More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_0307 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_0307  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 107 aa  204  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0357  SMR family multidrug efflux pump  91.59 
 
 		 107 aa  186  8e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0374  multidrug resistance protein, Smr family  90.65 
 
 		 107 aa  184  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4946  multidrug resistance protein, Smr family  90.65 
 
 		 107 aa  184  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0402  multidrug resistance protein, Smr family  89.72 
 
 		 107 aa  184  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0151896  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0308  small multidrug resistance protein  88.79 
 
 		 107 aa  181  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0313  SMR family multidrug efflux pump  89.72 
 
 		 107 aa  179  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0296  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  89.72 
 
 		 107 aa  179  8.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0300  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  89.72 
 
 		 107 aa  179  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0328  SMR family multidrug efflux pump  89.72 
 
 		 107 aa  179  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0360  multidrug resistance protein, Smr family  88.79 
 
 		 107 aa  179  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  51.96 
 
 		 106 aa  108  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  49.51 
 
 		 120 aa  102  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  49.51 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  49.02 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  49.02 
 
 		 120 aa  100  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  48.04 
 
 		 120 aa  98.6  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  48.04 
 
 		 120 aa  98.6  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1863  small multidrug resistance protein  44.66 
 
 		 123 aa  94.4  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3077  small multidrug resistance protein  44.79 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1719  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 116 aa  91.7  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241026 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1095  SMR drug efflux transporter  44.23 
 
 		 108 aa  92  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.1863  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1102  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 		 107 aa  90.5  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2325  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 		 107 aa  89.4  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2091  small multidrug resistance protein  44.09 
 
 		 100 aa  89  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.818483  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1177  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 109 aa  88.2  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000160416  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2083  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000894022  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 109 aa  84  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4755  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 136 aa  84  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.504307  normal  0.07446 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1319  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 106 aa  84  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0145783  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  41.12 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0987  small multidrug resistance efflux protein  35.85 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25874  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  40.62 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1476  SMR drug efflux transporter  38.46 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2887  small multidrug resistance protein  39.53 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.014423 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  37.86 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0996  small multidrug resistance protein  35.85 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.762024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  34.74 
 
 		 111 aa  72  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5609  small multidrug resistance protein  35.92 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.329891  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2198  small multidrug resistance protein  36.19 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2320  small multidrug resistance protein  36.19 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1583  SMR family multidrug efflux transporter  36.46 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.352831  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  36.89 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1276  small multidrug resistance protein  32.08 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  31.78 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  31.78 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  35.51 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0150  quaternary ammonium compound-resistance protein QacEdelta1  39.53 
 
 		 115 aa  70.1  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.928712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1249  SMR family multidrug efflux pump  36.89 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  38.78 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1870  sugE protein  36.89 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.437905  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0373  sugE protein  36.89 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1399  suppresses groEL, may be chaperone  36.89 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0777  sugE protein  36.89 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590294  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1257  SMR family multidrug efflux pump  36.89 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303472  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1090  sugE protein  36.89 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1584  multidrug efflux protein  39.53 
 
 		 153 aa  70.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.339035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  35 
 
 		 108 aa  70.1  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  34.58 
 
 		 110 aa  70.1  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2305  small multidrug resistance protein  33.02 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  32.35 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0798  SMR family multidrug efflux transporter  35.42 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.621925  normal  0.0234862 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1670  small multidrug resistance protein  33.02 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2282  small multidrug resistance protein  33.02 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5837  quaternary ammonium compound-resistance protein sugE  29.25 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  33.01 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  33 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1403  small multidrug resistance protein  32.35 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0526825  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2052  small multidrug resistance protein  33.98 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712643 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2692  small multidrug resistance protein  42.17 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  30 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  36.36 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  32 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3008  small multidrug resistance protein  37.23 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  33.98 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.177322 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  33.01 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1762  small multidrug resistance protein  36.79 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1914  small multidrug resistance protein  36.63 
 
 		 110 aa  67  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  32.04 
 
 		 106 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1804  multidrug resistance protein, SMR family protein  36.63 
 
 		 110 aa  67  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4585  small multidrug resistance protein  37.97 
 
 		 110 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.631388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2208  quaternary ammonium compound-resistance protein  36.63 
 
 		 110 aa  67  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.831863  normal  0.342211 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1659  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 112 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119593  normal  0.110471 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0730  small multidrug resistance protein  31.43 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  34.34 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  33.67 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  33.33 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3259  small multidrug resistance protein  36.17 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  33.64 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  32.04 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2329  small multidrug resistance protein  34.52 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  33.64 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  32.04 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  32.04 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3195  small multidrug resistance protein  32 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1298  small multidrug resistance protein  32.04 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1027  sugE protein  33.98 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>