295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1175 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1175  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 140 aa  267  2.9999999999999997e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0300462 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2013  small multidrug resistance protein  58.25 
 
 		 104 aa  114  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2077  small multidrug resistance protein  55.34 
 
 		 119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3492  small multidrug resistance protein  51.22 
 
 		 125 aa  110  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0186  small multidrug resistance protein  59.22 
 
 		 109 aa  110  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5270  small multidrug resistance protein  53.4 
 
 		 104 aa  104  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1669  small multidrug resistance protein  49.04 
 
 		 107 aa  103  6e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.187219  hitchhiker  0.00637066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2448  small multidrug resistance protein  51.46 
 
 		 104 aa  103  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3160  small multidrug resistance protein  54.37 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3765  small multidrug resistance protein  56.6 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05170  cation/cationic drug transporter  52.43 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5269  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 115 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.493317  normal  0.542796 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2887  small multidrug resistance protein  51.46 
 
 		 104 aa  95.9  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0184367  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1214  small multidrug resistance protein  48 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1231  small multidrug resistance protein  48 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01660  cation/cationic drug transporter  45.63 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.199547 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1241  small multidrug resistance protein  45 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.948929  normal  0.303802 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1352  small multidrug resistance protein  46.6 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0442  small multidrug resistance protein  48.54 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.608235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19750  cation/cationic drug transporter  48.54 
 
 		 105 aa  83.6  9e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00047223  normal  0.0181194 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5609  small multidrug resistance protein  45 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.329891  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9285  SugE protein  45.63 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1394  small multidrug resistance protein  44.66 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1174  small multidrug resistance protein  48.48 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0293133 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0996  small multidrug resistance protein  46 
 
 		 106 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.762024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1670  small multidrug resistance protein  46 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2282  small multidrug resistance protein  46 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2305  small multidrug resistance protein  46 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4125  small multidrug resistance protein  47.57 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.177322 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1261  small multidrug resistance efflux protein  46.6 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.943877  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3491  small multidrug resistance protein  46.6 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  41.9 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8161  small multidrug resistance protein  38.98 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.32554 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2052  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712643 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  42.72 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2198  small multidrug resistance protein  42 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2320  small multidrug resistance protein  42 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0777  sugE protein  43.43 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590294  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1870  sugE protein  43.43 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.437905  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1399  suppresses groEL, may be chaperone  43.43 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1249  SMR family multidrug efflux pump  43.43 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0373  sugE protein  43.43 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1257  SMR family multidrug efflux pump  43.43 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303472  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1090  sugE protein  43.43 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1027  sugE protein  44.44 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7226  small multidrug resistance protein  42 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  42 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  44.25 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  44.25 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  42 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1936  small multidrug resistance protein  48.84 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  42.16 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  39.39 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  46.3 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3903  small multidrug resistance protein  35.45 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5069  small multidrug resistance protein  39 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3242  small multidrug resistance protein  55.07 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.810706  normal  0.088661 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  42 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0455  multidrug resistance protein SugE, putative  44 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  41.82 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3764  small multidrug resistance protein  44.66 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  39.81 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  42.59 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  39.81 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  42.16 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3312  small multidrug resistance protein  40.4 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0627719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2170  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  39.05 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3825  small multidrug resistance protein  40.57 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0773  sugE protein  38 
 
 		 105 aa  63.5  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.757365  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0100  sugE protein  37.37 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0780  sugE protein  37 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0570  small multidrug resistance protein  38 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  42.59 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  42.59 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  42.59 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  42.59 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  42.59 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  42.31 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  42.31 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0600  small multidrug resistance protein  46.97 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3424  small multidrug resistance protein  37.14 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1397  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118337 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4068  small multidrug resistance protein  40.4 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1672  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.737958  normal  0.915426 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2659  small multidrug resistance protein  39 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2320  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0415  small multidrug resistance protein  41.75 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179992 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3464  small multidrug resistance protein  37.86 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.667657 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  35.64 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2608  small multidrug resistance protein  38.68 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2515  small multidrug resistance protein  39 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.686448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>