More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2410 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2410  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 111 aa  214  4e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2505  SMR family multidrug efflux pump  52.58 
 
 		 112 aa  93.6  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  48.11 
 
 		 110 aa  90.5  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  48.11 
 
 		 110 aa  90.5  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1245  SMR family multidrug efflux pump  50.52 
 
 		 112 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0774  SMR family multidrug efflux pump  50.52 
 
 		 112 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15362  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1832  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  50.52 
 
 		 112 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.935098  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1984  SMR family multidrug efflux pump  50.52 
 
 		 112 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0388  SMR family multidrug efflux pump  50.52 
 
 		 112 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1730  SMR family multidrug efflux pump  50.52 
 
 		 112 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1815  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  50.52 
 
 		 112 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.701999  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1914  small multidrug resistance protein  45.54 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1804  multidrug resistance protein, SMR family protein  45.54 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2208  quaternary ammonium compound-resistance protein  45.54 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.831863  normal  0.342211 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3321  small multidrug resistance protein  46.6 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00184251  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  45.28 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  42.99 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4701  small multidrug resistance protein  48.45 
 
 		 112 aa  84  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  45.19 
 
 		 109 aa  83.6  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  45.19 
 
 		 109 aa  83.6  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1088  small multidrug resistance protein  43.62 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1535  small multidrug resistance protein  48.45 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  43.24 
 
 		 116 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1079  small multidrug resistance protein  48.45 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  45.45 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1559  small multidrug resistance protein  48.45 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219332  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1673  small multidrug resistance protein  47.42 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107144 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4930  small multidrug resistance protein  47.12 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.984602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4802  small multidrug resistance protein  47.12 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.123188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0488  small multidrug resistance protein  43.12 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0280081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  46.08 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2502  quaternary ammonium efflux pump, 4 TMS small multidrug resistance (SMR) family, GacE  45.71 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85484  normal  0.536214 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2603  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2364  small multidrug resistance protein  47.17 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0536  small multidrug resistance protein  47.12 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568122  normal  0.0651219 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4979  small multidrug resistance protein  47.12 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.174415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1481  small multidrug resistance protein  46.39 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0828  small multidrug resistance protein  42.45 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.251219  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3008  small multidrug resistance protein  44.25 
 
 		 113 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1772  multidrug transporter EmrE  41.96 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.132035 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1835  multidrug transporter EmrE  41.96 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.997367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1460  small multidrug resistance protein  46.39 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1684  multidrug transporter EmrE  41.96 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487331  normal  0.0413845 
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  43.81 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  47.96 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  43.69 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3259  small multidrug resistance protein  44.25 
 
 		 113 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  43.81 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2946  small multidrug resistance protein  45.28 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1774  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  41.96 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324074  normal  0.0937038 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1501  multidrug transporter EmrE  41.07 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21028  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1735  small multidrug resistance protein  44.9 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1659  small multidrug resistance protein  44.44 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119593  normal  0.110471 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3289  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2543  small multidrug resistance protein  43.81 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544067  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0613  small multidrug resistance protein  45.16 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.375677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0437  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.453624  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  41.51 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1769  small multidrug resistance protein  41.24 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1884  small multidrug resistance protein  46.81 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02486  hypothetical protein  38.74 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4585  small multidrug resistance protein  48.1 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.631388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  41.24 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0541  small multidrug resistance protein  37.61 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.730216  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4701  small multidrug resistance protein  41.51 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4979  multidrug resistance protein  37.61 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 113 aa  73.6  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1234  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4976  small multidrug resistance protein  38.68 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0616597 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1576  small multidrug resistance protein  43.01 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.554715  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1437  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1826  small multidrug resistance protein  43.3 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal  0.470725 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003631  quaternary ammonium compound-resistance protein  38.74 
 
 		 118 aa  72  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  40.4 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0271  small multidrug resistance protein  34.29 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  42 
 
 		 109 aa  72  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0450  small multidrug resistance protein  41.24 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3425  small multidrug resistance protein  34.29 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681644  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0627  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0987  small multidrug resistance efflux protein  45 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25874  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0159  multidrug efflux transporter  33.33 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0763675  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  41.58 
 
 		 110 aa  70.1  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65990  SMR multidrug efflux transporter  43.01 
 
 		 110 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00317706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4225  small multidrug resistance protein  35.24 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.023296 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2887  small multidrug resistance protein  48.72 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.014423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5725  SMR multidrug efflux transporter  41.94 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2896  small multidrug resistance protein  42.45 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4755  small multidrug resistance protein  42.42 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.504307  normal  0.07446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2866  small multidrug resistance protein  42.45 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1319  small multidrug resistance protein  42.16 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0145783  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0986  small multidrug resistance protein  43.4 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2910  small multidrug resistance protein  42.45 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240481  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  37.37 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0377  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1973  small multidrug resistance protein  47.47 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  35.92 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  35.92 
 
 		 120 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>