More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4585 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4585  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 110 aa  211  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.631388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  88.18 
 
 		 111 aa  192  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3289  small multidrug resistance protein  56.25 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  61.22 
 
 		 109 aa  117  7e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  61.22 
 
 		 109 aa  117  7e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  58.82 
 
 		 109 aa  114  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1535  small multidrug resistance protein  52.73 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4701  small multidrug resistance protein  52.73 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2505  SMR family multidrug efflux pump  52.73 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1079  small multidrug resistance protein  52.73 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1559  small multidrug resistance protein  52.73 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219332  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1088  small multidrug resistance protein  53.54 
 
 		 109 aa  110  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1673  small multidrug resistance protein  51.82 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107144 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  54.17 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1481  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  55.32 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1460  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2502  quaternary ammonium efflux pump, 4 TMS small multidrug resistance (SMR) family, GacE  50.96 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85484  normal  0.536214 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  54 
 
 		 110 aa  107  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  51.04 
 
 		 110 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  51.04 
 
 		 110 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3321  small multidrug resistance protein  53.06 
 
 		 111 aa  107  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00184251  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1815  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  48.18 
 
 		 112 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.701999  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1245  SMR family multidrug efflux pump  48.18 
 
 		 112 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1984  SMR family multidrug efflux pump  48.18 
 
 		 112 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0388  SMR family multidrug efflux pump  48.18 
 
 		 112 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1832  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  48.18 
 
 		 112 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.935098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0774  SMR family multidrug efflux pump  48.18 
 
 		 112 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15362  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1730  SMR family multidrug efflux pump  48.18 
 
 		 112 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  54.26 
 
 		 110 aa  105  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1659  small multidrug resistance protein  50.51 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119593  normal  0.110471 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1735  small multidrug resistance protein  50.96 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3008  small multidrug resistance protein  49.02 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  49.09 
 
 		 110 aa  105  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3466  small multidrug resistance protein  50.5 
 
 		 110 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  52.04 
 
 		 109 aa  104  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3259  small multidrug resistance protein  49.02 
 
 		 113 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  49.49 
 
 		 112 aa  102  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  46.08 
 
 		 109 aa  102  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  47.27 
 
 		 113 aa  101  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  51.06 
 
 		 110 aa  100  9e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  51.06 
 
 		 110 aa  100  9e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2208  quaternary ammonium compound-resistance protein  46.39 
 
 		 110 aa  99.8  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.831863  normal  0.342211 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1804  multidrug resistance protein, SMR family protein  46.39 
 
 		 110 aa  99.8  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1914  small multidrug resistance protein  46.39 
 
 		 110 aa  99.8  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2072  small multidrug resistance protein  44.44 
 
 		 114 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  46.39 
 
 		 116 aa  99  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0450  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 109 aa  98.2  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2364  small multidrug resistance protein  47.12 
 
 		 110 aa  98.6  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0731  small multidrug efflux pump  45.92 
 
 		 114 aa  98.2  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1769  small multidrug resistance protein  45 
 
 		 109 aa  97.8  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1638  efflux-multidrug resistance protein  50 
 
 		 109 aa  97.8  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.381762  hitchhiker  0.000000419533 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0871  small multidrug resistance protein  42.34 
 
 		 114 aa  97.8  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  45.36 
 
 		 110 aa  97.4  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0657  small multidrug resistance protein  45.05 
 
 		 113 aa  97.1  8e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4701  small multidrug resistance protein  48.42 
 
 		 111 aa  96.7  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1772  multidrug transporter EmrE  44.95 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.132035 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1835  multidrug transporter EmrE  44.95 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.997367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1684  multidrug transporter EmrE  44.95 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487331  normal  0.0413845 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1884  small multidrug resistance protein  55.1 
 
 		 107 aa  96.3  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1774  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  44.95 
 
 		 112 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324074  normal  0.0937038 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38630  cation/cationic drug transporter  50 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1501  multidrug transporter EmrE  44.04 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21028  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2603  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 		 110 aa  94.7  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0828  small multidrug resistance protein  44.9 
 
 		 109 aa  94.7  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.251219  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  47.87 
 
 		 110 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3009  small multidrug resistance protein  48.96 
 
 		 109 aa  93.6  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02486  hypothetical protein  42.55 
 
 		 117 aa  93.6  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  47.96 
 
 		 109 aa  92.8  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1826  small multidrug resistance protein  45.83 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal  0.470725 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003631  quaternary ammonium compound-resistance protein  41.49 
 
 		 118 aa  91.7  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1576  small multidrug resistance protein  46.59 
 
 		 110 aa  91.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.554715  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1319  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0145783  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2350  putative methyl viologen/ethidium resistance transmembrane protein  44.04 
 
 		 114 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000392235  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  46.53 
 
 		 106 aa  90.9  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5493  small multidrug resistance protein  42 
 
 		 114 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.659529  normal  0.39797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1762  small multidrug resistance protein  50.5 
 
 		 108 aa  90.1  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0798  SMR family multidrug efflux transporter  48.98 
 
 		 108 aa  88.6  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.621925  normal  0.0234862 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0150  quaternary ammonium compound-resistance protein QacEdelta1  47.47 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.928712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0536  small multidrug resistance protein  42.11 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568122  normal  0.0651219 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2543  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 109 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544067  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1584  multidrug efflux protein  47.47 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.339035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1234  small multidrug resistance protein  43.56 
 
 		 113 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1102  small multidrug resistance protein  50.56 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2205  small multidrug resistance protein  51.02 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0437  small multidrug resistance protein  44.21 
 
 		 113 aa  88.2  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.453624  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1973  small multidrug resistance protein  52.63 
 
 		 109 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  43.88 
 
 		 110 aa  87.4  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0488  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 110 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0280081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4979  small multidrug resistance protein  41.05 
 
 		 110 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.174415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  44.21 
 
 		 111 aa  86.7  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4930  small multidrug resistance protein  41.05 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.984602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4802  small multidrug resistance protein  40.21 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.123188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1196  small multidrug resistance protein  46.88 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0613  small multidrug resistance protein  42.53 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.375677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1863  small multidrug resistance protein  40.4 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2410  small multidrug resistance protein  42.06 
 
 		 111 aa  85.5  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1177  small multidrug resistance protein  42.27 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000160416  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2887  small multidrug resistance protein  54.79 
 
 		 110 aa  84.7  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.014423 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3077  small multidrug resistance protein  42.16 
 
 		 106 aa  85.5  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>