More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0442 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0442  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 104 aa  194  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.608235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9285  SugE protein  63.46 
 
 		 104 aa  142  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1394  small multidrug resistance protein  63.46 
 
 		 104 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1352  small multidrug resistance protein  62.5 
 
 		 104 aa  130  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4125  small multidrug resistance protein  65.38 
 
 		 104 aa  130  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2887  small multidrug resistance protein  63.46 
 
 		 104 aa  126  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0184367  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  57.28 
 
 		 107 aa  123  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3160  small multidrug resistance protein  58.65 
 
 		 104 aa  120  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2013  small multidrug resistance protein  58.65 
 
 		 104 aa  119  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1936  small multidrug resistance protein  62.5 
 
 		 104 aa  113  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2526  small multidrug resistance protein  55.34 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158974  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  53.92 
 
 		 106 aa  111  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  51.49 
 
 		 104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1261  small multidrug resistance efflux protein  59.62 
 
 		 104 aa  110  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.943877  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3242  small multidrug resistance protein  57.84 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.810706  normal  0.088661 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  52.94 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  50.98 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05170  cation/cationic drug transporter  53.85 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2080  small multidrug resistance protein  50.98 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235888  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  50.98 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2170  small multidrug resistance protein  51.49 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3646  small multidrug resistance protein  52.88 
 
 		 104 aa  109  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0979  small multidrug resistance protein  51.46 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1878  small multidrug resistance protein  50.98 
 
 		 104 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337942  normal  0.058805 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  49.51 
 
 		 104 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0455  multidrug resistance protein SugE, putative  54.81 
 
 		 105 aa  107  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2945  small multidrug resistance protein  51.96 
 
 		 104 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46208  normal  0.904124 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  51.96 
 
 		 106 aa  106  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  46.6 
 
 		 105 aa  105  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1669  small multidrug resistance protein  51.92 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.187219  hitchhiker  0.00637066 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4409  small multidrug resistance protein  52.94 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0186  small multidrug resistance protein  53.85 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  48.08 
 
 		 110 aa  105  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  53.92 
 
 		 104 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  53.92 
 
 		 106 aa  104  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  50.98 
 
 		 105 aa  104  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2448  small multidrug resistance protein  52.88 
 
 		 104 aa  104  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3195  small multidrug resistance protein  50.98 
 
 		 122 aa  104  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  49.04 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4387  small multidrug resistance protein  51.96 
 
 		 106 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  50.98 
 
 		 105 aa  102  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  50.98 
 
 		 155 aa  102  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  50.98 
 
 		 105 aa  102  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  50.98 
 
 		 105 aa  102  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  50.98 
 
 		 105 aa  102  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  50.98 
 
 		 105 aa  102  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  50.98 
 
 		 105 aa  102  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  50.98 
 
 		 105 aa  102  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5069  small multidrug resistance protein  55.88 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4254  small multidrug resistance protein  51.96 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  48.04 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1214  small multidrug resistance protein  52.43 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1231  small multidrug resistance protein  52.43 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  48.04 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2478  small multidrug resistance protein  54.46 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  47.06 
 
 		 105 aa  101  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  54.37 
 
 		 108 aa  100  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2430  small multidrug resistance protein  50.49 
 
 		 108 aa  100  6e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  46.15 
 
 		 104 aa  100  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3464  small multidrug resistance protein  51.96 
 
 		 116 aa  100  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.667657 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  48.08 
 
 		 104 aa  100  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2320  small multidrug resistance protein  49.04 
 
 		 106 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1241  small multidrug resistance protein  49.51 
 
 		 107 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.948929  normal  0.303802 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  47.52 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 105 aa  99.4  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  48.04 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3825  small multidrug resistance protein  50.98 
 
 		 106 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  47.52 
 
 		 105 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1950  small multidrug resistance protein  45.19 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.498297  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0420  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1773  DMT superfamily multidrug efflux pump  50 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.251074  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  46.53 
 
 		 105 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3611  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5270  small multidrug resistance protein  50.5 
 
 		 104 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  50.49 
 
 		 105 aa  98.6  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2077  small multidrug resistance protein  51.92 
 
 		 119 aa  99  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6417  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 106 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4068  small multidrug resistance protein  47.06 
 
 		 111 aa  98.6  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2659  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 130 aa  98.2  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  48.04 
 
 		 105 aa  97.8  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  47.52 
 
 		 105 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  45.19 
 
 		 106 aa  97.8  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  45.63 
 
 		 105 aa  97.8  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0415  small multidrug resistance protein  45.71 
 
 		 108 aa  97.4  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179992 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  48.04 
 
 		 106 aa  97.1  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2608  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 108 aa  97.1  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3008  small multidrug resistance protein  48.04 
 
 		 106 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3903  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 		 112 aa  96.7  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2235  small multidrug resistance protein  47.06 
 
 		 106 aa  96.7  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0730  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 107 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  47.06 
 
 		 106 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.177322 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5609  small multidrug resistance protein  48.04 
 
 		 134 aa  94.7  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.329891  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1276  small multidrug resistance protein  55 
 
 		 107 aa  94.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1670  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1298  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 		 105 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2305  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2282  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1231  small multidrug resistance protein  47.06 
 
 		 106 aa  94.4  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.7202 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2052  small multidrug resistance protein  49.02 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712643 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2158  small multidrug resistance protein  48.04 
 
 		 104 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>