More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1510 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1510  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 105 aa  200  7e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0711515  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00178  putative exporter protein (SMR family)  64.76 
 
 		 105 aa  142  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2011  SugE protein  67.62 
 
 		 105 aa  140  8e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0758  sugE protein  61.9 
 
 		 105 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.748062  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1727  exporter protein  58.65 
 
 		 105 aa  123  1e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2960  SugE protein  65.48 
 
 		 84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0621  small multidrug resistance protein  54.21 
 
 		 111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.852662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0113  small multidrug resistance protein  57.94 
 
 		 105 aa  104  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  50.49 
 
 		 104 aa  90.1  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2526  small multidrug resistance protein  49.51 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158974  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1397  small multidrug resistance protein  43.81 
 
 		 106 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1672  small multidrug resistance protein  43.81 
 
 		 106 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.737958  normal  0.915426 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  43.81 
 
 		 106 aa  87.8  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1392  small multidrug resistance protein  43.81 
 
 		 106 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  46.67 
 
 		 106 aa  86.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0853  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2052  small multidrug resistance protein  45.71 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712643 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4254  small multidrug resistance protein  45.19 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0773  sugE protein  45.71 
 
 		 105 aa  85.5  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.757365  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  50.49 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  44.66 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3825  small multidrug resistance protein  46.67 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0780  sugE protein  44.76 
 
 		 105 aa  84.3  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  43.69 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  46.67 
 
 		 106 aa  84  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.177322 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  45.71 
 
 		 104 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  47.17 
 
 		 104 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2198  small multidrug resistance protein  43.81 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  47.57 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  45.71 
 
 		 106 aa  83.6  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2320  small multidrug resistance protein  43.81 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4387  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  46.67 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  46.23 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2904  small multidrug resistance protein  45.1 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174839  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4015  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0216175  normal  0.030701 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  46.23 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  43.81 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40170  putative transporter  44.66 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3008  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1027  sugE protein  45.71 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1670  small multidrug resistance protein  43.81 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2282  small multidrug resistance protein  43.81 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2305  small multidrug resistance protein  43.81 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4409  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1870  sugE protein  42.86 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.437905  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1399  suppresses groEL, may be chaperone  42.86 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1231  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.7202 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0777  sugE protein  42.86 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590294  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0730  small multidrug resistance protein  47.06 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1090  sugE protein  42.86 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1249  SMR family multidrug efflux pump  42.86 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1257  SMR family multidrug efflux pump  42.86 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303472  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0373  sugE protein  42.86 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5837  quaternary ammonium compound-resistance protein sugE  47.57 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0996  small multidrug resistance protein  43.81 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.762024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 104 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04008  SugE  46.67 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0796  small multidrug resistance protein  45.1 
 
 		 107 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5609  small multidrug resistance protein  43.81 
 
 		 134 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.329891  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3424  small multidrug resistance protein  46.6 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4288  sugE protein  46.08 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.948578  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4115  sugE protein  46.08 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3956  small multidrug resistance protein  46.08 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.193441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4232  sugE protein  46.08 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4343  sugE protein  46.08 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4435  sugE protein  46.08 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.944937  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  46.6 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1878  small multidrug resistance protein  47.12 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337942  normal  0.058805 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0281  small multidrug resistance protein  44.76 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2515  small multidrug resistance protein  44.76 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.686448  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0616  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.88639  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  43.81 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0909  sugE protein  46.08 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000446848  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3967  small multidrug resistance protein  46.08 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  45.19 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2608  small multidrug resistance protein  48.11 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4324  sugE protein  46.08 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.80388  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4068  small multidrug resistance protein  46.08 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2478  small multidrug resistance protein  45.1 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0442  small multidrug resistance protein  45.79 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.608235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1212  small multidrug resistance protein  41.12 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0428006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0685  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0420  small multidrug resistance protein  44.55 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2235  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1773  DMT superfamily multidrug efflux pump  44.55 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.251074  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6417  small multidrug resistance protein  41.75 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2320  small multidrug resistance protein  43.81 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0100  sugE protein  37.86 
 
 		 114 aa  76.6  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4255  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.956608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1965  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5065  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.929302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2158  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3195  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141243 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2080  small multidrug resistance protein  45.19 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235888  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  41.75 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3948  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>