More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3464 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3464  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 116 aa  223  7e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.667657 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2320  small multidrug resistance protein  59.8 
 
 		 106 aa  118  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  55.88 
 
 		 106 aa  113  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  53.92 
 
 		 105 aa  111  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3903  small multidrug resistance protein  51.92 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  53.92 
 
 		 106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  53.92 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  55.88 
 
 		 105 aa  107  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  54.9 
 
 		 104 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  54.9 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  51.96 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  53.4 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  52.94 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4068  small multidrug resistance protein  53.4 
 
 		 111 aa  104  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  52.94 
 
 		 105 aa  104  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2235  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 106 aa  104  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0455  multidrug resistance protein SugE, putative  55.34 
 
 		 105 aa  104  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04008  SugE  51.96 
 
 		 104 aa  103  9e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2608  small multidrug resistance protein  54.9 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  50.49 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  52.94 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  55.45 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  55 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  54 
 
 		 105 aa  101  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  55 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 105 aa  101  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2887  small multidrug resistance protein  53.92 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0184367  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 107 aa  100  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  52.94 
 
 		 153 aa  100  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0442  small multidrug resistance protein  51.96 
 
 		 104 aa  100  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.608235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2430  small multidrug resistance protein  50.96 
 
 		 108 aa  100  7e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2945  small multidrug resistance protein  54.9 
 
 		 104 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46208  normal  0.904124 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3195  small multidrug resistance protein  50.91 
 
 		 122 aa  100  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141243 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2526  small multidrug resistance protein  54.46 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158974  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  51.46 
 
 		 106 aa  99.4  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.177322 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5837  quaternary ammonium compound-resistance protein sugE  53.4 
 
 		 108 aa  98.6  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  50.49 
 
 		 106 aa  99.4  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1231  small multidrug resistance protein  54.37 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.7202 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40170  putative transporter  51.96 
 
 		 107 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3312  small multidrug resistance protein  55.34 
 
 		 106 aa  99.4  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0627719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  51 
 
 		 105 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  51 
 
 		 105 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  51 
 
 		 105 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  51 
 
 		 105 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  51 
 
 		 105 aa  97.8  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 105 aa  97.4  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  51 
 
 		 105 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  51 
 
 		 105 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  51 
 
 		 105 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4125  small multidrug resistance protein  51.96 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2198  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 106 aa  97.1  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2320  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 106 aa  97.1  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  48.11 
 
 		 108 aa  96.7  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  51 
 
 		 155 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0613  hypothetical protein  49.49 
 
 		 106 aa  96.3  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0595  hypothetical protein  49.49 
 
 		 106 aa  96.3  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2659  small multidrug resistance protein  50.96 
 
 		 130 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  52.43 
 
 		 106 aa  95.9  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1403  small multidrug resistance protein  46.6 
 
 		 104 aa  95.1  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0526825  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1965  small multidrug resistance protein  50.98 
 
 		 104 aa  95.1  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  50 
 
 		 107 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2052  small multidrug resistance protein  48.54 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712643 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0730  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1352  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 104 aa  94.4  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1027  sugE protein  51.96 
 
 		 106 aa  94  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1249  SMR family multidrug efflux pump  51.96 
 
 		 106 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0373  sugE protein  51.96 
 
 		 106 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1870  sugE protein  51.96 
 
 		 106 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.437905  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1399  suppresses groEL, may be chaperone  51.96 
 
 		 106 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1090  sugE protein  51.96 
 
 		 106 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0777  sugE protein  51.96 
 
 		 106 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590294  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1257  SMR family multidrug efflux pump  51.96 
 
 		 106 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303472  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1394  small multidrug resistance protein  49 
 
 		 104 aa  93.6  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  46.6 
 
 		 106 aa  93.6  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2170  small multidrug resistance protein  46.6 
 
 		 106 aa  93.6  9e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1670  small multidrug resistance protein  50.98 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  45.1 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2282  small multidrug resistance protein  50.98 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2305  small multidrug resistance protein  50.98 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4409  small multidrug resistance protein  49.04 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1276  small multidrug resistance protein  50.49 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0979  small multidrug resistance protein  48.54 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4387  small multidrug resistance protein  49.04 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0996  small multidrug resistance protein  49.02 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.762024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9285  SugE protein  47 
 
 		 104 aa  92  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3646  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0415  small multidrug resistance protein  48.57 
 
 		 108 aa  90.9  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0796  small multidrug resistance protein  47.52 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5609  small multidrug resistance protein  49.02 
 
 		 134 aa  90.9  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.329891  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1901  sugE protein  54.02 
 
 		 104 aa  90.5  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2650  small multidrug resistance protein  49.52 
 
 		 105 aa  90.1  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6417  small multidrug resistance protein  46.08 
 
 		 106 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0589  small multidrug resistance protein  51.46 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2013  small multidrug resistance protein  51.52 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1950  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 105 aa  89.4  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.498297  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1533  small multidrug resistance protein  52.87 
 
 		 104 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.447662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1261  small multidrug resistance efflux protein  46.74 
 
 		 104 aa  88.6  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.943877  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2970  small multidrug resistance protein  52.87 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.82632  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2843  small multidrug resistance protein  52.87 
 
 		 104 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1676  small multidrug resistance protein  51.72 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>