More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4527 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4527  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 107 aa  201  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0987  small multidrug resistance efflux protein  55.14 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25874  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0627  small multidrug resistance protein  54.29 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4976  small multidrug resistance protein  54.72 
 
 		 109 aa  103  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0616597 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1762  small multidrug resistance protein  53.27 
 
 		 108 aa  100  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38630  cation/cationic drug transporter  48.57 
 
 		 108 aa  97.4  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  50.96 
 
 		 110 aa  97.1  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  50.96 
 
 		 110 aa  97.1  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2946  small multidrug resistance protein  50.49 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  48.11 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  48.11 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4478  quaternary ammonium compound-resistance protein  55.56 
 
 		 108 aa  94.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.513  normal  0.735408 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6952  small multidrug resistance protein  55.14 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1914  small multidrug resistance protein  49.04 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2208  quaternary ammonium compound-resistance protein  49.04 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.831863  normal  0.342211 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1804  multidrug resistance protein, SMR family protein  49.04 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0339  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 111 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  44.86 
 
 		 106 aa  90.5  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  51.49 
 
 		 116 aa  90.5  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  49.06 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  55.77 
 
 		 110 aa  88.2  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  55.77 
 
 		 110 aa  88.2  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3009  small multidrug resistance protein  50.49 
 
 		 109 aa  88.2  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31070  cation/cationic drug transporter  51.4 
 
 		 106 aa  87.4  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.438868  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  46.73 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  50.5 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  49.06 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1319  small multidrug resistance protein  54.21 
 
 		 106 aa  86.7  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0145783  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3346  small multidrug resistance protein  49.07 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0550769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3345  small multidrug resistance protein  49.53 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0912633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  51.92 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4701  small multidrug resistance protein  49 
 
 		 111 aa  84.7  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 		 109 aa  84.7  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31080  cation/cationic drug transporter  49.06 
 
 		 113 aa  84.7  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.234075  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3554  small multidrug resistance protein  49.04 
 
 		 107 aa  84  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3228  multidrug efflux protein  44.76 
 
 		 110 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0308245  hitchhiker  0.000780201 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00493  multidrug efflux protein  44.76 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  44.34 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1095  SMR drug efflux transporter  43.4 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.1863  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00498  hypothetical protein  44.76 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0813  multidrug efflux protein  43.81 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.109831  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2987  small multidrug resistance protein  46.67 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  40 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2036  multidrug efflux protein  43.81 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0450  small multidrug resistance protein  46.23 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  43.56 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  46.15 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  40 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1603  multidrug efflux protein  42.86 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352426 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1088  small multidrug resistance protein  42.45 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2072  small multidrug resistance protein  43.69 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  40 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12490  cation/cationic drug transporter  48.57 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0488  small multidrug resistance protein  46.15 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0280081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  40 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3466  small multidrug resistance protein  43.88 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2543  small multidrug resistance protein  47.12 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544067  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  40 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  46.08 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  40 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2988  small multidrug resistance protein  48.08 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282135  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2364  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 110 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  43.4 
 
 		 108 aa  80.1  0.000000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  49.5 
 
 		 110 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2205  small multidrug resistance protein  51.49 
 
 		 110 aa  80.1  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3071  small multidrug resistance protein  48.54 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.425013  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1863  small multidrug resistance protein  38.32 
 
 		 123 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2603  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2692  small multidrug resistance protein  47.62 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1735  small multidrug resistance protein  44.76 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4975  small multidrug resistance protein  52.38 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0590431 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1769  small multidrug resistance protein  42.45 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0657  small multidrug resistance protein  44.55 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2505  SMR family multidrug efflux pump  42.16 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02486  hypothetical protein  39.05 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0828  small multidrug resistance protein  41.51 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.251219  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4263  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0388  SMR family multidrug efflux pump  40.2 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1245  SMR family multidrug efflux pump  40.2 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1730  SMR family multidrug efflux pump  40.2 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1501  multidrug transporter EmrE  43.69 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21028  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1984  SMR family multidrug efflux pump  40.2 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1832  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  40.2 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.935098  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1815  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  40.2 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.701999  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0774  SMR family multidrug efflux pump  40.2 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15362  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1684  multidrug transporter EmrE  43.69 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487331  normal  0.0413845 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1835  multidrug transporter EmrE  43.69 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.997367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1772  multidrug transporter EmrE  43.69 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.132035 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1617  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3008  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0798  SMR family multidrug efflux transporter  41.75 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.621925  normal  0.0234862 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1659  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119593  normal  0.110471 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2257  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.709004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1774  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  43.69 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324074  normal  0.0937038 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4930  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.984602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3074  small multidrug resistance protein  43.88 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219411  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3259  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2410  small multidrug resistance protein  44.33 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>