More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2329 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2329  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 110 aa  206  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2330  small multidrug resistance protein  67.95 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  46.15 
 
 		 109 aa  103  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  46.08 
 
 		 111 aa  99.4  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1177  small multidrug resistance protein  40.37 
 
 		 109 aa  91.3  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000160416  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  44.12 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  40.74 
 
 		 116 aa  89  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 106 aa  89.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  38.68 
 
 		 109 aa  88.6  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  38.68 
 
 		 109 aa  88.6  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1535  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 		 112 aa  87.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2502  quaternary ammonium efflux pump, 4 TMS small multidrug resistance (SMR) family, GacE  39.81 
 
 		 112 aa  87  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85484  normal  0.536214 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1079  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 		 112 aa  87.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1559  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 		 112 aa  87.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219332  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4701  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 		 112 aa  86.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2478  small multidrug resistance protein  49.51 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3289  small multidrug resistance protein  36.45 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1481  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1735  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1460  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  41.75 
 
 		 105 aa  84  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  36.79 
 
 		 110 aa  83.6  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  36.79 
 
 		 110 aa  83.6  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1673  small multidrug resistance protein  40.78 
 
 		 112 aa  83.6  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107144 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1659  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 112 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119593  normal  0.110471 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38630  cation/cationic drug transporter  41.75 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  38.89 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  37.25 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2320  small multidrug resistance protein  38.83 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1773  DMT superfamily multidrug efflux pump  43.69 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.251074  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0420  small multidrug resistance protein  43.69 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3077  small multidrug resistance protein  38.83 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  42.16 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1730  SMR family multidrug efflux pump  39.81 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1245  SMR family multidrug efflux pump  39.81 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0774  SMR family multidrug efflux pump  39.81 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15362  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1832  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  39.81 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.935098  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1984  SMR family multidrug efflux pump  39.81 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0388  SMR family multidrug efflux pump  39.81 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1815  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  39.81 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.701999  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  35.85 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  37.38 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1884  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  37.86 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4585  small multidrug resistance protein  46.75 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.631388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  37.86 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0450  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  38.83 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  37.86 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3601  SugE protein  38.83 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.51586  normal  0.208453 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2659  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2505  SMR family multidrug efflux pump  37.86 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  37.86 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2325  small multidrug resistance protein  33.98 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4068  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 111 aa  77.8  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2235  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1501  multidrug transporter EmrE  32.11 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21028  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0402  multidrug resistance protein, Smr family  36.27 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0151896  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0281  small multidrug resistance protein  37.86 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0360  multidrug resistance protein, Smr family  37.25 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3948  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 		 106 aa  76.6  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1684  multidrug transporter EmrE  32.11 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487331  normal  0.0413845 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0357  SMR family multidrug efflux pump  36.27 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0313  SMR family multidrug efflux pump  36.27 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  35.92 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0296  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  36.27 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1835  multidrug transporter EmrE  32.11 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.997367  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0300  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  36.27 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  36.89 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1774  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  32.11 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324074  normal  0.0937038 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1769  small multidrug resistance protein  34.31 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0328  SMR family multidrug efflux pump  36.27 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1772  multidrug transporter EmrE  32.11 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.132035 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2170  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4946  multidrug resistance protein, Smr family  36.27 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0374  multidrug resistance protein, Smr family  36.27 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0570  small multidrug resistance protein  40.21 
 
 		 101 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  38.83 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5196  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1403  small multidrug resistance protein  36.27 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0526825  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  38.61 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0308  small multidrug resistance protein  35.29 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1762  small multidrug resistance protein  41.75 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1583  SMR family multidrug efflux transporter  36.79 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.352831  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2158  small multidrug resistance protein  41.75 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  38.83 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  40.21 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5663  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.486536  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1965  small multidrug resistance protein  36.89 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  37.14 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2364  small multidrug resistance protein  34.91 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0283  SugE protein  42.86 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1095  SMR drug efflux transporter  36.27 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.1863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>