More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1231 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_1231  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 107 aa  203  7e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1214  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 107 aa  203  7e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1241  small multidrug resistance protein  89.72 
 
 		 107 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.948929  normal  0.303802 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0186  small multidrug resistance protein  66.67 
 
 		 109 aa  143  9e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2448  small multidrug resistance protein  70.59 
 
 		 104 aa  142  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2077  small multidrug resistance protein  68.63 
 
 		 119 aa  138  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01660  cation/cationic drug transporter  62.14 
 
 		 104 aa  137  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.199547 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3160  small multidrug resistance protein  64.71 
 
 		 104 aa  134  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05170  cation/cationic drug transporter  62.14 
 
 		 104 aa  133  9e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1669  small multidrug resistance protein  59.43 
 
 		 107 aa  130  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.187219  hitchhiker  0.00637066 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2013  small multidrug resistance protein  61.76 
 
 		 104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3765  small multidrug resistance protein  55.66 
 
 		 112 aa  119  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5269  small multidrug resistance protein  53.33 
 
 		 115 aa  118  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.493317  normal  0.542796 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3492  small multidrug resistance protein  53.33 
 
 		 125 aa  116  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5270  small multidrug resistance protein  58.65 
 
 		 104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9285  SugE protein  53.92 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1394  small multidrug resistance protein  52.94 
 
 		 104 aa  107  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2887  small multidrug resistance protein  52.88 
 
 		 104 aa  107  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0184367  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1352  small multidrug resistance protein  53.92 
 
 		 104 aa  107  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1936  small multidrug resistance protein  59.77 
 
 		 104 aa  107  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3242  small multidrug resistance protein  53.27 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.810706  normal  0.088661 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0442  small multidrug resistance protein  52.43 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.608235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19750  cation/cationic drug transporter  51.92 
 
 		 105 aa  101  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00047223  normal  0.0181194 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4068  small multidrug resistance protein  45.79 
 
 		 111 aa  99.4  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0979  small multidrug resistance protein  49.53 
 
 		 107 aa  99.4  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  51.4 
 
 		 106 aa  97.8  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1174  small multidrug resistance protein  47.62 
 
 		 105 aa  96.3  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0293133 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  47.66 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1175  small multidrug resistance protein  48 
 
 		 140 aa  93.2  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0300462 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3491  small multidrug resistance protein  49.53 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  48.04 
 
 		 104 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4125  small multidrug resistance protein  49.51 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3764  small multidrug resistance protein  53.27 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  42.99 
 
 		 106 aa  90.9  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  45.54 
 
 		 104 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2430  small multidrug resistance protein  48.08 
 
 		 108 aa  90.5  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  46.08 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  46.53 
 
 		 105 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1261  small multidrug resistance efflux protein  53.85 
 
 		 104 aa  89.4  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.943877  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  45.54 
 
 		 105 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  45.71 
 
 		 105 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  45.71 
 
 		 105 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5069  small multidrug resistance protein  43.93 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3008  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 106 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  46.53 
 
 		 105 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3611  small multidrug resistance protein  42.45 
 
 		 106 aa  87  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  44.76 
 
 		 105 aa  87  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  44.76 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  44.76 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 104 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1298  small multidrug resistance protein  44.55 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  44.76 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1950  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.498297  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  44.76 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  44.76 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  44.76 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3646  small multidrug resistance protein  45.19 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2170  small multidrug resistance protein  42.99 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1878  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337942  normal  0.058805 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  42.86 
 
 		 105 aa  85.9  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4387  small multidrug resistance protein  46.15 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  46.67 
 
 		 105 aa  84.7  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4409  small multidrug resistance protein  46.15 
 
 		 106 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4254  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 106 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2080  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 104 aa  83.6  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235888  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  41.9 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  41.9 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  43.27 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1231  small multidrug resistance protein  39.25 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.7202 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  39.62 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0616  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.88639  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0455  multidrug resistance protein SugE, putative  43.27 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8958  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  41.12 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  45.79 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1403  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0526825  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2052  small multidrug resistance protein  45.79 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712643 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2526  small multidrug resistance protein  44.66 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158974  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  43.81 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3195  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141243 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0283  SugE protein  41.12 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0796  small multidrug resistance protein  46 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1870  sugE protein  43.4 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.437905  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1399  suppresses groEL, may be chaperone  43.4 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2235  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1773  DMT superfamily multidrug efflux pump  43 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.251074  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  38.68 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0373  sugE protein  43.4 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1257  SMR family multidrug efflux pump  43.4 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303472  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  40.78 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1090  sugE protein  43.4 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0420  small multidrug resistance protein  43 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>