More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0627 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0627  small multidrug resistance protein  100 
 
 
109 aa  203  7e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38630  cation/cationic drug transporter  49.07 
 
 
108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0987  small multidrug resistance efflux protein  51.43 
 
 
107 aa  100  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25874  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4527  small multidrug resistance protein  54.29 
 
 
107 aa  100  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4701  small multidrug resistance protein  48.54 
 
 
111 aa  97.1  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  50.45 
 
 
110 aa  96.3  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  47.71 
 
 
116 aa  92  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  45.95 
 
 
110 aa  91.3  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  45.95 
 
 
110 aa  91.3  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0339  small multidrug resistance protein  44.86 
 
 
111 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2946  small multidrug resistance protein  48.04 
 
 
109 aa  89.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  47.12 
 
 
110 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  46.67 
 
 
111 aa  88.2  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1769  small multidrug resistance protein  43.81 
 
 
109 aa  87.8  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0488  small multidrug resistance protein  42.99 
 
 
110 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0280081  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  42.06 
 
 
110 aa  87.4  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  42.06 
 
 
110 aa  87.4  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2502  quaternary ammonium efflux pump, 4 TMS small multidrug resistance (SMR) family, GacE  46.15 
 
 
112 aa  87.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85484  normal  0.536214 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6952  small multidrug resistance protein  47.17 
 
 
109 aa  87  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3074  small multidrug resistance protein  45.45 
 
 
109 aa  87  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219411  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2072  small multidrug resistance protein  46.53 
 
 
114 aa  86.7  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1735  small multidrug resistance protein  46.67 
 
 
112 aa  87  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512755  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1774  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  41.75 
 
 
112 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324074  normal  0.0937038 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  43.81 
 
 
109 aa  86.3  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1772  multidrug transporter EmrE  41.75 
 
 
112 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.132035 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1835  multidrug transporter EmrE  41.75 
 
 
112 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.997367  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  48.51 
 
 
109 aa  86.7  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1684  multidrug transporter EmrE  41.75 
 
 
112 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487331  normal  0.0413845 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0541  small multidrug resistance protein  40.19 
 
 
110 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.730216  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1670  small multidrug resistance protein  44.04 
 
 
108 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.774613  hitchhiker  0.00381818 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1762  small multidrug resistance protein  45.37 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1659  small multidrug resistance protein  47.12 
 
 
112 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119593  normal  0.110471 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1501  multidrug transporter EmrE  40.78 
 
 
112 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21028  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4930  small multidrug resistance protein  42.99 
 
 
110 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.984602  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3009  small multidrug resistance protein  44.55 
 
 
109 aa  85.1  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1638  efflux-multidrug resistance protein  46.53 
 
 
109 aa  85.1  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.381762  hitchhiker  0.000000419533 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4979  small multidrug resistance protein  42.99 
 
 
110 aa  84.3  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.174415  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0450  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 
109 aa  84.7  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4802  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 
110 aa  84.3  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.123188  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4979  multidrug resistance protein  40.19 
 
 
110 aa  84  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02486  hypothetical protein  42.57 
 
 
117 aa  84  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0536  small multidrug resistance protein  42.99 
 
 
110 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568122  normal  0.0651219 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65990  SMR multidrug efflux transporter  50.47 
 
 
110 aa  83.6  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00317706  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2603  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 
110 aa  83.6  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1914  small multidrug resistance protein  45.37 
 
 
110 aa  82  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1804  multidrug resistance protein, SMR family protein  45.37 
 
 
110 aa  82  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  47.22 
 
 
109 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5725  SMR multidrug efflux transporter  49.53 
 
 
110 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2208  quaternary ammonium compound-resistance protein  45.37 
 
 
110 aa  82  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.831863  normal  0.342211 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1617  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 
110 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4701  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 
112 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  45.19 
 
 
110 aa  81.3  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2257  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 
110 aa  80.9  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.709004  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1535  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003631  quaternary ammonium compound-resistance protein  40.18 
 
 
118 aa  80.5  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1079  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1559  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219332  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  43.27 
 
 
110 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1673  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.107144 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4263  small multidrug resistance protein  39.62 
 
 
108 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2364  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 
110 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1234  small multidrug resistance protein  46.67 
 
 
113 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1460  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 
112 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1481  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 
112 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545995  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 
109 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 
109 aa  79  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  41.35 
 
 
109 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1319  small multidrug resistance protein  46.73 
 
 
106 aa  78.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0145783  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 
110 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2505  SMR family multidrug efflux pump  41.35 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3321  small multidrug resistance protein  44.34 
 
 
111 aa  78.2  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00184251  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2350  putative methyl viologen/ethidium resistance transmembrane protein  39.05 
 
 
114 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000392235  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 
113 aa  77.8  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0613  small multidrug resistance protein  45.79 
 
 
110 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.375677  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3008  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 
113 aa  77  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0437  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 
113 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.453624  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1095  SMR drug efflux transporter  43.27 
 
 
108 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.1863  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1832  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  42.31 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.935098  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1245  SMR family multidrug efflux pump  42.31 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1730  SMR family multidrug efflux pump  42.31 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1984  SMR family multidrug efflux pump  42.31 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0774  SMR family multidrug efflux pump  42.31 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15362  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1584  multidrug efflux protein  42 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.339035  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2543  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 
109 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544067  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0388  SMR family multidrug efflux pump  42.31 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1815  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  42.31 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.701999  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0150  quaternary ammonium compound-resistance protein QacEdelta1  42 
 
 
115 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.928712  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  38.53 
 
 
110 aa  75.5  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  43.16 
 
 
111 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3259  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 
113 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0798  SMR family multidrug efflux transporter  45.1 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.621925  normal  0.0234862 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  42.06 
 
 
106 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3554  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  46.3 
 
 
108 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4976  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0616597 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  39.05 
 
 
108 aa  73.6  0.0000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1088  small multidrug resistance protein  43.88 
 
 
109 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1110  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 
109 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200886  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2988  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 
108 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282135  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1826  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 
109 aa  72  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal  0.470725 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>