218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1073 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1073  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 113 aa  223  6e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.15784e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1886  sugE protein  44.86 
 
 		 108 aa  98.6  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2904  small multidrug resistance protein  47.62 
 
 		 111 aa  96.3  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3967  small multidrug resistance protein  47.17 
 
 		 110 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4115  sugE protein  46.67 
 
 		 110 aa  93.6  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3956  small multidrug resistance protein  46.67 
 
 		 110 aa  93.6  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.193441  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4435  sugE protein  46.67 
 
 		 110 aa  93.6  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.944937  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4232  sugE protein  46.67 
 
 		 110 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4288  sugE protein  46.67 
 
 		 110 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.948578  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4343  sugE protein  46.67 
 
 		 110 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4324  sugE protein  45.71 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.80388  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0909  sugE protein  45.71 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000446848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4068  small multidrug resistance protein  45.71 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0107  small multidrug resistance protein  37.1 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.252801  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0324  SugE protein  37.62 
 
 		 231 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0744  small multidrug resistance protein  38.53 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0613  hypothetical protein  37.86 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0595  hypothetical protein  37.86 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4914  SugE protein  35.78 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0979  small multidrug resistance protein  40.78 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1231  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.7202 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4447  putative sugE protein  36.04 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00163881  normal  0.507706 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0887  putative sugE protein  36.36 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.373229  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0792  sugE protein  37.27 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000018109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0741  quaternary ammonium compound-resistance protein  37.27 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00140212  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0927  putative sugE protein  37.27 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3479e-48 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0728  quaternary ammonium compound-resistance protein  37.27 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00042757  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0832  sugE protein  37.27 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381598  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5837  quaternary ammonium compound-resistance protein sugE  34.95 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0996  putative sugE protein  35.45 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000683055  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0925  sugE protein, putative  34.55 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0705375  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  38.38 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  38 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2430  small multidrug resistance protein  37.14 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4068  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1392  putative multidrug resistance protein, SMR family  37.97 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.464032  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  38.38 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3195  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141243 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0730  small multidrug resistance protein  34.31 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  38.38 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  32.71 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1950  small multidrug resistance protein  35 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.498297  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0100  sugE protein  30.36 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1502  small multidrug resistance protein  36.27 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0796  small multidrug resistance protein  35.29 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2235  small multidrug resistance protein  35.58 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1965  small multidrug resistance protein  34.34 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  37.37 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0332  SMR family multidrug efflux pump  35 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.887885  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  34.29 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  34.29 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  34.91 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  30.3 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0355  SMR family multidrug efflux pump  35 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4255  small multidrug resistance protein  34.91 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.956608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  33.64 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1403  small multidrug resistance protein  37 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0526825  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  33.65 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0600  small multidrug resistance protein  35.35 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1655  SMR family multidrug efflux pump  35 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0677066  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3424  small multidrug resistance protein  36.54 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  35.29 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10818  putative chaperone/membrane protein  32.08 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.381879  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  37.62 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1276  small multidrug resistance protein  35.64 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0616  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.88639  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  33.65 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3903  small multidrug resistance protein  32.69 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2170  small multidrug resistance protein  33.65 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5569  small multidrug resistance protein  33.96 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0415  small multidrug resistance protein  34.31 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4003  small multidrug resistance protein  34.91 
 
 		 109 aa  57  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000483781  normal  0.0171041 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  36.11 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  36.79 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  37.14 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  37.14 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  37.14 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  36 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  37.14 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  37.14 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  36.79 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  37.14 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3295  small multidrug resistance protein  33.02 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4125  small multidrug resistance protein  35.35 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  34.31 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1174  small multidrug resistance protein  32 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0293133 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  34 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3464  small multidrug resistance protein  34.29 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.667657 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1878  small multidrug resistance protein  36 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337942  normal  0.058805 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  35 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2320  small multidrug resistance protein  31.07 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2526  small multidrug resistance protein  33.66 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158974  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1510  small multidrug resistance protein  32 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0711515  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  28.16 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>