226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3346 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3346  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 108 aa  204  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0550769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3554  small multidrug resistance protein  75.47 
 
 		 107 aa  153  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2987  small multidrug resistance protein  55.34 
 
 		 115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112994  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31080  cation/cationic drug transporter  60.58 
 
 		 113 aa  105  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.234075  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2988  small multidrug resistance protein  50.89 
 
 		 108 aa  88.6  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282135  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3345  small multidrug resistance protein  52.88 
 
 		 106 aa  88.6  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0912633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4976  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 109 aa  88.2  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0616597 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2866  small multidrug resistance protein  46.6 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2910  small multidrug resistance protein  46.6 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2896  small multidrug resistance protein  46.6 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12490  cation/cationic drug transporter  49.06 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4975  small multidrug resistance protein  51.81 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0590431 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0987  small multidrug resistance efflux protein  47.71 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25874  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6952  small multidrug resistance protein  51.4 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4527  small multidrug resistance protein  49.07 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0627  small multidrug resistance protein  39.62 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31070  cation/cationic drug transporter  49.53 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.438868  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  42.73 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3553  small multidrug resistance protein  47.17 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2410  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1592  multidrug efflux system protein MdtJ  34.26 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.999303 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1651  multidrug efflux system protein MdtJ  34.26 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1583  multidrug efflux system protein MdtJ  34.26 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.159233 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1691  multidrug efflux system protein MdtJ  34.26 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.190656  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1858  multidrug efflux system protein MdtJ  34.26 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.636253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2867  small multidrug resistance protein  55.88 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2911  small multidrug resistance protein  55.88 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2897  small multidrug resistance protein  55.88 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216047  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1762  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1319  small multidrug resistance protein  47.71 
 
 		 106 aa  63.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0145783  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  41.67 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  37.84 
 
 		 120 aa  62  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  37.27 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  37.27 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  39.25 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1911  multidrug efflux system protein MdtJ  32.41 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  39.25 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3791  putative drug efflux transporter  38.68 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.773212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  39.25 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2766  small multidrug resistance protein  35.19 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131803  normal  0.0168064 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44520  putative drug efflux transporter  38.68 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.44142 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  37.84 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38630  cation/cationic drug transporter  39.6 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01569  multidrug efflux system transporter  33.33 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2043  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.899542  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1674  multidrug efflux system protein MdtJ  33.33 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2310  multidrug efflux system protein MdtJ  33.33 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1786  multidrug efflux system protein MdtJ  33.33 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01559  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2030  multidrug efflux system protein MdtJ  33.33 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1807  multidrug efflux system protein MdtJ  33.33 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1599  multidrug efflux system protein MdtJ  33.33 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.62917  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  37.38 
 
 		 120 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1973  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 109 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2020  multidrug resistance protein MdtJ  35.78 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.993103  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2131  small multidrug resistance protein  35.78 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2409  multidrug resistance protein MdtJ  34.26 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00258719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4979  small multidrug resistance protein  38.61 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.174415  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4930  small multidrug resistance protein  38.61 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.984602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4802  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.123188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1769  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1584  multidrug efflux protein  39.62 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.339035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0150  quaternary ammonium compound-resistance protein QacEdelta1  39.62 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.928712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  38.83 
 
 		 108 aa  57  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0488  small multidrug resistance protein  35 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0280081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  40.57 
 
 		 109 aa  57  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  32.73 
 
 		 110 aa  57  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  41.51 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1088  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3074  small multidrug resistance protein  36.89 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219411  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1863  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2946  small multidrug resistance protein  37.27 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  41.51 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3071  small multidrug resistance protein  37.86 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.425013  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1437  small multidrug resistance protein  30.39 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  37.61 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1095  SMR drug efflux transporter  41.58 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.1863  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  36.89 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3321  small multidrug resistance protein  36 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00184251  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2208  quaternary ammonium compound-resistance protein  37.86 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.831863  normal  0.342211 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1914  small multidrug resistance protein  37.86 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1804  multidrug resistance protein, SMR family protein  37.86 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2543  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544067  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1826  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal  0.470725 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0986  small multidrug resistance protein  35.64 
 
 		 291 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1360  small multidrug resistance protein  35.4 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0118  small multidrug resistance protein  42.16 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06909  hypothetical protein  27.27 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4979  multidrug resistance protein  34.69 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2364  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3545  small multidrug resistance protein  31.58 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0437  small multidrug resistance protein  38 
 
 		 113 aa  51.2  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.453624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>