More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1095 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1095  SMR drug efflux transporter  100 
 
 		 108 aa  209  1e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.1863  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1102  small multidrug resistance protein  69.52 
 
 		 107 aa  157  4e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1863  small multidrug resistance protein  63.89 
 
 		 123 aa  144  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1476  SMR drug efflux transporter  56.19 
 
 		 108 aa  114  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1177  small multidrug resistance protein  52.88 
 
 		 109 aa  110  5e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000160416  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3077  small multidrug resistance protein  51.02 
 
 		 106 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  48.08 
 
 		 120 aa  107  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  47.12 
 
 		 120 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  48.08 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  47.12 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  47.12 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  46.15 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1719  small multidrug resistance protein  50.49 
 
 		 116 aa  101  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241026 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  50.98 
 
 		 106 aa  97.8  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4755  small multidrug resistance protein  52.43 
 
 		 136 aa  98.2  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.504307  normal  0.07446 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2325  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 		 107 aa  97.4  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0357  SMR family multidrug efflux pump  44.34 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0313  SMR family multidrug efflux pump  44.34 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0296  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  44.34 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0300  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  44.34 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0328  SMR family multidrug efflux pump  44.34 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0402  multidrug resistance protein, Smr family  44.34 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0151896  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0360  multidrug resistance protein, Smr family  43.4 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0307  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 107 aa  92  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1319  small multidrug resistance protein  53.4 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0145783  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0308  small multidrug resistance protein  43.4 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0374  multidrug resistance protein, Smr family  44.34 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4946  multidrug resistance protein, Smr family  44.34 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2083  small multidrug resistance protein  52.94 
 
 		 107 aa  90.1  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000894022  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  42.2 
 
 		 109 aa  88.2  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2091  small multidrug resistance protein  48.84 
 
 		 100 aa  87  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.818483  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0987  small multidrug resistance efflux protein  40.38 
 
 		 107 aa  84  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25874  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  48.08 
 
 		 109 aa  84  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2897  small multidrug resistance protein  51.22 
 
 		 104 aa  83.6  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.904986 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  43.81 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38630  cation/cationic drug transporter  42.31 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  45 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  45 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  39.81 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1088  small multidrug resistance protein  40.37 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  46.88 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3289  small multidrug resistance protein  43.56 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  40.57 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0118  small multidrug resistance protein  46.36 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  41.49 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2072  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  38.53 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  38.53 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4527  small multidrug resistance protein  43.4 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0718  small multidrug resistance protein  45.26 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4585  small multidrug resistance protein  46.67 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.631388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  38.61 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0627  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2330  small multidrug resistance protein  39.29 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1638  efflux-multidrug resistance protein  40.2 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.381762  hitchhiker  0.000000419533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2692  small multidrug resistance protein  47.67 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  36.11 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  36.11 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0853  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0613  hypothetical protein  36.89 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0595  hypothetical protein  36.89 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4068  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04008  SugE  40.2 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  37.14 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  41.12 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  37.14 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0281  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  37.86 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  37.14 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  37.04 
 
 		 111 aa  74.7  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  37.14 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  37.14 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4701  small multidrug resistance protein  37.61 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  37.14 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  37.14 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2235  small multidrug resistance protein  34.29 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  37.14 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  40.38 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2608  small multidrug resistance protein  39.25 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1583  SMR family multidrug efflux transporter  38.24 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.352831  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0798  SMR family multidrug efflux transporter  36.27 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.621925  normal  0.0234862 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2052  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712643 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1762  small multidrug resistance protein  46.15 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0996  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 106 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.762024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8958  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  39.81 
 
 		 107 aa  73.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  39 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2198  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6952  small multidrug resistance protein  43.4 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2946  small multidrug resistance protein  37.61 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  39.42 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  39.42 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  38.89 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2320  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>