293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_01660 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_01660  cation/cationic drug transporter  100 
 
 		 104 aa  197  6e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.199547 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1241  small multidrug resistance protein  63.11 
 
 		 107 aa  138  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.948929  normal  0.303802 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1214  small multidrug resistance protein  62.14 
 
 		 107 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1231  small multidrug resistance protein  62.14 
 
 		 107 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0186  small multidrug resistance protein  64.42 
 
 		 109 aa  137  4.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1669  small multidrug resistance protein  64.42 
 
 		 107 aa  137  7e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.187219  hitchhiker  0.00637066 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05170  cation/cationic drug transporter  60.58 
 
 		 104 aa  136  8.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2448  small multidrug resistance protein  64.42 
 
 		 104 aa  134  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3160  small multidrug resistance protein  59.62 
 
 		 104 aa  134  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2077  small multidrug resistance protein  58.65 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2013  small multidrug resistance protein  54.81 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19750  cation/cationic drug transporter  65.38 
 
 		 105 aa  114  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00047223  normal  0.0181194 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2887  small multidrug resistance protein  51.92 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0184367  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3492  small multidrug resistance protein  49.49 
 
 		 125 aa  106  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5270  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3765  small multidrug resistance protein  49.51 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5269  small multidrug resistance protein  49.51 
 
 		 115 aa  102  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.493317  normal  0.542796 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1352  small multidrug resistance protein  47.12 
 
 		 104 aa  94.7  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3491  small multidrug resistance protein  49.06 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1394  small multidrug resistance protein  45.19 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1175  small multidrug resistance protein  45.63 
 
 		 140 aa  92  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0300462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9285  SugE protein  49.04 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1174  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 105 aa  90.9  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0293133 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0442  small multidrug resistance protein  46.15 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.608235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3242  small multidrug resistance protein  52.94 
 
 		 107 aa  88.6  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.810706  normal  0.088661 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 		 106 aa  87.8  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3764  small multidrug resistance protein  49.06 
 
 		 107 aa  87.8  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4125  small multidrug resistance protein  45.19 
 
 		 104 aa  87  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5069  small multidrug resistance protein  47.06 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1936  small multidrug resistance protein  47.12 
 
 		 104 aa  84.3  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1403  small multidrug resistance protein  46.08 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0526825  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  44.12 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3008  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1298  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  42.16 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1261  small multidrug resistance efflux protein  46.15 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.943877  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  36.89 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  42.16 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  42.16 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  42.16 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  42.16 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  42.16 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0415  small multidrug resistance protein  43.81 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179992 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  42.16 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  42.16 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  42.16 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  43.69 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  42.16 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  42.16 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4387  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2122  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0613848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  39.42 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0685  small multidrug resistance protein  44.83 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  38.46 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  39.22 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0613  hypothetical protein  40.59 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0595  hypothetical protein  40.59 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1231  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.7202 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40170  putative transporter  44.32 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1950  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.498297  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  42.16 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  42.16 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5609  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.329891  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3825  small multidrug resistance protein  45.83 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  37.62 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4409  small multidrug resistance protein  42.16 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  42.16 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1670  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 106 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2305  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 106 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2282  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 106 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0616  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 105 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.88639  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0455  multidrug resistance protein SugE, putative  46.67 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4254  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  36.89 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0730  small multidrug resistance protein  38 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3312  small multidrug resistance protein  41.75 
 
 		 106 aa  72  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0627719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  38.83 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0600  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0589  small multidrug resistance protein  45.56 
 
 		 106 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4068  small multidrug resistance protein  41.41 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2170  small multidrug resistance protein  37.62 
 
 		 106 aa  72  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0996  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.762024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0979  small multidrug resistance protein  38.83 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2430  small multidrug resistance protein  40.78 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0796  small multidrug resistance protein  37 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  41.18 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  47.76 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  39.25 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2198  small multidrug resistance protein  38.38 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6417  small multidrug resistance protein  42.05 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2320  small multidrug resistance protein  38.38 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0853  small multidrug resistance protein  39.08 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  33.01 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>