544067  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1769  small multidrug resistance protein  44.95 
 
 		 109 aa  87.8  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1095  SMR drug efflux transporter  43.4 
 
 		 108 aa  87.4  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.1863  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1501  multidrug transporter EmrE  42.45 
 
 		 112 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21028  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  39.45 
 
 		 120 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1863  small multidrug resistance protein  39.25 
 
 		 123 aa  87  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1762  small multidrug resistance protein  45.79 
 
 		 108 aa  86.7  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1772  multidrug transporter EmrE  42.45 
 
 		 112 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.132035 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  50.48 
 
 		 111 aa  86.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  39.45 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1684  multidrug transporter EmrE  42.45 
 
 		 112 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487331  normal  0.0413845 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1835  multidrug transporter EmrE  42.45 
 
 		 112 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.997367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0552  multidrug ABC transporter  53.66 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1774  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  42.45 
 
 		 112 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324074  normal  0.0937038 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  39.45 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  46.73 
 
 		 108 aa  86.7  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  48.08 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  48.51 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  38.53 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  44.86 
 
 		 109 aa  85.5  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1102  small multidrug resistance protein  41.51 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  43.81 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  43.81 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2204  small multidrug resistance protein  52.44 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.148347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0150  quaternary ammonium compound-resistance protein QacEdelta1  51.06 
 
 		 115 aa  84.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.928712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1584  multidrug efflux protein  51.06 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.339035  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  37.61 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  38.53 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1177  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 109 aa  84  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000160416  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0450  small multidrug resistance protein  46.73 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4755  small multidrug resistance protein  46.36 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.504307  normal  0.07446 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  42.99 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2364  small multidrug resistance protein  50.48 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  42.99 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3009  small multidrug resistance protein  44.86 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  42.99 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2765  multidrug efflux system protein MdtI  47.47 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.19873  normal  0.0165196 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1638  efflux-multidrug resistance protein  40.37 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.381762  hitchhiker  0.000000419533 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1826  small multidrug resistance protein  46.79 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal  0.470725 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1617  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3228  multidrug efflux protein  42.86 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0308245  hitchhiker  0.000780201 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3546  small multidrug resistance protein  36.54 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  45 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1659  small multidrug resistance protein  45.19 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119593  normal  0.110471 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0339  small multidrug resistance protein  43.56 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2257  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.709004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1912  multidrug efflux system protein MdtI  50 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1603  multidrug efflux protein  42.86 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352426 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  48.45 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02486  hypothetical protein  44.12 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0813  multidrug efflux protein  41.9 
 
 		 110 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.109831  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1884  small multidrug resistance protein  52.53 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2036  multidrug efflux protein  41.9 
 
 		 110 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4701  small multidrug resistance protein  44.76 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1245  SMR family multidrug efflux pump  46.15 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1832  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  46.15 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.935098  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0828  small multidrug resistance protein  42.99 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.251219  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0774  SMR family multidrug efflux pump  46.15 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15362  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  40.57 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1984  SMR family multidrug efflux pump  46.15 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0388  SMR family multidrug efflux pump  46.15 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2072  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1815  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  46.15 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.701999  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3717  small multidrug resistance protein  35.58 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1730  SMR family multidrug efflux pump  46.15 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01568  multidrug efflux system transporter  47.96 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2044  small multidrug resistance protein  47.96 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1673  multidrug efflux system protein MdtI  47.96 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1806  multidrug efflux system protein MdtI  47.96 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1600  multidrug efflux system protein MdtI  47.96 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2309  multidrug efflux system protein MdtI  47.96 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.924563 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1476  SMR drug efflux transporter  48.81 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1785  multidrug efflux system protein MdtI  47.96 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2031  multidrug efflux system protein MdtI  47.96 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.660204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0657  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01558  hypothetical protein  47.96 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2350  putative methyl viologen/ethidium resistance transmembrane protein  42.06 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000392235  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0871  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1670  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.774613  hitchhiker  0.00381818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>