235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3764 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3764  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 107 aa  198  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3491  small multidrug resistance protein  81.31 
 
 		 107 aa  149  8.999999999999999e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5270  small multidrug resistance protein  58.88 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2077  small multidrug resistance protein  56.73 
 
 		 119 aa  104  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1214  small multidrug resistance protein  53.27 
 
 		 107 aa  103  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1231  small multidrug resistance protein  53.27 
 
 		 107 aa  103  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1174  small multidrug resistance protein  57.14 
 
 		 105 aa  102  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0293133 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2013  small multidrug resistance protein  54.81 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05170  cation/cationic drug transporter  52.83 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0186  small multidrug resistance protein  50.48 
 
 		 109 aa  100  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1241  small multidrug resistance protein  50.47 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.948929  normal  0.303802 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3160  small multidrug resistance protein  50.48 
 
 		 104 aa  98.2  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01660  cation/cationic drug transporter  49.06 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.199547 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2448  small multidrug resistance protein  54.29 
 
 		 104 aa  97.4  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1669  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 107 aa  97.1  7e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.187219  hitchhiker  0.00637066 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0442  small multidrug resistance protein  51.89 
 
 		 104 aa  94  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.608235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5269  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 115 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.493317  normal  0.542796 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9285  SugE protein  44.76 
 
 		 104 aa  88.2  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3765  small multidrug resistance protein  50.48 
 
 		 112 aa  88.2  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2887  small multidrug resistance protein  47.17 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0184367  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3492  small multidrug resistance protein  47.57 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1352  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1394  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  44.76 
 
 		 104 aa  76.6  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19750  cation/cationic drug transporter  49.06 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00047223  normal  0.0181194 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  44.76 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1175  small multidrug resistance protein  44.66 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0300462 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3646  small multidrug resistance protein  42.99 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2170  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4125  small multidrug resistance protein  43.4 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3242  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.810706  normal  0.088661 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  43.81 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  43.81 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  43.81 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  43.81 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  43.81 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  43.81 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  43.81 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  44.76 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  43.81 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  43.81 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  41.9 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  41.9 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  41.12 
 
 		 105 aa  72  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0979  small multidrug resistance protein  41.12 
 
 		 107 aa  72  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  40.57 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  40.57 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  41.9 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5069  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  43.81 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  40.57 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  42.99 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0730  small multidrug resistance protein  41.75 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  39.25 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  42.06 
 
 		 105 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3825  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1950  small multidrug resistance protein  38.32 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.498297  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1936  small multidrug resistance protein  43.33 
 
 		 104 aa  70.1  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  41.9 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  42.06 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1403  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 104 aa  70.1  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0526825  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5609  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.329891  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1670  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  40 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2305  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2282  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10818  putative chaperone/membrane protein  38.32 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.381879  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  41.12 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  42.06 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3312  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0627719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40170  putative transporter  39.05 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1298  small multidrug resistance protein  40.19 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0685  small multidrug resistance protein  41.11 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1261  small multidrug resistance efflux protein  44.34 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.943877  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2526  small multidrug resistance protein  39.25 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158974  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3195  small multidrug resistance protein  42.45 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141243 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1870  sugE protein  41.9 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.437905  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1399  suppresses groEL, may be chaperone  41.9 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4003  small multidrug resistance protein  38.32 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000483781  normal  0.0171041 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6417  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1090  sugE protein  41.9 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0777  sugE protein  41.9 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590294  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1249  SMR family multidrug efflux pump  41.9 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1257  SMR family multidrug efflux pump  41.9 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303472  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0373  sugE protein  41.9 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0996  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.762024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0796  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  36.45 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  41.9 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  41.9 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1027  sugE protein  40.95 
 
 		 106 aa  67  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2158  small multidrug resistance protein  40.45 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2945  small multidrug resistance protein  36.45 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46208  normal  0.904124 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  39.62 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0285  integral membrane protein  38.32 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2320  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2198  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.177322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>