More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2330 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2330  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 130 aa  248  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2329  small multidrug resistance protein  67.65 
 
 		 110 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 109 aa  90.9  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38630  cation/cationic drug transporter  41.9 
 
 		 108 aa  87.8  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  38.68 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 		 116 aa  85.1  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  44.66 
 
 		 111 aa  84.3  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  43 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  41.58 
 
 		 110 aa  83.6  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 106 aa  83.6  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  41.75 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1095  SMR drug efflux transporter  36.89 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.1863  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  41.75 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3948  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1863  small multidrug resistance protein  33.65 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1102  small multidrug resistance protein  35.24 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0987  small multidrug resistance efflux protein  42.86 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25874  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  39.42 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  37.86 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  37.86 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  41.51 
 
 		 111 aa  80.1  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0450  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1659  small multidrug resistance protein  38.39 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119593  normal  0.110471 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1769  small multidrug resistance protein  38.32 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  41.75 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  35.29 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1177  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000160416  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  38.46 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  38.46 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  35.29 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  35.29 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1762  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0570  small multidrug resistance protein  41.67 
 
 		 101 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  38.46 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  34.31 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1392  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1774  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  35.24 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324074  normal  0.0937038 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1481  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545995  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  32.71 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1501  multidrug transporter EmrE  35.24 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21028  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4701  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1583  SMR family multidrug efflux transporter  36.27 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.352831  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1584  multidrug efflux protein  38.21 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.339035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  32.71 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3071  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.425013  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1460  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1835  multidrug transporter EmrE  35.24 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.997367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  40.38 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1684  multidrug transporter EmrE  35.24 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487331  normal  0.0413845 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1772  multidrug transporter EmrE  35.24 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.132035 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3289  small multidrug resistance protein  39 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0150  quaternary ammonium compound-resistance protein QacEdelta1  39.42 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.928712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1673  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107144 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1397  small multidrug resistance protein  35.29 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118337 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3195  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141243 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1672  small multidrug resistance protein  35.29 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.737958  normal  0.915426 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0798  SMR family multidrug efflux transporter  36.19 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.621925  normal  0.0234862 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1079  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1559  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219332  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1535  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1502  small multidrug resistance protein  37.86 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3646  small multidrug resistance protein  42.16 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0986  small multidrug resistance protein  36.89 
 
 		 291 aa  73.9  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2364  small multidrug resistance protein  41.28 
 
 		 110 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0685  small multidrug resistance protein  36.89 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4755  small multidrug resistance protein  38.61 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.504307  normal  0.07446 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  37.25 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1735  small multidrug resistance protein  37.04 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1617  small multidrug resistance protein  35.92 
 
 		 110 aa  72  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2257  small multidrug resistance protein  35.92 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.709004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1088  small multidrug resistance protein  35.58 
 
 		 109 aa  72  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0437  small multidrug resistance protein  37.96 
 
 		 113 aa  72  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.453624  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  37.74 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40170  putative transporter  40.38 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2502  quaternary ammonium efflux pump, 4 TMS small multidrug resistance (SMR) family, GacE  35.19 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85484  normal  0.536214 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0853  small multidrug resistance protein  35.92 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  33.65 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  33.65 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1476  SMR drug efflux transporter  36.9 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0871  small multidrug resistance protein  33.66 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  34.95 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3009  small multidrug resistance protein  35.85 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  36.27 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2650  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 105 aa  70.1  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  32.04 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4733  transporter  45 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  32.41 
 
 		 110 aa  70.1  0.000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  35.29 
 
 		 105 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  30 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0388  SMR family multidrug efflux pump  34.95 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2505  SMR family multidrug efflux pump  33.98 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2897  small multidrug resistance protein  43.04 
 
 		 104 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.904986 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1815  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  34.95 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.701999  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1730  SMR family multidrug efflux pump  34.95 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>