More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3242 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3242  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 107 aa  201  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.810706  normal  0.088661 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4125  small multidrug resistance protein  68.63 
 
 		 104 aa  130  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9285  SugE protein  62.75 
 
 		 104 aa  128  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5069  small multidrug resistance protein  62.62 
 
 		 107 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1394  small multidrug resistance protein  60.78 
 
 		 104 aa  125  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1352  small multidrug resistance protein  61.76 
 
 		 104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0442  small multidrug resistance protein  57.84 
 
 		 104 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.608235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8958  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  56.07 
 
 		 107 aa  116  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1214  small multidrug resistance protein  53.27 
 
 		 107 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1231  small multidrug resistance protein  53.27 
 
 		 107 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3160  small multidrug resistance protein  55.34 
 
 		 104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1241  small multidrug resistance protein  49.53 
 
 		 107 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.948929  normal  0.303802 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  53.27 
 
 		 106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1936  small multidrug resistance protein  60.92 
 
 		 104 aa  108  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4068  small multidrug resistance protein  49.53 
 
 		 111 aa  107  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  52.43 
 
 		 104 aa  107  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  52.43 
 
 		 153 aa  107  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1669  small multidrug resistance protein  52.83 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.187219  hitchhiker  0.00637066 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1261  small multidrug resistance efflux protein  59.8 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.943877  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2887  small multidrug resistance protein  53.47 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0184367  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2448  small multidrug resistance protein  53.4 
 
 		 104 aa  105  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  51.96 
 
 		 107 aa  105  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2077  small multidrug resistance protein  55.88 
 
 		 119 aa  104  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0186  small multidrug resistance protein  52.94 
 
 		 109 aa  103  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  48.57 
 
 		 105 aa  102  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0979  small multidrug resistance protein  46.73 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01660  cation/cationic drug transporter  52.94 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.199547 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1298  small multidrug resistance protein  45.71 
 
 		 105 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1672  small multidrug resistance protein  46.67 
 
 		 106 aa  101  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.737958  normal  0.915426 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1397  small multidrug resistance protein  46.67 
 
 		 106 aa  101  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118337 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1403  small multidrug resistance protein  48.54 
 
 		 104 aa  100  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0526825  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  44.66 
 
 		 104 aa  100  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2013  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 104 aa  100  9e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1950  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.498297  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  49.02 
 
 		 104 aa  99.4  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  44.76 
 
 		 105 aa  99.4  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1392  small multidrug resistance protein  45.71 
 
 		 106 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  53.92 
 
 		 105 aa  99.4  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  46.6 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  47.57 
 
 		 146 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3796  small multidrug resistance protein  55.14 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.38629  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  47.57 
 
 		 146 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  45.71 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3008  small multidrug resistance protein  45.71 
 
 		 106 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  43.93 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  45.71 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  45.71 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  45.71 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  45.71 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  46.6 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  45.71 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  46.6 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  45.71 
 
 		 155 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  43.81 
 
 		 105 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2170  small multidrug resistance protein  46.73 
 
 		 106 aa  98.2  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  42.45 
 
 		 110 aa  98.2  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2305  small multidrug resistance protein  51.46 
 
 		 106 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5609  small multidrug resistance protein  49.51 
 
 		 134 aa  97.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.329891  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1670  small multidrug resistance protein  51.46 
 
 		 106 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 		 105 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2282  small multidrug resistance protein  51.46 
 
 		 106 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  43.69 
 
 		 104 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  43.69 
 
 		 104 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 		 105 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2430  small multidrug resistance protein  49.02 
 
 		 108 aa  97.4  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5269  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 115 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.493317  normal  0.542796 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1005  sugE protein  48.54 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1773  DMT superfamily multidrug efflux pump  49.5 
 
 		 104 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.251074  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0420  small multidrug resistance protein  49.5 
 
 		 104 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0613  hypothetical protein  48.51 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0595  hypothetical protein  48.51 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3903  small multidrug resistance protein  48.51 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0415  small multidrug resistance protein  43.52 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179992 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  48.04 
 
 		 105 aa  94.7  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  47.12 
 
 		 104 aa  94.7  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  46.08 
 
 		 105 aa  95.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2320  small multidrug resistance protein  48.57 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05170  cation/cationic drug transporter  50 
 
 		 104 aa  95.1  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0996  small multidrug resistance protein  47.57 
 
 		 106 aa  94.7  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.762024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2198  small multidrug resistance protein  48.57 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1870  sugE protein  49.06 
 
 		 106 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.437905  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1399  suppresses groEL, may be chaperone  49.06 
 
 		 106 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1249  SMR family multidrug efflux pump  49.06 
 
 		 106 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0773  sugE protein  46.67 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.757365  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  45.63 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1257  SMR family multidrug efflux pump  49.06 
 
 		 106 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303472  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0373  sugE protein  49.06 
 
 		 106 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0777  sugE protein  49.06 
 
 		 106 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590294  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1090  sugE protein  49.06 
 
 		 106 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 105 aa  94  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5270  small multidrug resistance protein  46.53 
 
 		 104 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  47.66 
 
 		 106 aa  93.6  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 		 106 aa  92.8  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0780  sugE protein  45.71 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1608  small multidrug resistance protein  52.81 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1683  small multidrug resistance protein  52.81 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.656055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0685  small multidrug resistance protein  44.76 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1878  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337942  normal  0.058805 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>