More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3765 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3765  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 112 aa  212  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3492  small multidrug resistance protein  80.36 
 
 		 125 aa  172  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2077  small multidrug resistance protein  63.73 
 
 		 119 aa  124  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0186  small multidrug resistance protein  59.81 
 
 		 109 aa  122  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1214  small multidrug resistance protein  55.66 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1231  small multidrug resistance protein  55.66 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1241  small multidrug resistance protein  51.89 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.948929  normal  0.303802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5269  small multidrug resistance protein  59.63 
 
 		 115 aa  115  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.493317  normal  0.542796 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1669  small multidrug resistance protein  55.77 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.187219  hitchhiker  0.00637066 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05170  cation/cationic drug transporter  58.82 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2448  small multidrug resistance protein  62.38 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2013  small multidrug resistance protein  58.42 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3160  small multidrug resistance protein  59.41 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5270  small multidrug resistance protein  58 
 
 		 104 aa  103  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01660  cation/cationic drug transporter  49.51 
 
 		 104 aa  103  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.199547 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1175  small multidrug resistance protein  56.6 
 
 		 140 aa  101  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0300462 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0442  small multidrug resistance protein  50.98 
 
 		 104 aa  90.9  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.608235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2887  small multidrug resistance protein  50.98 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0184367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9285  SugE protein  49.02 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1936  small multidrug resistance protein  62.12 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19750  cation/cationic drug transporter  49.02 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00047223  normal  0.0181194 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0979  small multidrug resistance protein  47.06 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1174  small multidrug resistance protein  49 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0293133 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3242  small multidrug resistance protein  56.52 
 
 		 107 aa  80.1  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.810706  normal  0.088661 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2478  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1352  small multidrug resistance protein  52.04 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0420  small multidrug resistance protein  48.98 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1773  DMT superfamily multidrug efflux pump  48.98 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.251074  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1394  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0455  multidrug resistance protein SugE, putative  50 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2122  small multidrug resistance protein  48.51 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0613848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  48.04 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3491  small multidrug resistance protein  45.71 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  43.56 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2170  small multidrug resistance protein  41 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3424  small multidrug resistance protein  49.5 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1878  small multidrug resistance protein  45.54 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337942  normal  0.058805 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  46.08 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0730  small multidrug resistance protein  45.19 
 
 		 107 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5069  small multidrug resistance protein  46.94 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3764  small multidrug resistance protein  53.66 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2430  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 		 108 aa  72  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5837  quaternary ammonium compound-resistance protein sugE  41.18 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0796  small multidrug resistance protein  48.54 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4125  small multidrug resistance protein  46.6 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2080  small multidrug resistance protein  43.56 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235888  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4255  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.956608  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  49.54 
 
 		 105 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  49.54 
 
 		 105 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  44 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  50 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  50 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  50 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1261  small multidrug resistance efflux protein  52.04 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.943877  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  50 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  50 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1276  small multidrug resistance protein  46.08 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  42.57 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  45.71 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  47.71 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3008  small multidrug resistance protein  42.99 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4068  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  41.58 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3796  small multidrug resistance protein  50.5 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.38629  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1005  sugE protein  42.31 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  37.38 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  41.58 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 105 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 105 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40170  putative transporter  45.71 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1298  small multidrug resistance protein  38.61 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  37.62 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  42.86 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  42.86 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3825  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  41.18 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4254  small multidrug resistance protein  41 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2526  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158974  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  36.54 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1397  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118337 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  45.28 
 
 		 105 aa  63.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1392  small multidrug resistance protein  48.48 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4409  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1672  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.737958  normal  0.915426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  42.16 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4387  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2608  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2158  small multidrug resistance protein  43.18 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0685  small multidrug resistance protein  46.97 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3195  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141243 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8958  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  41.58 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4003  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000483781  normal  0.0171041 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2945  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46208  normal  0.904124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>