More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2325 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_2325  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 107 aa  209  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1102  small multidrug resistance protein  47.17 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1719  small multidrug resistance protein  45.71 
 
 		 116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241026 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  47.62 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3077  small multidrug resistance protein  45.63 
 
 		 106 aa  103  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0360  multidrug resistance protein, Smr family  48.04 
 
 		 107 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0313  SMR family multidrug efflux pump  47.06 
 
 		 107 aa  100  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0296  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  47.06 
 
 		 107 aa  100  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0300  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  47.06 
 
 		 107 aa  100  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0328  SMR family multidrug efflux pump  47.06 
 
 		 107 aa  100  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0308  small multidrug resistance protein  47.06 
 
 		 107 aa  100  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4946  multidrug resistance protein, Smr family  47.06 
 
 		 107 aa  100  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0374  multidrug resistance protein, Smr family  47.06 
 
 		 107 aa  100  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0402  multidrug resistance protein, Smr family  47.06 
 
 		 107 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0151896  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0357  SMR family multidrug efflux pump  47.06 
 
 		 107 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1177  small multidrug resistance protein  46 
 
 		 109 aa  99  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000160416  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1095  SMR drug efflux transporter  42.86 
 
 		 108 aa  97.4  6e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.1863  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1863  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 123 aa  97.4  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  44.23 
 
 		 120 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  43.27 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  43.27 
 
 		 120 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  43.27 
 
 		 120 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  43.27 
 
 		 120 aa  93.6  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  43.27 
 
 		 120 aa  93.6  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0307  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 		 107 aa  89.4  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2083  small multidrug resistance protein  49.44 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000894022  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1319  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0145783  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4755  small multidrug resistance protein  37.14 
 
 		 136 aa  83.6  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.504307  normal  0.07446 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1476  SMR drug efflux transporter  39.25 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  40.95 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  40.95 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  38 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  35.24 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  35.24 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  37.14 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3071  small multidrug resistance protein  35.51 
 
 		 107 aa  73.6  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.425013  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2091  small multidrug resistance protein  39.53 
 
 		 100 aa  73.2  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.818483  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  36.17 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0828  small multidrug resistance protein  37.14 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.251219  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2502  quaternary ammonium efflux pump, 4 TMS small multidrug resistance (SMR) family, GacE  33.33 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85484  normal  0.536214 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  39 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1659  small multidrug resistance protein  34.29 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119593  normal  0.110471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4255  small multidrug resistance protein  33.66 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.956608  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  27.62 
 
 		 106 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0987  small multidrug resistance efflux protein  34.62 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25874  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4701  small multidrug resistance protein  31.43 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1884  small multidrug resistance protein  38.68 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1735  small multidrug resistance protein  32.38 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2122  small multidrug resistance protein  32.04 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0613848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1535  small multidrug resistance protein  29.52 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1079  small multidrug resistance protein  29.52 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1559  small multidrug resistance protein  29.52 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219332  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  30.39 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0281  small multidrug resistance protein  31.73 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1730  SMR family multidrug efflux pump  31.73 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2329  small multidrug resistance protein  34.12 
 
 		 110 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1245  SMR family multidrug efflux pump  31.73 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1815  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  31.73 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.701999  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0388  SMR family multidrug efflux pump  31.73 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1984  SMR family multidrug efflux pump  31.73 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0774  SMR family multidrug efflux pump  31.73 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15362  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1832  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  31.73 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.935098  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  32.35 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  29.81 
 
 		 105 aa  67  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2505  SMR family multidrug efflux pump  31.73 
 
 		 112 aa  67  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0730  small multidrug resistance protein  34.74 
 
 		 107 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1460  small multidrug resistance protein  30.48 
 
 		 112 aa  67  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1481  small multidrug resistance protein  30.48 
 
 		 112 aa  67  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545995  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1762  small multidrug resistance protein  34.29 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1583  SMR family multidrug efflux transporter  27.18 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.352831  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0616  small multidrug resistance protein  32.38 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.88639  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  30.48 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  32.04 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2692  small multidrug resistance protein  40.7 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0871  small multidrug resistance protein  32.35 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0339  small multidrug resistance protein  28.7 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  27.62 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4585  small multidrug resistance protein  38.27 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.631388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  27.62 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8958  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  30.77 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  26.47 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  26.92 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8161  small multidrug resistance protein  30.19 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.32554 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3009  small multidrug resistance protein  35.29 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1965  small multidrug resistance protein  32.69 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  31.07 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  28.57 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  27.62 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  27.62 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  30.39 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  27.62 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  27.62 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  27.62 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  27.45 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  27.62 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3195  small multidrug resistance protein  32.61 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141243 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1403  small multidrug resistance protein  31.73 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0526825  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1673  small multidrug resistance protein  28.85 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107144 
 
 
-
 
NC_004310  BR0780  sugE protein  30.77 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>