More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00178 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00178  putative exporter protein (SMR family)  100 
 
 		 105 aa  205  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1727  exporter protein  73.08 
 
 		 105 aa  152  1e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2011  SugE protein  68.57 
 
 		 105 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1510  small multidrug resistance protein  64.76 
 
 		 105 aa  142  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0711515  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0758  sugE protein  66.67 
 
 		 105 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.748062  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2960  SugE protein  75 
 
 		 84 aa  121  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0621  small multidrug resistance protein  52.78 
 
 		 111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.852662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  57.84 
 
 		 104 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0113  small multidrug resistance protein  55.24 
 
 		 105 aa  98.6  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  52.43 
 
 		 104 aa  97.1  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2526  small multidrug resistance protein  52.43 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158974  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  48.57 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  51.46 
 
 		 104 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  51.43 
 
 		 104 aa  94  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  51.92 
 
 		 153 aa  93.6  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  47.62 
 
 		 104 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  48.57 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  48.08 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  47.12 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  47.62 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  48.08 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  48.08 
 
 		 105 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3195  small multidrug resistance protein  49.02 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141243 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  49.51 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  47.57 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1298  small multidrug resistance protein  46.15 
 
 		 105 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4254  small multidrug resistance protein  49.51 
 
 		 106 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2478  small multidrug resistance protein  49.51 
 
 		 104 aa  88.2  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  49.04 
 
 		 105 aa  88.2  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  44.66 
 
 		 107 aa  87.4  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  48.54 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0853  small multidrug resistance protein  47.62 
 
 		 105 aa  86.7  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  46.6 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2052  small multidrug resistance protein  52.29 
 
 		 106 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712643 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  51.92 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4387  small multidrug resistance protein  48.54 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  49.52 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.177322 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1773  DMT superfamily multidrug efflux pump  47.06 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.251074  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4409  small multidrug resistance protein  48.54 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0420  small multidrug resistance protein  47.06 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  49.54 
 
 		 106 aa  85.5  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  46.15 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1670  small multidrug resistance protein  47.62 
 
 		 106 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2305  small multidrug resistance protein  47.62 
 
 		 106 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2282  small multidrug resistance protein  47.62 
 
 		 106 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  47.12 
 
 		 146 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0373  sugE protein  47.62 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1257  SMR family multidrug efflux pump  47.62 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303472  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1870  sugE protein  47.62 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.437905  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1399  suppresses groEL, may be chaperone  47.62 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  47.12 
 
 		 146 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0777  sugE protein  47.62 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590294  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1090  sugE protein  47.62 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1249  SMR family multidrug efflux pump  47.62 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6417  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 		 106 aa  84  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2945  small multidrug resistance protein  41.75 
 
 		 104 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46208  normal  0.904124 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  46.23 
 
 		 106 aa  83.6  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5837  quaternary ammonium compound-resistance protein sugE  47.22 
 
 		 108 aa  83.6  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3424  small multidrug resistance protein  45.71 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2080  small multidrug resistance protein  48.54 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235888  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5065  small multidrug resistance protein  44.76 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.929302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1027  sugE protein  46.67 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  49.02 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  46.15 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0442  small multidrug resistance protein  47.62 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.608235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04008  SugE  47.62 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1231  small multidrug resistance protein  45.19 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.7202 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0996  small multidrug resistance protein  45.71 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.762024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0796  small multidrug resistance protein  48.04 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1392  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2198  small multidrug resistance protein  45.71 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5609  small multidrug resistance protein  45.71 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.329891  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2320  small multidrug resistance protein  45.71 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40170  putative transporter  45.19 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1878  small multidrug resistance protein  47.57 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337942  normal  0.058805 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  43.27 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0730  small multidrug resistance protein  49.52 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1965  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0685  small multidrug resistance protein  43.81 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2320  small multidrug resistance protein  44.66 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2235  small multidrug resistance protein  46.6 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1672  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.737958  normal  0.915426 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1397  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118337 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  46.15 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  46.15 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  46.15 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  46.15 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  46.15 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  46.15 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  46.15 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  46.15 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2158  small multidrug resistance protein  44.76 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  46.6 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2170  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2659  small multidrug resistance protein  48.54 
 
 		 130 aa  80.1  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0773  sugE protein  42.86 
 
 		 105 aa  80.1  0.000000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.757365  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3646  small multidrug resistance protein  46.08 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0281  small multidrug resistance protein  45.71 
 
 		 105 aa  80.1  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3948  small multidrug resistance protein  44.76 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0616  small multidrug resistance protein  43.69 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.88639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>