More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5663 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5663  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 119 aa  231  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.486536  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5196  small multidrug resistance protein  99.11 
 
 		 112 aa  213  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4036  small multidrug resistance protein  56.6 
 
 		 113 aa  90.5  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.629601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  35.71 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1177  small multidrug resistance protein  38 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000160416  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3228  multidrug efflux protein  36.08 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0308245  hitchhiker  0.000780201 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  39 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  35.05 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  35.05 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1603  multidrug efflux protein  35.05 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352426 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0986  small multidrug resistance protein  36.27 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0813  multidrug efflux protein  35.05 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.109831  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2036  multidrug efflux protein  35.05 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  34 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  34 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  36.54 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  38.24 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  36.54 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0828  small multidrug resistance protein  35 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.251219  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  35.35 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2329  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38630  cation/cationic drug transporter  37.62 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00493  multidrug efflux protein  34.02 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00498  hypothetical protein  34.02 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95244  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  33 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  31.96 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3071  small multidrug resistance protein  33.66 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.425013  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4478  quaternary ammonium compound-resistance protein  41.12 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.513  normal  0.735408 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0871  small multidrug resistance protein  32.71 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  38.61 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1319  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0145783  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  35.11 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3321  small multidrug resistance protein  29.13 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00184251  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1559  small multidrug resistance protein  35.29 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219332  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1535  small multidrug resistance protein  35.29 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1079  small multidrug resistance protein  35.29 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3008  small multidrug resistance protein  29.79 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  37 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  35.78 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  35.78 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2330  small multidrug resistance protein  34.38 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0100  sugE protein  34.31 
 
 		 114 aa  60.1  0.000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  35 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3009  small multidrug resistance protein  33.66 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1501  multidrug transporter EmrE  29.9 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21028  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8162  transporter  32.69 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.237194 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3259  small multidrug resistance protein  28.72 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2478  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  35.58 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1722  small multidrug resistance protein  40.23 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0437  small multidrug resistance protein  34 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.453624  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2970  small multidrug resistance protein  40.23 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.82632  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2825  small multidrug resistance protein  40.23 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2235  small multidrug resistance protein  34.95 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4701  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1617  small multidrug resistance protein  33 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  31.07 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1774  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  29.9 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324074  normal  0.0937038 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2843  small multidrug resistance protein  40.23 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1533  small multidrug resistance protein  40.23 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.447662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2257  small multidrug resistance protein  33 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.709004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  26.67 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  26.67 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1460  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1481  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1878  small multidrug resistance protein  35.92 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337942  normal  0.058805 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1901  sugE protein  39.77 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1684  multidrug transporter EmrE  28.87 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487331  normal  0.0413845 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1835  multidrug transporter EmrE  28.87 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.997367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1772  multidrug transporter EmrE  28.87 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.132035 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  35.29 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1769  small multidrug resistance protein  32 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  37.93 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3077  small multidrug resistance protein  32.94 
 
 		 106 aa  57  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  30.69 
 
 		 120 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2526  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158974  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3195  small multidrug resistance protein  37.89 
 
 		 122 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141243 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  41.38 
 
 		 104 aa  57  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1735  small multidrug resistance protein  30 
 
 		 112 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2502  quaternary ammonium efflux pump, 4 TMS small multidrug resistance (SMR) family, GacE  28.71 
 
 		 112 aa  57  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85484  normal  0.536214 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  31.07 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1673  small multidrug resistance protein  32.35 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107144 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1773  DMT superfamily multidrug efflux pump  33.66 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.251074  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1476  SMR drug efflux transporter  36.9 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0420  small multidrug resistance protein  33.66 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0798  SMR family multidrug efflux transporter  31.37 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.621925  normal  0.0234862 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  37.5 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  28.71 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0616  small multidrug resistance protein  36.84 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.88639  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1973  small multidrug resistance protein  36 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0450  small multidrug resistance protein  31.96 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0339  small multidrug resistance protein  34.29 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  30.69 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1676  small multidrug resistance protein  39.08 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  35.64 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>