More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1102 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1102  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 107 aa  207  5e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1863  small multidrug resistance protein  69.52 
 
 		 123 aa  161  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1095  SMR drug efflux transporter  69.52 
 
 		 108 aa  157  4e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.1863  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1476  SMR drug efflux transporter  67.62 
 
 		 108 aa  135  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  55.14 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  56.07 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  56.07 
 
 		 120 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  55.14 
 
 		 120 aa  123  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  55.14 
 
 		 120 aa  123  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  55.14 
 
 		 120 aa  123  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3077  small multidrug resistance protein  56.12 
 
 		 106 aa  122  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1177  small multidrug resistance protein  49.04 
 
 		 109 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000160416  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2325  small multidrug resistance protein  47.17 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1719  small multidrug resistance protein  47.57 
 
 		 116 aa  104  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241026 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  47.06 
 
 		 106 aa  97.4  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2091  small multidrug resistance protein  47.62 
 
 		 100 aa  97.1  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.818483  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0308  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 107 aa  96.7  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0313  SMR family multidrug efflux pump  42.31 
 
 		 107 aa  94.7  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0296  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  42.31 
 
 		 107 aa  94.7  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0300  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  42.31 
 
 		 107 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0328  SMR family multidrug efflux pump  42.31 
 
 		 107 aa  94.7  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0360  multidrug resistance protein, Smr family  41.35 
 
 		 107 aa  94  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4755  small multidrug resistance protein  44.66 
 
 		 136 aa  93.6  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.504307  normal  0.07446 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4946  multidrug resistance protein, Smr family  42.31 
 
 		 107 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0374  multidrug resistance protein, Smr family  42.31 
 
 		 107 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1088  small multidrug resistance protein  45.79 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0402  multidrug resistance protein, Smr family  42.31 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0151896  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2083  small multidrug resistance protein  45.79 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000894022  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0357  SMR family multidrug efflux pump  41.35 
 
 		 107 aa  92  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 109 aa  90.9  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  49.49 
 
 		 108 aa  90.9  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0307  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 		 107 aa  90.5  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  45.71 
 
 		 109 aa  90.5  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  42.99 
 
 		 109 aa  89.4  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3289  small multidrug resistance protein  48.45 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1319  small multidrug resistance protein  48.75 
 
 		 106 aa  88.2  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0145783  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  42.59 
 
 		 108 aa  87.4  6e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  43.88 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  48.31 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04008  SugE  44.12 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0987  small multidrug resistance efflux protein  38.83 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25874  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2897  small multidrug resistance protein  47.67 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.904986 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  41.67 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2072  small multidrug resistance protein  42.55 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2305  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1670  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2282  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  43.16 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4585  small multidrug resistance protein  52 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.631388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3071  small multidrug resistance protein  40.21 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.425013  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  39.18 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  39.18 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  43.16 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  40.78 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0996  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.762024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1403  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0526825  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1638  efflux-multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.381762  hitchhiker  0.000000419533 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5609  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.329891  normal  0.920553 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  38.1 
 
 		 105 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4701  small multidrug resistance protein  42.27 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  38.1 
 
 		 105 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1973  small multidrug resistance protein  40.57 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  38.68 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  38.1 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  43.48 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  38.68 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  44.21 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1584  multidrug efflux protein  43.48 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.339035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545062 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  38.83 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  38.1 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  38.1 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  38.1 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0150  quaternary ammonium compound-resistance protein QacEdelta1  43.48 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.928712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2692  small multidrug resistance protein  46.51 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  38.1 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  38.1 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.177322 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2198  small multidrug resistance protein  37.14 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0780  sugE protein  41.35 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  39.05 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2320  small multidrug resistance protein  37.14 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  37.5 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  40.38 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  44.55 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  39.18 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1659  small multidrug resistance protein  37.14 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119593  normal  0.110471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1298  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4068  small multidrug resistance protein  41.12 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  40.21 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38630  cation/cationic drug transporter  38.46 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5069  small multidrug resistance protein  39.25 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>