More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8162 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8162  transporter  100 
 
 		 106 aa  197  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.237194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7227  small multidrug resistance protein  78.16 
 
 		 104 aa  142  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7226  small multidrug resistance protein  65.05 
 
 		 109 aa  127  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8161  small multidrug resistance protein  66.99 
 
 		 114 aa  125  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.32554 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0570  small multidrug resistance protein  49.5 
 
 		 101 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4238  small multidrug resistance protein  51.46 
 
 		 106 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.644322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  44.23 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  47.06 
 
 		 105 aa  92.8  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2608  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 108 aa  90.5  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.177322 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2320  small multidrug resistance protein  47.12 
 
 		 106 aa  89.4  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  45.1 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  47.06 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 106 aa  88.6  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  47.06 
 
 		 104 aa  88.6  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  44.66 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40170  putative transporter  45.63 
 
 		 107 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2052  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 106 aa  87.4  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712643 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2659  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 		 130 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  43.69 
 
 		 105 aa  87  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  40.95 
 
 		 106 aa  87  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04008  SugE  44.23 
 
 		 104 aa  86.7  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2945  small multidrug resistance protein  45.19 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46208  normal  0.904124 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2235  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  43.56 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  45.19 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2170  small multidrug resistance protein  43.81 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3948  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 		 106 aa  84.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00930  cation/cationic drug transporter  46.53 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4733  transporter  51.49 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  43.69 
 
 		 105 aa  84  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  46.08 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1901  sugE protein  47.19 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  45.19 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  41.35 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0281  small multidrug resistance protein  40.78 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3195  small multidrug resistance protein  41.75 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141243 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  45.71 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3903  small multidrug resistance protein  41.58 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2478  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2198  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2320  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0853  small multidrug resistance protein  36.54 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  42.16 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54110  transporter  49.5 
 
 		 101 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1257  SMR family multidrug efflux pump  38.46 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303472  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0373  sugE protein  38.46 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1870  sugE protein  38.46 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.437905  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1399  suppresses groEL, may be chaperone  38.46 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0777  sugE protein  38.46 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590294  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1090  sugE protein  38.46 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2526  small multidrug resistance protein  42.16 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158974  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1965  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1249  SMR family multidrug efflux pump  38.46 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  42.72 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  42.72 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4237  small multidrug resistance protein  43.52 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.492024  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2970  small multidrug resistance protein  44.94 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.82632  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4260  small multidrug resistance protein  43.52 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2825  small multidrug resistance protein  44.94 
 
 		 104 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  41.75 
 
 		 104 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1722  small multidrug resistance protein  44.94 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1533  small multidrug resistance protein  44.94 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.447662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2650  small multidrug resistance protein  43.93 
 
 		 105 aa  80.1  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2305  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 106 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2843  small multidrug resistance protein  44.94 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1670  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 106 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2282  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 106 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3825  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6417  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1502  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1773  DMT superfamily multidrug efflux pump  38.61 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.251074  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5609  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.329891  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0420  small multidrug resistance protein  38.61 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1878  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337942  normal  0.058805 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1676  small multidrug resistance protein  43.82 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1212  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0428006 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0996  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.762024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0685  small multidrug resistance protein  34.62 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0589  small multidrug resistance protein  44.83 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1027  sugE protein  38.46 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  39.81 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  41.75 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  41.58 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2080  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235888  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1261  small multidrug resistance efflux protein  40.2 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.943877  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4109  cation membrane transporter  42.45 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1683  small multidrug resistance protein  43.82 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.656055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  39.81 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  39.81 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  39.81 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>