More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1672 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1672  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 106 aa  202  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.737958  normal  0.915426 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1397  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 106 aa  202  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118337 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1392  small multidrug resistance protein  97.17 
 
 		 106 aa  198  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0685  small multidrug resistance protein  77.14 
 
 		 105 aa  150  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3008  small multidrug resistance protein  72.38 
 
 		 106 aa  150  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0853  small multidrug resistance protein  73.33 
 
 		 105 aa  145  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3825  small multidrug resistance protein  75 
 
 		 106 aa  144  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6417  small multidrug resistance protein  68.87 
 
 		 106 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3611  small multidrug resistance protein  72.38 
 
 		 106 aa  141  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2158  small multidrug resistance protein  70.19 
 
 		 104 aa  135  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0773  sugE protein  69.52 
 
 		 105 aa  133  7.000000000000001e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.757365  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0780  sugE protein  68.57 
 
 		 105 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2198  small multidrug resistance protein  65.09 
 
 		 106 aa  130  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2320  small multidrug resistance protein  65.09 
 
 		 106 aa  130  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  65.38 
 
 		 106 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  61.54 
 
 		 107 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5609  small multidrug resistance protein  61.32 
 
 		 134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.329891  normal  0.920553 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  61.54 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  62.5 
 
 		 106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.177322 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0996  small multidrug resistance protein  62.26 
 
 		 106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.762024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3948  small multidrug resistance protein  62.5 
 
 		 106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  61.54 
 
 		 105 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  61.54 
 
 		 105 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  61.54 
 
 		 105 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  61.54 
 
 		 105 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  61.54 
 
 		 105 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  61.54 
 
 		 105 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  61.54 
 
 		 105 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  61.54 
 
 		 105 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2052  small multidrug resistance protein  63.46 
 
 		 106 aa  124  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712643 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40170  putative transporter  60.58 
 
 		 107 aa  124  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5065  small multidrug resistance protein  62.5 
 
 		 105 aa  123  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.929302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2515  small multidrug resistance protein  63.81 
 
 		 105 aa  123  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.686448  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2305  small multidrug resistance protein  61.32 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  58.65 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  58.65 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1670  small multidrug resistance protein  61.32 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2282  small multidrug resistance protein  61.32 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  60.58 
 
 		 104 aa  121  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0777  sugE protein  65.38 
 
 		 106 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590294  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0373  sugE protein  65.38 
 
 		 106 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  60.58 
 
 		 153 aa  120  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1870  sugE protein  65.38 
 
 		 106 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.437905  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1399  suppresses groEL, may be chaperone  65.38 
 
 		 106 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1257  SMR family multidrug efflux pump  65.38 
 
 		 106 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303472  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1090  sugE protein  65.38 
 
 		 106 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1249  SMR family multidrug efflux pump  65.38 
 
 		 106 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  56.73 
 
 		 105 aa  120  8e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  56.6 
 
 		 106 aa  117  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1027  sugE protein  62.5 
 
 		 106 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  49.04 
 
 		 106 aa  111  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1403  small multidrug resistance protein  52.88 
 
 		 104 aa  110  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0526825  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0415  small multidrug resistance protein  56.07 
 
 		 108 aa  110  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179992 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  51.89 
 
 		 106 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 106 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5837  quaternary ammonium compound-resistance protein sugE  50 
 
 		 108 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0796  small multidrug resistance protein  48.08 
 
 		 107 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0730  small multidrug resistance protein  49.04 
 
 		 107 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  51.43 
 
 		 105 aa  105  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  51.96 
 
 		 105 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  50.96 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  50.96 
 
 		 105 aa  105  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  51.43 
 
 		 105 aa  105  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  50.48 
 
 		 105 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1298  small multidrug resistance protein  51.43 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1502  small multidrug resistance protein  52.38 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  52.88 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  50.96 
 
 		 104 aa  104  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4125  small multidrug resistance protein  53.92 
 
 		 104 aa  104  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3903  small multidrug resistance protein  53.47 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1394  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 104 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  50.98 
 
 		 105 aa  102  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  49.5 
 
 		 104 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1276  small multidrug resistance protein  46.6 
 
 		 107 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  50.98 
 
 		 104 aa  99.4  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  45.71 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  51.96 
 
 		 105 aa  99.4  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2608  small multidrug resistance protein  51.92 
 
 		 108 aa  98.2  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1352  small multidrug resistance protein  48.04 
 
 		 104 aa  98.6  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0589  small multidrug resistance protein  51.92 
 
 		 106 aa  98.2  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  49.06 
 
 		 107 aa  97.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  50.98 
 
 		 104 aa  97.4  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  49.02 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3312  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 106 aa  96.7  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0627719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  49.04 
 
 		 110 aa  95.5  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1936  small multidrug resistance protein  51.72 
 
 		 104 aa  95.9  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9285  SugE protein  47.06 
 
 		 104 aa  95.9  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0455  multidrug resistance protein SugE, putative  47.06 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2650  small multidrug resistance protein  52.88 
 
 		 105 aa  95.1  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1950  small multidrug resistance protein  47.12 
 
 		 105 aa  95.1  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.498297  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0100  sugE protein  41.51 
 
 		 114 aa  94.4  4e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1261  small multidrug resistance efflux protein  51.96 
 
 		 104 aa  94.4  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.943877  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2235  small multidrug resistance protein  44.76 
 
 		 106 aa  94.4  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2945  small multidrug resistance protein  46.08 
 
 		 104 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46208  normal  0.904124 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0442  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 		 104 aa  93.6  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.608235  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1901  sugE protein  49.43 
 
 		 104 aa  93.6  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1231  small multidrug resistance protein  47.12 
 
 		 106 aa  93.6  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.7202 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>