More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4003 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4003  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 109 aa  215  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000483781  normal  0.0171041 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5569  small multidrug resistance protein  70.64 
 
 		 109 aa  152  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10818  putative chaperone/membrane protein  70.37 
 
 		 108 aa  150  5e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.381879  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3295  small multidrug resistance protein  70.09 
 
 		 108 aa  148  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0285  integral membrane protein  68.22 
 
 		 108 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4255  small multidrug resistance protein  60.75 
 
 		 107 aa  120  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.956608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3424  small multidrug resistance protein  56.88 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0979  small multidrug resistance protein  48.6 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2122  small multidrug resistance protein  49.53 
 
 		 109 aa  90.9  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0613848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2170  small multidrug resistance protein  47.71 
 
 		 106 aa  87.8  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2430  small multidrug resistance protein  47.32 
 
 		 108 aa  87  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4068  small multidrug resistance protein  47.66 
 
 		 111 aa  87  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  48.15 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  42.2 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  46.79 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2887  small multidrug resistance protein  44.34 
 
 		 104 aa  83.6  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0184367  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  44.44 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  43.93 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  37.61 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2408  small multidrug resistance protein  44.76 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3195  small multidrug resistance protein  46.23 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141243 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  46.73 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5069  small multidrug resistance protein  43.81 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  45.79 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  44.86 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05170  cation/cationic drug transporter  43.4 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  45.79 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  43.81 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  40.74 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3160  small multidrug resistance protein  45.19 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2608  small multidrug resistance protein  43.64 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2320  small multidrug resistance protein  43.12 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1231  small multidrug resistance protein  42.2 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.7202 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0613  hypothetical protein  43.12 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0595  hypothetical protein  43.12 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0621  small multidrug resistance protein  41.96 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.852662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  42.99 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0730  small multidrug resistance protein  42.59 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  44.76 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1403  small multidrug resistance protein  43.75 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0526825  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0442  small multidrug resistance protein  40.57 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.608235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0796  small multidrug resistance protein  41.67 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3948  small multidrug resistance protein  38.53 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5837  quaternary ammonium compound-resistance protein sugE  40.37 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2945  small multidrug resistance protein  40.19 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46208  normal  0.904124 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  40.37 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  42.59 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3008  small multidrug resistance protein  39.45 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1298  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0113  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  41.44 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  44.76 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  44.76 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1965  small multidrug resistance protein  44.86 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  41.44 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  42.86 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1502  small multidrug resistance protein  42.45 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1669  small multidrug resistance protein  44.34 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.187219  hitchhiker  0.00637066 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5065  small multidrug resistance protein  39.25 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.929302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3903  small multidrug resistance protein  42.59 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4254  small multidrug resistance protein  39.25 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2526  small multidrug resistance protein  42.06 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158974  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  42.86 
 
 		 104 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3825  small multidrug resistance protein  46.79 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0325  SugE protein  42.06 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2515  small multidrug resistance protein  42.59 
 
 		 105 aa  72  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.686448  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  42.73 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.177322 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0616  small multidrug resistance protein  41.07 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.88639  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2905  small multidrug resistance protein  40.74 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0939249  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0780  sugE protein  41.82 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1510  small multidrug resistance protein  42.99 
 
 		 105 aa  72  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0711515  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  43.12 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2013  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04008  SugE  40.74 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2011  SugE protein  39.25 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4116  sugE protein  38.89 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4436  sugE protein  38.89 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  41.82 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1352  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3464  small multidrug resistance protein  36.45 
 
 		 116 aa  70.1  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.667657 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4409  small multidrug resistance protein  38.32 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2448  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1886  sugE protein  37.61 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4289  sugE protein  38.89 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.093578  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4325  sugE protein  38.89 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.80388  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3957  small multidrug resistance protein; quaternary ammonium compound-resistance protein  38.89 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0085456  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4233  sugE protein  38.89 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3968  small multidrug resistance protein; quaternary ammonium compound-resistance protein  38.89 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4344  sugE protein  38.89 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.970862  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2052  small multidrug resistance protein  42.73 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8958  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  38.1 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3646  small multidrug resistance protein  42.06 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4913  SugE protein  39.25 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  38.32 
 
 		 110 aa  70.1  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0908  sugE protein  38.89 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000097747  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>