More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3077 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3077  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 106 aa  207  6e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1102  small multidrug resistance protein  56.12 
 
 		 107 aa  122  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1863  small multidrug resistance protein  53.06 
 
 		 123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2091  small multidrug resistance protein  54.55 
 
 		 100 aa  108  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.818483  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  51.02 
 
 		 120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1095  SMR drug efflux transporter  51.02 
 
 		 108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.1863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  52.04 
 
 		 120 aa  107  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  51.02 
 
 		 120 aa  107  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  52.04 
 
 		 120 aa  106  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  50 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  50 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  51.61 
 
 		 106 aa  104  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2325  small multidrug resistance protein  45.63 
 
 		 107 aa  103  8e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1719  small multidrug resistance protein  44.33 
 
 		 116 aa  103  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241026 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1177  small multidrug resistance protein  49.51 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000160416  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0308  small multidrug resistance protein  47.92 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0374  multidrug resistance protein, Smr family  47.92 
 
 		 107 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0402  multidrug resistance protein, Smr family  47.92 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0151896  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1476  SMR drug efflux transporter  53.06 
 
 		 108 aa  98.2  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4946  multidrug resistance protein, Smr family  47.92 
 
 		 107 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0313  SMR family multidrug efflux pump  47.92 
 
 		 107 aa  98.2  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0296  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  47.92 
 
 		 107 aa  98.2  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0300  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  47.92 
 
 		 107 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0328  SMR family multidrug efflux pump  47.92 
 
 		 107 aa  98.2  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0360  multidrug resistance protein, Smr family  46.88 
 
 		 107 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0357  SMR family multidrug efflux pump  46.88 
 
 		 107 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0307  small multidrug resistance protein  44.79 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2083  small multidrug resistance protein  45.45 
 
 		 107 aa  87.8  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000894022  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 109 aa  87.4  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  46 
 
 		 110 aa  87  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  44.33 
 
 		 108 aa  86.7  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  46.24 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  44.33 
 
 		 110 aa  84.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1319  small multidrug resistance protein  47.92 
 
 		 106 aa  84.3  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0145783  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  43.75 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  43.3 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  43.3 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  40.21 
 
 		 109 aa  84  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  40.21 
 
 		 109 aa  84  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  43.01 
 
 		 111 aa  84  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  37.86 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  43.88 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3008  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3259  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4755  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.504307  normal  0.07446 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  40.21 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1914  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1804  multidrug resistance protein, SMR family protein  39.6 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2208  quaternary ammonium compound-resistance protein  39.6 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.831863  normal  0.342211 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3321  small multidrug resistance protein  38.83 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00184251  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  42.11 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  42.11 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0828  small multidrug resistance protein  42.71 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.251219  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  38.78 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0657  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  36 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0871  small multidrug resistance protein  39.18 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  38.54 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4585  small multidrug resistance protein  44.44 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.631388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  40.43 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1826  small multidrug resistance protein  41.24 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal  0.470725 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4701  small multidrug resistance protein  38.14 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1535  small multidrug resistance protein  38.14 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1079  small multidrug resistance protein  38.14 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1559  small multidrug resistance protein  38.14 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219332  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0987  small multidrug resistance efflux protein  36 
 
 		 107 aa  73.6  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25874  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1973  small multidrug resistance protein  43.88 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3289  small multidrug resistance protein  38.78 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0798  SMR family multidrug efflux transporter  35.85 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.621925  normal  0.0234862 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1659  small multidrug resistance protein  35.71 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119593  normal  0.110471 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  35.71 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  37.76 
 
 		 112 aa  72  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2887  small multidrug resistance protein  41.03 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.014423 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0150  quaternary ammonium compound-resistance protein QacEdelta1  38.46 
 
 		 115 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.928712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2502  quaternary ammonium efflux pump, 4 TMS small multidrug resistance (SMR) family, GacE  37.23 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85484  normal  0.536214 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1769  small multidrug resistance protein  39.58 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1584  multidrug efflux protein  38.46 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.339035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1735  small multidrug resistance protein  38.3 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2329  small multidrug resistance protein  38.89 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2072  small multidrug resistance protein  34.62 
 
 		 114 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1673  small multidrug resistance protein  38.14 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107144 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1481  small multidrug resistance protein  36.08 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1460  small multidrug resistance protein  36.08 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44520  putative drug efflux transporter  37.25 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.44142 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0437  small multidrug resistance protein  40.78 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.453624  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3791  putative drug efflux transporter  37.25 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.773212  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3009  small multidrug resistance protein  36.73 
 
 		 109 aa  70.1  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2603  small multidrug resistance protein  36.08 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1832  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  34.02 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.935098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0774  SMR family multidrug efflux pump  34.02 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15362  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1245  SMR family multidrug efflux pump  34.02 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1815  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  34.02 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.701999  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0388  SMR family multidrug efflux pump  34.02 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1984  SMR family multidrug efflux pump  34.02 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4701  small multidrug resistance protein  36.89 
 
 		 111 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1730  SMR family multidrug efflux pump  34.02 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1234  small multidrug resistance protein  33.98 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1772  multidrug transporter EmrE  35 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.132035 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2946  small multidrug resistance protein  37.11 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1835  multidrug transporter EmrE  35 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.997367  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>