More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10818 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_10818  putative chaperone/membrane protein  100 
 
 		 108 aa  213  8e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.381879  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3295  small multidrug resistance protein  78.7 
 
 		 108 aa  171  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5569  small multidrug resistance protein  72.22 
 
 		 109 aa  159  9e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0285  integral membrane protein  69.44 
 
 		 108 aa  153  8e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4003  small multidrug resistance protein  70.37 
 
 		 109 aa  150  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000483781  normal  0.0171041 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4255  small multidrug resistance protein  60.75 
 
 		 107 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.956608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3424  small multidrug resistance protein  55.14 
 
 		 106 aa  122  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0979  small multidrug resistance protein  54.21 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2122  small multidrug resistance protein  47.22 
 
 		 109 aa  96.7  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0613848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2430  small multidrug resistance protein  51.4 
 
 		 108 aa  96.7  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4068  small multidrug resistance protein  50.47 
 
 		 111 aa  92.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  43.52 
 
 		 105 aa  85.9  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  46.15 
 
 		 106 aa  84.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1403  small multidrug resistance protein  45.79 
 
 		 104 aa  84  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0526825  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2170  small multidrug resistance protein  48.6 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0613  hypothetical protein  44.04 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0595  hypothetical protein  44.04 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  49.04 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3195  small multidrug resistance protein  43.93 
 
 		 122 aa  80.1  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141243 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1886  sugE protein  39.81 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0442  small multidrug resistance protein  45.19 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.608235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  42.99 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  38.89 
 
 		 106 aa  80.1  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05170  cation/cationic drug transporter  41.12 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1502  small multidrug resistance protein  44.34 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  44.86 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1965  small multidrug resistance protein  45.79 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  44.04 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0325  SugE protein  43.52 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  41.07 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1231  small multidrug resistance protein  42.06 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.7202 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  42.99 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  43.93 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  42.99 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2408  small multidrug resistance protein  45.28 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4913  SugE protein  41.67 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  43.93 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2945  small multidrug resistance protein  42.06 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46208  normal  0.904124 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  40.74 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  43.93 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  42.59 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  40.19 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1669  small multidrug resistance protein  40.74 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.187219  hitchhiker  0.00637066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5837  quaternary ammonium compound-resistance protein sugE  39.45 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  42.06 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2608  small multidrug resistance protein  41.53 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3160  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  40.74 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2515  small multidrug resistance protein  42.59 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.686448  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0780  sugE protein  42.2 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0324  SugE protein  41.75 
 
 		 231 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  40.74 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3464  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.667657 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5069  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1298  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1352  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 104 aa  72  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04008  SugE  39.81 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  39.81 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1394  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.609191 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2887  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0184367  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4254  small multidrug resistance protein  43.4 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0730  small multidrug resistance protein  38.83 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2904  small multidrug resistance protein  39.25 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174839  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  41.35 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  39.81 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  39.81 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  39.81 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  39.81 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  42.06 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  38.89 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  39.81 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00178  putative exporter protein (SMR family)  41.12 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0773  sugE protein  41.28 
 
 		 105 aa  70.1  0.000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.757365  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0909  sugE protein  39.81 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000446848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4068  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1878  small multidrug resistance protein  42.06 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337942  normal  0.058805 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4387  small multidrug resistance protein  43.4 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  42.59 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.177322 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4324  sugE protein  39.81 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.80388  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0621  small multidrug resistance protein  40.74 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.852662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2526  small multidrug resistance protein  42.99 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158974  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3601  SugE protein  43.93 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.51586  normal  0.208453 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2320  small multidrug resistance protein  40.74 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  41.35 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4409  small multidrug resistance protein  43.4 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1727  exporter protein  39.45 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2013  small multidrug resistance protein  37.14 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2052  small multidrug resistance protein  44.44 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712643 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  37.96 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  37.96 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2080  small multidrug resistance protein  41.12 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235888  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3967  small multidrug resistance protein  38.89 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8958  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  38.46 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>