More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2512 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 108 aa  205  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  68.52 
 
 		 109 aa  138  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  55.88 
 
 		 110 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  49.04 
 
 		 110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  49.04 
 
 		 110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  54.17 
 
 		 111 aa  111  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  52.88 
 
 		 116 aa  111  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  54.46 
 
 		 109 aa  107  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0437  small multidrug resistance protein  51.46 
 
 		 113 aa  103  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.453624  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3289  small multidrug resistance protein  50.48 
 
 		 126 aa  103  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  52.94 
 
 		 110 aa  103  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  52.94 
 
 		 110 aa  103  9e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2364  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 110 aa  103  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1735  small multidrug resistance protein  53.12 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  48.48 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2603  small multidrug resistance protein  52.04 
 
 		 110 aa  101  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2502  quaternary ammonium efflux pump, 4 TMS small multidrug resistance (SMR) family, GacE  49.04 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85484  normal  0.536214 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3321  small multidrug resistance protein  50.5 
 
 		 111 aa  101  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00184251  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  52.43 
 
 		 111 aa  101  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1245  SMR family multidrug efflux pump  46.15 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0388  SMR family multidrug efflux pump  46.15 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1984  SMR family multidrug efflux pump  46.15 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1815  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  46.15 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.701999  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2505  SMR family multidrug efflux pump  46.15 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1832  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  46.15 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.935098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0774  SMR family multidrug efflux pump  46.15 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15362  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1730  SMR family multidrug efflux pump  46.15 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  50 
 
 		 110 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1769  small multidrug resistance protein  52.04 
 
 		 109 aa  100  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  49.5 
 
 		 109 aa  99  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  49.5 
 
 		 109 aa  99  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1088  small multidrug resistance protein  49.5 
 
 		 109 aa  97.8  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4701  small multidrug resistance protein  48.08 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1535  small multidrug resistance protein  47.12 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1079  small multidrug resistance protein  47.12 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1559  small multidrug resistance protein  47.12 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219332  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  49.04 
 
 		 110 aa  97.1  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1481  small multidrug resistance protein  46.15 
 
 		 112 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1460  small multidrug resistance protein  46.15 
 
 		 112 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1673  small multidrug resistance protein  45.19 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107144 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1826  small multidrug resistance protein  49.07 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal  0.470725 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  45.54 
 
 		 109 aa  95.9  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1804  multidrug resistance protein, SMR family protein  46.08 
 
 		 110 aa  95.5  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3071  small multidrug resistance protein  48.48 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.425013  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2543  small multidrug resistance protein  47.12 
 
 		 109 aa  95.5  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544067  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2208  quaternary ammonium compound-resistance protein  46.08 
 
 		 110 aa  95.5  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.831863  normal  0.342211 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  47.12 
 
 		 110 aa  95.1  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1914  small multidrug resistance protein  46.08 
 
 		 110 aa  95.5  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4585  small multidrug resistance protein  54.67 
 
 		 110 aa  94  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.631388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00740  multidrug efflux SMR transporter  53.57 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0150  quaternary ammonium compound-resistance protein QacEdelta1  47.92 
 
 		 115 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.928712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  44.55 
 
 		 113 aa  92.8  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3259  small multidrug resistance protein  46.32 
 
 		 113 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1584  multidrug efflux protein  47.92 
 
 		 153 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.339035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1638  efflux-multidrug resistance protein  47.96 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.381762  hitchhiker  0.000000419533 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1576  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 110 aa  91.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.554715  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1659  small multidrug resistance protein  45.54 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119593  normal  0.110471 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4930  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.984602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38630  cation/cationic drug transporter  46.23 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4802  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.123188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4979  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 110 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.174415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3008  small multidrug resistance protein  46.32 
 
 		 113 aa  90.9  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1102  small multidrug resistance protein  49.49 
 
 		 107 aa  90.9  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 110 aa  90.5  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  43.4 
 
 		 112 aa  90.1  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3466  small multidrug resistance protein  46.32 
 
 		 110 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  45.45 
 
 		 109 aa  90.1  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1684  multidrug transporter EmrE  40.4 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487331  normal  0.0413845 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  45.71 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3009  small multidrug resistance protein  48.48 
 
 		 109 aa  89.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0450  small multidrug resistance protein  48.48 
 
 		 109 aa  89.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1835  multidrug transporter EmrE  40.4 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.997367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1772  multidrug transporter EmrE  40.4 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.132035 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  45.71 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0536  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568122  normal  0.0651219 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1973  small multidrug resistance protein  49.5 
 
 		 109 aa  88.6  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  44.76 
 
 		 120 aa  89  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2946  small multidrug resistance protein  44 
 
 		 109 aa  89.4  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1774  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  40.4 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324074  normal  0.0937038 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1501  multidrug transporter EmrE  40.4 
 
 		 112 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21028  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  42.11 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  44.76 
 
 		 120 aa  88.2  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0488  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0280081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  44.76 
 
 		 120 aa  88.2  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0657  small multidrug resistance protein  46.53 
 
 		 113 aa  87.8  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  47.37 
 
 		 106 aa  87.8  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  44.76 
 
 		 120 aa  87.4  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0871  small multidrug resistance protein  42.42 
 
 		 114 aa  87.8  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0828  small multidrug resistance protein  45.36 
 
 		 109 aa  87.4  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.251219  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1516  small multidrug resistance protein  46.15 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2235  small multidrug resistance protein  45.26 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1762  small multidrug resistance protein  49.07 
 
 		 108 aa  86.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3077  small multidrug resistance protein  46.24 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0541  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.730216  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4701  small multidrug resistance protein  45.45 
 
 		 111 aa  84.7  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0118  small multidrug resistance protein  43.56 
 
 		 109 aa  84.7  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2887  small multidrug resistance protein  48.81 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.014423 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 105 aa  84.3  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1884  small multidrug resistance protein  48.15 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0271  small multidrug resistance protein  38.38 
 
 		 108 aa  83.6  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>