266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1886 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1886  sugE protein  100 
 
 		 108 aa  209  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2904  small multidrug resistance protein  48.15 
 
 		 111 aa  99  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174839  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1073  small multidrug resistance protein  44.86 
 
 		 113 aa  98.6  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.15784e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4343  sugE protein  48.15 
 
 		 110 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4288  sugE protein  48.15 
 
 		 110 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.948578  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4115  sugE protein  48.15 
 
 		 110 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3956  small multidrug resistance protein  48.15 
 
 		 110 aa  95.9  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.193441  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3967  small multidrug resistance protein  48.15 
 
 		 110 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4232  sugE protein  48.15 
 
 		 110 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4324  sugE protein  47.22 
 
 		 110 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.80388  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4435  sugE protein  48.15 
 
 		 110 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.944937  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4068  small multidrug resistance protein  47.22 
 
 		 110 aa  95.5  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0909  sugE protein  48.15 
 
 		 110 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000446848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0324  SugE protein  47.57 
 
 		 231 aa  92  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4914  SugE protein  46.6 
 
 		 231 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0744  small multidrug resistance protein  40.19 
 
 		 118 aa  84.3  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  45.28 
 
 		 105 aa  84  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4447  putative sugE protein  43.52 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00163881  normal  0.507706 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0887  putative sugE protein  43.52 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.373229  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0925  sugE protein, putative  43.52 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0705375  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0792  sugE protein  42.59 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000018109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0741  quaternary ammonium compound-resistance protein  42.59 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00140212  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0728  quaternary ammonium compound-resistance protein  42.59 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00042757  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0832  sugE protein  42.59 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381598  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0927  putative sugE protein  42.59 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3479e-48 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0996  putative sugE protein  43.52 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000683055  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0107  small multidrug resistance protein  36.97 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.252801  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1403  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0526825  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10818  putative chaperone/membrane protein  39.81 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.381879  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  39.42 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2430  small multidrug resistance protein  39.25 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5569  small multidrug resistance protein  42.59 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2320  small multidrug resistance protein  41.51 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0730  small multidrug resistance protein  37.61 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  35.24 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1231  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.7202 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0796  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 107 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4255  small multidrug resistance protein  45.54 
 
 		 107 aa  73.6  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.956608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3295  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  37.74 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1352  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 		 104 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3464  small multidrug resistance protein  34.95 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.667657 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  35.24 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3195  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141243 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  35.24 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  35.24 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5837  quaternary ammonium compound-resistance protein sugE  36.89 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4068  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 		 111 aa  70.1  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  35.24 
 
 		 105 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  35.24 
 
 		 105 aa  70.1  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3424  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 		 106 aa  70.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4003  small multidrug resistance protein  37.61 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000483781  normal  0.0171041 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  35.24 
 
 		 105 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  35.24 
 
 		 105 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00178  putative exporter protein (SMR family)  35.58 
 
 		 105 aa  70.1  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  37.86 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  35.24 
 
 		 105 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  35.58 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0613  hypothetical protein  33.65 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0595  hypothetical protein  33.65 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1773  DMT superfamily multidrug efflux pump  43.69 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.251074  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1669  small multidrug resistance protein  40.19 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.187219  hitchhiker  0.00637066 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1027  sugE protein  37.5 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2170  small multidrug resistance protein  35.24 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0420  small multidrug resistance protein  43.69 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  37.38 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2198  small multidrug resistance protein  32.08 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  33.66 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2320  small multidrug resistance protein  32.08 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2235  small multidrug resistance protein  36.79 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1510  small multidrug resistance protein  35.58 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0711515  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0442  small multidrug resistance protein  35.29 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.608235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1394  small multidrug resistance protein  34.31 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1392  putative multidrug resistance protein, SMR family  39.51 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.464032  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1965  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000273  molecular chaperone SugE  38.46 
 
 		 104 aa  67  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 104 aa  66.6  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  35.24 
 
 		 107 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0996  small multidrug resistance protein  32.08 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.762024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1392  small multidrug resistance protein  33.02 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  36.54 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0285  integral membrane protein  37.5 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  34.29 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0616  small multidrug resistance protein  35.92 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.88639  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  38.68 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  33.33 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0979  small multidrug resistance protein  34.62 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1005  sugE protein  38.46 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  33.33 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.177322 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40170  putative transporter  35.45 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3160  small multidrug resistance protein  35.29 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2305  small multidrug resistance protein  32.08 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1870  sugE protein  33.65 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.437905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>