More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1174 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1174  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 105 aa  194  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0293133 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5270  small multidrug resistance protein  61.54 
 
 		 104 aa  117  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3160  small multidrug resistance protein  56.31 
 
 		 104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05170  cation/cationic drug transporter  60.78 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2448  small multidrug resistance protein  55.34 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2077  small multidrug resistance protein  56 
 
 		 119 aa  104  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0186  small multidrug resistance protein  50.98 
 
 		 109 aa  102  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1241  small multidrug resistance protein  47.62 
 
 		 107 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.948929  normal  0.303802 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2013  small multidrug resistance protein  53.47 
 
 		 104 aa  98.2  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1214  small multidrug resistance protein  47.62 
 
 		 107 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1231  small multidrug resistance protein  47.62 
 
 		 107 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1669  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.187219  hitchhiker  0.00637066 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3491  small multidrug resistance protein  56.19 
 
 		 107 aa  93.6  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5269  small multidrug resistance protein  47.62 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.493317  normal  0.542796 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9285  SugE protein  50 
 
 		 104 aa  92  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01660  cation/cationic drug transporter  43.14 
 
 		 104 aa  90.9  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.199547 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0442  small multidrug resistance protein  49.02 
 
 		 104 aa  90.9  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.608235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4125  small multidrug resistance protein  49.02 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1352  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 104 aa  89.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3764  small multidrug resistance protein  57.14 
 
 		 107 aa  87.8  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1394  small multidrug resistance protein  48.04 
 
 		 104 aa  87.4  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5069  small multidrug resistance protein  45.71 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2887  small multidrug resistance protein  46.08 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0184367  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3242  small multidrug resistance protein  43.81 
 
 		 107 aa  84  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.810706  normal  0.088661 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  45.19 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  45.19 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3492  small multidrug resistance protein  47 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1175  small multidrug resistance protein  48.48 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0300462 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3765  small multidrug resistance protein  49 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1403  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0526825  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1936  small multidrug resistance protein  54.32 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5609  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.329891  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2305  small multidrug resistance protein  44.76 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1670  small multidrug resistance protein  44.76 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2282  small multidrug resistance protein  44.76 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  41.75 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19750  cation/cationic drug transporter  45.1 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00047223  normal  0.0181194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3008  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0773  sugE protein  40 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.757365  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1950  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.498297  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1298  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_004310  BR0780  sugE protein  39.05 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0996  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 106 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.762024  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  38.1 
 
 		 105 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 155 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  38.46 
 
 		 105 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2198  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  36.19 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  38.1 
 
 		 105 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2320  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0616  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.88639  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  38.46 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  38.46 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  38.46 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  38.46 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  38.46 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1276  small multidrug resistance protein  45.63 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  38.46 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  38.46 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0730  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.177322 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1392  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1672  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.737958  normal  0.915426 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1397  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118337 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0853  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  40.38 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5837  quaternary ammonium compound-resistance protein sugE  38.83 
 
 		 108 aa  70.1  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2515  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 105 aa  70.1  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.686448  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  40 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  37.5 
 
 		 105 aa  70.1  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0777  sugE protein  40 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590294  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1090  sugE protein  40 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1257  SMR family multidrug efflux pump  40 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303472  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0373  sugE protein  40 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1870  sugE protein  40 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.437905  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1399  suppresses groEL, may be chaperone  40 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1249  SMR family multidrug efflux pump  40 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2052  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712643 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3948  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2122  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0613848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0979  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1027  sugE protein  39.05 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  35.92 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  36.27 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  36.63 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2170  small multidrug resistance protein  37.14 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  36.63 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4387  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 106 aa  67  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>