More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5069 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5069  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 107 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3242  small multidrug resistance protein  62.62 
 
 		 107 aa  115  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.810706  normal  0.088661 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4125  small multidrug resistance protein  57.84 
 
 		 104 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3160  small multidrug resistance protein  52.43 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8958  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  56.07 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0442  small multidrug resistance protein  55.88 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.608235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9285  SugE protein  56.86 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  46.6 
 
 		 106 aa  100  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  47.62 
 
 		 106 aa  100  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  49.52 
 
 		 105 aa  100  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3312  small multidrug resistance protein  56 
 
 		 106 aa  100  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0627719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  50.98 
 
 		 104 aa  100  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  49.5 
 
 		 106 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1394  small multidrug resistance protein  49.02 
 
 		 104 aa  99.4  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  50.98 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1352  small multidrug resistance protein  50.98 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2013  small multidrug resistance protein  52.48 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 104 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2887  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 104 aa  97.8  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0184367  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  50.98 
 
 		 108 aa  97.4  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2526  small multidrug resistance protein  52.88 
 
 		 104 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158974  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  49.53 
 
 		 106 aa  97.4  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4068  small multidrug resistance protein  48.6 
 
 		 111 aa  97.1  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1261  small multidrug resistance efflux protein  57.84 
 
 		 104 aa  97.1  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.943877  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  46.15 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1403  small multidrug resistance protein  47.57 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0526825  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2052  small multidrug resistance protein  46.73 
 
 		 106 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712643 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  47.06 
 
 		 105 aa  95.1  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2478  small multidrug resistance protein  54.9 
 
 		 104 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1669  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.187219  hitchhiker  0.00637066 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1965  small multidrug resistance protein  51.46 
 
 		 104 aa  95.9  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1231  small multidrug resistance protein  47.66 
 
 		 106 aa  95.9  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.7202 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  44.66 
 
 		 105 aa  94.4  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  42.16 
 
 		 105 aa  94  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3903  small multidrug resistance protein  49.5 
 
 		 112 aa  93.6  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2170  small multidrug resistance protein  45.79 
 
 		 106 aa  94  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0600  small multidrug resistance protein  52.94 
 
 		 103 aa  94  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2448  small multidrug resistance protein  48.54 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2945  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 104 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46208  normal  0.904124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5837  quaternary ammonium compound-resistance protein sugE  45 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.761993 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  46.6 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  46.6 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0420  small multidrug resistance protein  52.48 
 
 		 104 aa  92.8  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  46.6 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  46.6 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2320  small multidrug resistance protein  47.06 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  46.6 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1773  DMT superfamily multidrug efflux pump  52.48 
 
 		 104 aa  92.8  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.251074  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  46.6 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05170  cation/cationic drug transporter  50.98 
 
 		 104 aa  92.4  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0979  small multidrug resistance protein  47.66 
 
 		 107 aa  92.8  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  46.6 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  46.6 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  46.6 
 
 		 155 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1502  small multidrug resistance protein  45.1 
 
 		 109 aa  92  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1241  small multidrug resistance protein  46.73 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.948929  normal  0.303802 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  46.08 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  48.04 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  45.19 
 
 		 105 aa  90.5  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  42.99 
 
 		 106 aa  90.5  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2198  small multidrug resistance protein  44.76 
 
 		 106 aa  90.1  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2320  small multidrug resistance protein  44.76 
 
 		 106 aa  90.1  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  48.54 
 
 		 153 aa  90.1  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5609  small multidrug resistance protein  46.67 
 
 		 134 aa  90.1  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.329891  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  44.66 
 
 		 105 aa  89.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2305  small multidrug resistance protein  48.57 
 
 		 106 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  48.54 
 
 		 104 aa  90.1  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3195  small multidrug resistance protein  44.55 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141243 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1276  small multidrug resistance protein  48 
 
 		 107 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1670  small multidrug resistance protein  48.57 
 
 		 106 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2282  small multidrug resistance protein  48.57 
 
 		 106 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  42.06 
 
 		 106 aa  88.6  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.177322 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  42.45 
 
 		 110 aa  88.6  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0685  small multidrug resistance protein  45.63 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  41.75 
 
 		 104 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0730  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1231  small multidrug resistance protein  43.93 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2235  small multidrug resistance protein  44.76 
 
 		 106 aa  88.6  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1214  small multidrug resistance protein  43.93 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1936  small multidrug resistance protein  58.67 
 
 		 104 aa  88.2  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2077  small multidrug resistance protein  49.5 
 
 		 119 aa  87.8  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 		 104 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0796  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 		 107 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2608  small multidrug resistance protein  44.76 
 
 		 108 aa  87.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2430  small multidrug resistance protein  50.98 
 
 		 108 aa  87.4  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4255  small multidrug resistance protein  42.99 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.956608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0996  small multidrug resistance protein  44.76 
 
 		 106 aa  87  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.762024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3601  SugE protein  43.14 
 
 		 105 aa  87  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.51586  normal  0.208453 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1392  small multidrug resistance protein  44.66 
 
 		 106 aa  87  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1298  small multidrug resistance protein  45.63 
 
 		 105 aa  87  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3796  small multidrug resistance protein  53.27 
 
 		 107 aa  86.7  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.38629  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  42.72 
 
 		 104 aa  87  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1672  small multidrug resistance protein  43.69 
 
 		 106 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.737958  normal  0.915426 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0186  small multidrug resistance protein  46.08 
 
 		 109 aa  86.7  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1397  small multidrug resistance protein  43.69 
 
 		 106 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118337 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0777  sugE protein  46.23 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590294  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1870  sugE protein  46.23 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.437905  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1090  sugE protein  46.23 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  40.78 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2158  small multidrug resistance protein  43.69 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>