More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2960 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2960  SugE protein  100 
 
 		 84 aa  166  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00178  putative exporter protein (SMR family)  75 
 
 		 105 aa  121  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1510  small multidrug resistance protein  65.48 
 
 		 105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0711515  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2011  SugE protein  64.29 
 
 		 105 aa  107  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0758  sugE protein  63.1 
 
 		 105 aa  106  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.748062  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1727  exporter protein  62.65 
 
 		 105 aa  102  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0621  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.852662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0113  small multidrug resistance protein  54.32 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  48 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  54.69 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2608  small multidrug resistance protein  52.56 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2080  small multidrug resistance protein  49.28 
 
 		 104 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235888  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1878  small multidrug resistance protein  49.28 
 
 		 104 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337942  normal  0.058805 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2320  small multidrug resistance protein  45 
 
 		 106 aa  67  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  50 
 
 		 104 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2198  small multidrug resistance protein  47.37 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  53.12 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  49.32 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2320  small multidrug resistance protein  47.37 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  45.07 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  46.05 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0780  sugE protein  50.79 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0730  small multidrug resistance protein  46.67 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2515  small multidrug resistance protein  46.48 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.686448  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  51.56 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0773  sugE protein  50.79 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.757365  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  47.37 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.177322 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2526  small multidrug resistance protein  53.45 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  48.33 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5065  small multidrug resistance protein  48.48 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.929302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2305  small multidrug resistance protein  53.33 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1670  small multidrug resistance protein  53.33 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2282  small multidrug resistance protein  53.33 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5837  quaternary ammonium compound-resistance protein sugE  45.33 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5609  small multidrug resistance protein  53.33 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.329891  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  44 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  47.37 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0996  small multidrug resistance protein  51.67 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.762024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0777  sugE protein  50 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590294  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  48.65 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1249  SMR family multidrug efflux pump  50 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0373  sugE protein  50 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1870  sugE protein  50 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.437905  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1399  suppresses groEL, may be chaperone  50 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  47.69 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1773  DMT superfamily multidrug efflux pump  50.85 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.251074  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1257  SMR family multidrug efflux pump  50 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303472  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1090  sugE protein  50 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0281  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0420  small multidrug resistance protein  50.85 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3195  small multidrug resistance protein  44.74 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141243 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2052  small multidrug resistance protein  52.63 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712643 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2478  small multidrug resistance protein  52.54 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3008  small multidrug resistance protein  39.47 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1392  small multidrug resistance protein  40.79 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  50.72 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0796  small multidrug resistance protein  45.33 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40170  putative transporter  42.67 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8958  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  43.37 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3464  small multidrug resistance protein  44.19 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.667657 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  45.95 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  44.07 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  43.84 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6417  small multidrug resistance protein  40.26 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  46.48 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  46.48 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  46.88 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0442  small multidrug resistance protein  49.28 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.608235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1298  small multidrug resistance protein  44.07 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2904  small multidrug resistance protein  42.5 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174839  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  44.07 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1672  small multidrug resistance protein  39.47 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.737958  normal  0.915426 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1397  small multidrug resistance protein  39.47 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118337 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2235  small multidrug resistance protein  45.95 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  46.97 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3903  small multidrug resistance protein  41.89 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1027  sugE protein  48.33 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4254  small multidrug resistance protein  53.45 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  44.07 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0685  small multidrug resistance protein  41.03 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2158  small multidrug resistance protein  41.33 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4125  small multidrug resistance protein  45.45 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  48.57 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2650  small multidrug resistance protein  51.67 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3825  small multidrug resistance protein  44.74 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  40.91 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3948  small multidrug resistance protein  44.93 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1352  small multidrug resistance protein  49.23 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2659  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9285  SugE protein  53.57 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4387  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1261  small multidrug resistance efflux protein  39.47 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.943877  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0616  small multidrug resistance protein  46.38 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.88639  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1965  small multidrug resistance protein  41.1 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2887  small multidrug resistance protein  53.57 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0184367  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3611  small multidrug resistance protein  46.43 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  46.58 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0853  small multidrug resistance protein  40.85 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>