More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2077 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2077  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 119 aa  225  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05170  cation/cationic drug transporter  74.04 
 
 		 104 aa  148  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0186  small multidrug resistance protein  72.12 
 
 		 109 aa  144  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2448  small multidrug resistance protein  70.19 
 
 		 104 aa  141  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2013  small multidrug resistance protein  72.12 
 
 		 104 aa  140  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1669  small multidrug resistance protein  66.35 
 
 		 107 aa  138  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.187219  hitchhiker  0.00637066 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1231  small multidrug resistance protein  68.63 
 
 		 107 aa  138  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1214  small multidrug resistance protein  68.63 
 
 		 107 aa  138  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3160  small multidrug resistance protein  66.35 
 
 		 104 aa  136  7.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1241  small multidrug resistance protein  65.69 
 
 		 107 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.948929  normal  0.303802 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01660  cation/cationic drug transporter  58.65 
 
 		 104 aa  128  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.199547 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3765  small multidrug resistance protein  63.73 
 
 		 112 aa  124  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3492  small multidrug resistance protein  64.36 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5270  small multidrug resistance protein  63.37 
 
 		 104 aa  118  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2887  small multidrug resistance protein  60.58 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0184367  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1352  small multidrug resistance protein  57.69 
 
 		 104 aa  114  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1394  small multidrug resistance protein  55.77 
 
 		 104 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1175  small multidrug resistance protein  55.34 
 
 		 140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0300462 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5269  small multidrug resistance protein  55.34 
 
 		 115 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.493317  normal  0.542796 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4125  small multidrug resistance protein  58.65 
 
 		 104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9285  SugE protein  53.85 
 
 		 104 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1174  small multidrug resistance protein  56 
 
 		 105 aa  104  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0293133 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1936  small multidrug resistance protein  57.69 
 
 		 104 aa  100  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168377  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0442  small multidrug resistance protein  51.92 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.608235  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  50.48 
 
 		 155 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19750  cation/cationic drug transporter  54.81 
 
 		 105 aa  96.3  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00047223  normal  0.0181194 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3242  small multidrug resistance protein  61.25 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.810706  normal  0.088661 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3491  small multidrug resistance protein  57.14 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  50.98 
 
 		 105 aa  94.4  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  50.98 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  50.98 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  50.98 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  50.98 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  50.98 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  50.98 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  50.98 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  47.17 
 
 		 146 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  47.17 
 
 		 146 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1261  small multidrug resistance efflux protein  57.69 
 
 		 104 aa  92.8  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.943877  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  46.08 
 
 		 105 aa  90.9  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  48.04 
 
 		 104 aa  90.5  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  48.04 
 
 		 153 aa  90.5  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5069  small multidrug resistance protein  49.5 
 
 		 107 aa  87.8  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  48.51 
 
 		 106 aa  87.4  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  49.02 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3764  small multidrug resistance protein  56.19 
 
 		 107 aa  87.4  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  49.02 
 
 		 106 aa  84.3  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  48.04 
 
 		 105 aa  84.7  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40170  putative transporter  47.06 
 
 		 107 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  47.06 
 
 		 106 aa  83.6  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4068  small multidrug resistance protein  45.45 
 
 		 111 aa  83.6  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0455  multidrug resistance protein SugE, putative  45.19 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  46.08 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1672  small multidrug resistance protein  60.29 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.737958  normal  0.915426 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1397  small multidrug resistance protein  60.29 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118337 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2430  small multidrug resistance protein  44.66 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1392  small multidrug resistance protein  58.82 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  43.69 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  43.69 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0979  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0415  small multidrug resistance protein  45.19 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179992 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0853  small multidrug resistance protein  43.88 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2320  small multidrug resistance protein  45.1 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5837  quaternary ammonium compound-resistance protein sugE  41 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3008  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  37.86 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  43.27 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4255  small multidrug resistance protein  40.78 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.956608  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0613  hypothetical protein  42.42 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0595  hypothetical protein  42.42 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3464  small multidrug resistance protein  46 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.667657 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1773  DMT superfamily multidrug efflux pump  50 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.251074  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1298  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0420  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2478  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2170  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  48.54 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5065  small multidrug resistance protein  48.24 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.929302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1950  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.498297  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0773  sugE protein  41.18 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.757365  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  41.35 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1005  sugE protein  46.08 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  47.06 
 
 		 106 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0780  sugE protein  40.2 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3312  small multidrug resistance protein  47.06 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0627719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1276  small multidrug resistance protein  44 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  42.16 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0796  small multidrug resistance protein  41.75 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4409  small multidrug resistance protein  46 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  42.16 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  46.08 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.177322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>