More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3492 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3492  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 125 aa  239  9e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3765  small multidrug resistance protein  80.36 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2077  small multidrug resistance protein  64.36 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1241  small multidrug resistance protein  51.43 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.948929  normal  0.303802 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0186  small multidrug resistance protein  59.43 
 
 		 109 aa  117  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5269  small multidrug resistance protein  60.19 
 
 		 115 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.493317  normal  0.542796 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1669  small multidrug resistance protein  54.29 
 
 		 107 aa  117  6e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.187219  hitchhiker  0.00637066 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1214  small multidrug resistance protein  53.33 
 
 		 107 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1231  small multidrug resistance protein  53.33 
 
 		 107 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2013  small multidrug resistance protein  59.6 
 
 		 104 aa  110  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05170  cation/cationic drug transporter  58.59 
 
 		 104 aa  110  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1175  small multidrug resistance protein  51.22 
 
 		 140 aa  110  6e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0300462 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3160  small multidrug resistance protein  59.6 
 
 		 104 aa  110  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2448  small multidrug resistance protein  58.59 
 
 		 104 aa  107  7.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01660  cation/cationic drug transporter  49.49 
 
 		 104 aa  106  8.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.199547 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5270  small multidrug resistance protein  52.48 
 
 		 104 aa  100  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2887  small multidrug resistance protein  50.98 
 
 		 104 aa  89.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0184367  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0442  small multidrug resistance protein  49.5 
 
 		 104 aa  89.4  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.608235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3242  small multidrug resistance protein  61.76 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.810706  normal  0.088661 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9285  SugE protein  46.08 
 
 		 104 aa  84  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19750  cation/cationic drug transporter  47.06 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00047223  normal  0.0181194 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1352  small multidrug resistance protein  51.55 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1936  small multidrug resistance protein  63.08 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1174  small multidrug resistance protein  47 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0293133 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1394  small multidrug resistance protein  49.48 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3491  small multidrug resistance protein  46.08 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0979  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1773  DMT superfamily multidrug efflux pump  48.04 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.251074  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0420  small multidrug resistance protein  48.04 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0455  multidrug resistance protein SugE, putative  55.38 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3424  small multidrug resistance protein  45.1 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1261  small multidrug resistance efflux protein  51.55 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.943877  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  42 
 
 		 104 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  41.41 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3764  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4125  small multidrug resistance protein  46.08 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5069  small multidrug resistance protein  44.33 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  43.43 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2478  small multidrug resistance protein  46.46 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  43.43 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2122  small multidrug resistance protein  44.76 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0613848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2430  small multidrug resistance protein  40.4 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0613  hypothetical protein  40 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0595  hypothetical protein  40 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4068  small multidrug resistance protein  36.94 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1005  sugE protein  43.14 
 
 		 104 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4387  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  38.61 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4255  small multidrug resistance protein  39 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.956608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  38.38 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0730  small multidrug resistance protein  42.42 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1878  small multidrug resistance protein  40.4 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337942  normal  0.058805 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1298  small multidrug resistance protein  40.4 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4254  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  39.39 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  39.39 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  39.39 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1397  small multidrug resistance protein  53.85 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118337 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  39.39 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1672  small multidrug resistance protein  53.85 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.737958  normal  0.915426 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2170  small multidrug resistance protein  38 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1392  small multidrug resistance protein  52.31 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  40.4 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  41.41 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4409  small multidrug resistance protein  39 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5837  quaternary ammonium compound-resistance protein sugE  38.38 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 106 aa  67  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3008  small multidrug resistance protein  45.45 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2080  small multidrug resistance protein  38.38 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235888  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  39.39 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1950  small multidrug resistance protein  46.27 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.498297  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  40.4 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.177322 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0773  sugE protein  45.36 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.757365  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0796  small multidrug resistance protein  44 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  46.79 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  39.18 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3646  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8958  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  40.21 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0780  sugE protein  44.33 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  37.5 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  37.5 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2158  small multidrug resistance protein  44.83 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0853  small multidrug resistance protein  49.23 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  35.58 
 
 		 105 aa  62  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  44.33 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1676  small multidrug resistance protein  42.42 
 
 		 104 aa  62  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2945  small multidrug resistance protein  39.18 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46208  normal  0.904124 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1683  small multidrug resistance protein  42.42 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.656055  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1901  sugE protein  42.42 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0685  small multidrug resistance protein  47.69 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5609  small multidrug resistance protein  38.14 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.329891  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3312  small multidrug resistance protein  41.75 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0627719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  38.14 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1870  sugE protein  50 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.437905  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1257  SMR family multidrug efflux pump  50 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303472  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0616  small multidrug resistance protein  43.94 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.88639  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1090  sugE protein  50 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0777  sugE protein  50 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>