More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3353 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 106 aa  202  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  52.88 
 
 		 120 aa  110  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  52.88 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  52.88 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  51.92 
 
 		 120 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0374  multidrug resistance protein, Smr family  52.94 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4946  multidrug resistance protein, Smr family  52.94 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0307  small multidrug resistance protein  51.96 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0402  multidrug resistance protein, Smr family  52.94 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0151896  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0308  small multidrug resistance protein  52.94 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0360  multidrug resistance protein, Smr family  52.94 
 
 		 107 aa  107  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0357  SMR family multidrug efflux pump  51.96 
 
 		 107 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0313  SMR family multidrug efflux pump  52.94 
 
 		 107 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0296  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  52.94 
 
 		 107 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0300  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  52.94 
 
 		 107 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0328  SMR family multidrug efflux pump  52.94 
 
 		 107 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  50.96 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  50.96 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2325  small multidrug resistance protein  47.62 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3077  small multidrug resistance protein  51.61 
 
 		 106 aa  104  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2083  small multidrug resistance protein  56.86 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000894022  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1863  small multidrug resistance protein  46.23 
 
 		 123 aa  102  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1719  small multidrug resistance protein  49.04 
 
 		 116 aa  100  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241026 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4755  small multidrug resistance protein  49.06 
 
 		 136 aa  99  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.504307  normal  0.07446 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1095  SMR drug efflux transporter  50.98 
 
 		 108 aa  97.8  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.1863  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1102  small multidrug resistance protein  47.06 
 
 		 107 aa  97.4  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  51.43 
 
 		 109 aa  97.4  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 113 aa  97.1  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1177  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 109 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000160416  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4701  small multidrug resistance protein  50.49 
 
 		 112 aa  96.7  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1535  small multidrug resistance protein  48.54 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  50.49 
 
 		 109 aa  95.5  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  43.4 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1079  small multidrug resistance protein  48.54 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1559  small multidrug resistance protein  48.54 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219332  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  43.4 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1735  small multidrug resistance protein  48.45 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1319  small multidrug resistance protein  51.96 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0145783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1832  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  49.51 
 
 		 112 aa  94.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.935098  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1245  SMR family multidrug efflux pump  49.51 
 
 		 112 aa  94.4  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1984  SMR family multidrug efflux pump  49.51 
 
 		 112 aa  94.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1730  SMR family multidrug efflux pump  49.51 
 
 		 112 aa  94.4  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1815  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  49.51 
 
 		 112 aa  94.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.701999  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1481  small multidrug resistance protein  48.54 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0388  SMR family multidrug efflux pump  49.51 
 
 		 112 aa  94.4  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0774  SMR family multidrug efflux pump  49.51 
 
 		 112 aa  94.4  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15362  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1460  small multidrug resistance protein  48.54 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  48.54 
 
 		 111 aa  93.6  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  50.52 
 
 		 110 aa  93.6  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  51.55 
 
 		 110 aa  93.6  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  50.52 
 
 		 110 aa  93.6  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3228  multidrug efflux protein  50 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0308245  hitchhiker  0.000780201 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3008  small multidrug resistance protein  49 
 
 		 113 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1673  small multidrug resistance protein  46.6 
 
 		 112 aa  92.8  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107144 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1769  small multidrug resistance protein  50.48 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1603  multidrug efflux protein  50.96 
 
 		 110 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352426 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1659  small multidrug resistance protein  48.54 
 
 		 112 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119593  normal  0.110471 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0813  multidrug efflux protein  50 
 
 		 110 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.109831  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2036  multidrug efflux protein  50 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  45.28 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  47.12 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  52.94 
 
 		 110 aa  91.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3259  small multidrug resistance protein  48 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0657  small multidrug resistance protein  50.5 
 
 		 113 aa  90.9  5e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  48.08 
 
 		 116 aa  90.5  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2502  quaternary ammonium efflux pump, 4 TMS small multidrug resistance (SMR) family, GacE  43.3 
 
 		 112 aa  90.5  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85484  normal  0.536214 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  46.6 
 
 		 110 aa  90.5  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  46.6 
 
 		 110 aa  90.5  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00493  multidrug efflux protein  49.04 
 
 		 110 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00498  hypothetical protein  49.04 
 
 		 110 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95244  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2603  small multidrug resistance protein  48.45 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0450  small multidrug resistance protein  49.52 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 105 aa  89.7  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2505  SMR family multidrug efflux pump  43.69 
 
 		 112 aa  88.6  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  44.34 
 
 		 109 aa  88.2  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  43.81 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 109 aa  88.2  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  43.4 
 
 		 106 aa  88.2  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 104 aa  87.8  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0871  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 114 aa  87.8  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2946  small multidrug resistance protein  49.06 
 
 		 109 aa  87.8  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0987  small multidrug resistance efflux protein  46.6 
 
 		 107 aa  87.8  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25874  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2887  small multidrug resistance protein  48.54 
 
 		 110 aa  87.4  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.014423 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2091  small multidrug resistance protein  51.85 
 
 		 100 aa  87  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.818483  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3195  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 122 aa  87  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141243 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 104 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0828  small multidrug resistance protein  44.76 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.251219  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8958  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  44.12 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  49.48 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1476  SMR drug efflux transporter  44.34 
 
 		 108 aa  85.9  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3009  small multidrug resistance protein  49.06 
 
 		 109 aa  85.5  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 105 aa  85.9  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  45.71 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  45.19 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2364  small multidrug resistance protein  44.66 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0339  small multidrug resistance protein  44.76 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3289  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 126 aa  84.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 105 aa  84.7  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 		 105 aa  84.3  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 104 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>