More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3160 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3160  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 104 aa  197  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2448  small multidrug resistance protein  76.92 
 
 		 104 aa  157  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0186  small multidrug resistance protein  74.04 
 
 		 109 aa  155  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2013  small multidrug resistance protein  68.27 
 
 		 104 aa  146  9e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05170  cation/cationic drug transporter  70.19 
 
 		 104 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1669  small multidrug resistance protein  64.42 
 
 		 107 aa  140  8e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.187219  hitchhiker  0.00637066 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2077  small multidrug resistance protein  66.35 
 
 		 119 aa  136  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1231  small multidrug resistance protein  64.71 
 
 		 107 aa  134  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1214  small multidrug resistance protein  64.71 
 
 		 107 aa  134  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01660  cation/cationic drug transporter  59.62 
 
 		 104 aa  134  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.199547 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1241  small multidrug resistance protein  60.78 
 
 		 107 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.948929  normal  0.303802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5270  small multidrug resistance protein  66.34 
 
 		 104 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2887  small multidrug resistance protein  57.69 
 
 		 104 aa  128  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0184367  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0442  small multidrug resistance protein  58.65 
 
 		 104 aa  120  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.608235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5269  small multidrug resistance protein  58.82 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.493317  normal  0.542796 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1174  small multidrug resistance protein  56.31 
 
 		 105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0293133 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1394  small multidrug resistance protein  50.96 
 
 		 104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1352  small multidrug resistance protein  50.96 
 
 		 104 aa  110  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3492  small multidrug resistance protein  59.6 
 
 		 125 aa  110  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9285  SugE protein  52.88 
 
 		 104 aa  110  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4125  small multidrug resistance protein  56.73 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3765  small multidrug resistance protein  59.41 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19750  cation/cationic drug transporter  56.86 
 
 		 105 aa  106  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00047223  normal  0.0181194 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5069  small multidrug resistance protein  52.43 
 
 		 107 aa  103  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1175  small multidrug resistance protein  54.37 
 
 		 140 aa  101  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0300462 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3242  small multidrug resistance protein  55.34 
 
 		 107 aa  100  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.810706  normal  0.088661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1936  small multidrug resistance protein  68 
 
 		 104 aa  100  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  48.54 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  48.54 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  49.51 
 
 		 146 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  49.51 
 
 		 146 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  48.51 
 
 		 105 aa  96.7  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  48.04 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0796  small multidrug resistance protein  48.51 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  45.1 
 
 		 110 aa  94.4  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  47.57 
 
 		 105 aa  94  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  47.57 
 
 		 105 aa  94  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  47.57 
 
 		 105 aa  94  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  47.57 
 
 		 105 aa  94  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  45.1 
 
 		 106 aa  94  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  47.57 
 
 		 105 aa  94  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  47.57 
 
 		 105 aa  94  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  47.57 
 
 		 105 aa  94  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  47.57 
 
 		 105 aa  94  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  46.6 
 
 		 105 aa  94  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  47.57 
 
 		 155 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  44.66 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  47.06 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  49.02 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0773  sugE protein  45.19 
 
 		 105 aa  92  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.757365  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0780  sugE protein  44.23 
 
 		 105 aa  90.9  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3008  small multidrug resistance protein  46.15 
 
 		 106 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0979  small multidrug resistance protein  49.02 
 
 		 107 aa  90.1  8e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0415  small multidrug resistance protein  45.28 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179992 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  46.08 
 
 		 104 aa  90.1  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4068  small multidrug resistance protein  49.02 
 
 		 111 aa  89.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  49.02 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0730  small multidrug resistance protein  44.55 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2526  small multidrug resistance protein  48.04 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158974  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  44.23 
 
 		 104 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  46.53 
 
 		 104 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  46.15 
 
 		 106 aa  88.6  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0996  small multidrug resistance protein  47.12 
 
 		 106 aa  88.6  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.762024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3611  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 106 aa  88.2  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3764  small multidrug resistance protein  50.48 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  46.08 
 
 		 106 aa  88.2  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1261  small multidrug resistance efflux protein  48.51 
 
 		 104 aa  88.2  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.943877  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5609  small multidrug resistance protein  46.15 
 
 		 134 aa  87.8  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.329891  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1670  small multidrug resistance protein  48.08 
 
 		 106 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2305  small multidrug resistance protein  48.08 
 
 		 106 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  44.23 
 
 		 104 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2282  small multidrug resistance protein  48.08 
 
 		 106 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2198  small multidrug resistance protein  47.12 
 
 		 106 aa  87.4  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  45.54 
 
 		 104 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2320  small multidrug resistance protein  47.12 
 
 		 106 aa  87.4  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5065  small multidrug resistance protein  46.6 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.929302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2515  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.686448  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1950  small multidrug resistance protein  42.16 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.498297  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0853  small multidrug resistance protein  47.12 
 
 		 105 aa  87  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2052  small multidrug resistance protein  49.51 
 
 		 106 aa  87  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712643 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  41.75 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1231  small multidrug resistance protein  45.63 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.7202 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0600  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  45.1 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6417  small multidrug resistance protein  44.66 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  41.75 
 
 		 105 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  40.78 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3195  small multidrug resistance protein  44.55 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141243 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  46.6 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1298  small multidrug resistance protein  41.75 
 
 		 105 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1403  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0526825  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  45.1 
 
 		 106 aa  84.7  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1870  sugE protein  44.23 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.437905  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1399  suppresses groEL, may be chaperone  44.23 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1249  SMR family multidrug efflux pump  44.23 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1257  SMR family multidrug efflux pump  44.23 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303472  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0373  sugE protein  44.23 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0777  sugE protein  44.23 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>