More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1319 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1319  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 106 aa  198  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0145783  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1177  small multidrug resistance protein  51.92 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000160416  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  51.96 
 
 		 106 aa  107  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  56.38 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  55.32 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  55.32 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1762  small multidrug resistance protein  53.27 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1095  SMR drug efflux transporter  53.4 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.1863  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  50.49 
 
 		 111 aa  101  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  54.46 
 
 		 109 aa  99.4  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  48.04 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  48.62 
 
 		 109 aa  98.2  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  48.62 
 
 		 109 aa  98.2  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1102  small multidrug resistance protein  46.6 
 
 		 107 aa  98.2  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  45.79 
 
 		 120 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  45.79 
 
 		 120 aa  97.4  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  51.96 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  45.79 
 
 		 120 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1863  small multidrug resistance protein  44.34 
 
 		 123 aa  96.7  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0308  small multidrug resistance protein  40.78 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38630  cation/cationic drug transporter  49.52 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  50 
 
 		 110 aa  95.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0357  SMR family multidrug efflux pump  40.78 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  44.86 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4946  multidrug resistance protein, Smr family  40.78 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3077  small multidrug resistance protein  47.92 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0374  multidrug resistance protein, Smr family  40.78 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  44.86 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0402  multidrug resistance protein, Smr family  40.78 
 
 		 107 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0151896  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0313  SMR family multidrug efflux pump  40.78 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0296  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  40.78 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0300  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  40.78 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0328  SMR family multidrug efflux pump  40.78 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4755  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 136 aa  94.7  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.504307  normal  0.07446 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0987  small multidrug resistance efflux protein  48.6 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25874  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0360  multidrug resistance protein, Smr family  39.81 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  44.86 
 
 		 120 aa  94  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2692  small multidrug resistance protein  51.89 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2325  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0307  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2072  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 		 114 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0627  small multidrug resistance protein  46.73 
 
 		 109 aa  91.3  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4527  small multidrug resistance protein  54.21 
 
 		 107 aa  90.5  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1476  SMR drug efflux transporter  47.17 
 
 		 108 aa  90.1  8e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 		 109 aa  90.1  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1719  small multidrug resistance protein  48.54 
 
 		 116 aa  89.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241026 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  44.44 
 
 		 116 aa  89.4  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3008  small multidrug resistance protein  45.92 
 
 		 113 aa  88.6  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  46.08 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  46.08 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1769  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  45.87 
 
 		 109 aa  89.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3259  small multidrug resistance protein  46.94 
 
 		 113 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  45.1 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  45.19 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2208  quaternary ammonium compound-resistance protein  46.53 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.831863  normal  0.342211 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0986  small multidrug resistance protein  46.15 
 
 		 291 aa  88.6  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1804  multidrug resistance protein, SMR family protein  46.53 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1914  small multidrug resistance protein  46.53 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4585  small multidrug resistance protein  51.85 
 
 		 110 aa  87  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.631388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  45 
 
 		 113 aa  86.7  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2946  small multidrug resistance protein  43.12 
 
 		 109 aa  86.7  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4701  small multidrug resistance protein  47.52 
 
 		 112 aa  85.9  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1079  small multidrug resistance protein  47.52 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1535  small multidrug resistance protein  47.52 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1559  small multidrug resistance protein  47.52 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219332  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3009  small multidrug resistance protein  47.06 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4701  small multidrug resistance protein  47.87 
 
 		 111 aa  85.9  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0798  SMR family multidrug efflux transporter  45.54 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.621925  normal  0.0234862 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2505  SMR family multidrug efflux pump  47.52 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1088  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1638  efflux-multidrug resistance protein  40.2 
 
 		 109 aa  85.5  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.381762  hitchhiker  0.000000419533 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0828  small multidrug resistance protein  47.06 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.251219  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1481  small multidrug resistance protein  46.53 
 
 		 112 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545995  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  48.04 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1460  small multidrug resistance protein  46.53 
 
 		 112 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0774  SMR family multidrug efflux pump  46.81 
 
 		 112 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15362  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1245  SMR family multidrug efflux pump  46.81 
 
 		 112 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1984  SMR family multidrug efflux pump  46.81 
 
 		 112 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1815  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  46.81 
 
 		 112 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.701999  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0388  SMR family multidrug efflux pump  46.81 
 
 		 112 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1832  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  46.81 
 
 		 112 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.935098  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1730  SMR family multidrug efflux pump  46.81 
 
 		 112 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1617  small multidrug resistance protein  44.66 
 
 		 110 aa  83.6  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2897  small multidrug resistance protein  48.98 
 
 		 104 aa  83.6  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.904986 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4930  small multidrug resistance protein  42.55 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.984602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4979  small multidrug resistance protein  42.55 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.174415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1973  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1659  small multidrug resistance protein  44.55 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119593  normal  0.110471 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2257  small multidrug resistance protein  44.66 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.709004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  41.58 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0536  small multidrug resistance protein  43.62 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568122  normal  0.0651219 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1673  small multidrug resistance protein  46.53 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107144 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4802  small multidrug resistance protein  42.55 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.123188  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0450  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1583  SMR family multidrug efflux transporter  44.12 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.352831  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3071  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.425013  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2502  quaternary ammonium efflux pump, 4 TMS small multidrug resistance (SMR) family, GacE  47.96 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85484  normal  0.536214 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2603  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>