231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3554 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3554  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 107 aa  198  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3346  small multidrug resistance protein  75.47 
 
 		 108 aa  153  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0550769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31080  cation/cationic drug transporter  67.65 
 
 		 113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.234075  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2987  small multidrug resistance protein  57.84 
 
 		 115 aa  99.8  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112994  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2866  small multidrug resistance protein  53.33 
 
 		 114 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2910  small multidrug resistance protein  53.33 
 
 		 114 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2896  small multidrug resistance protein  53.33 
 
 		 114 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3345  small multidrug resistance protein  51.46 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0912633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4976  small multidrug resistance protein  51.92 
 
 		 109 aa  90.9  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0616597 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12490  cation/cationic drug transporter  50.96 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2988  small multidrug resistance protein  46.73 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282135  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0987  small multidrug resistance efflux protein  46.23 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25874  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3553  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31070  cation/cationic drug transporter  50.53 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.438868  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0627  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4975  small multidrug resistance protein  51.22 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0590431 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4527  small multidrug resistance protein  49.04 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  36.11 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  36.11 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6952  small multidrug resistance protein  48.57 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38630  cation/cationic drug transporter  40.2 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2020  multidrug resistance protein MdtJ  36.11 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.993103  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  42.06 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2131  small multidrug resistance protein  36.11 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2409  multidrug resistance protein MdtJ  36.11 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00258719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1584  multidrug efflux protein  42.72 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.339035  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  46.39 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  46.39 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2410  small multidrug resistance protein  39.39 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0150  quaternary ammonium compound-resistance protein QacEdelta1  42.72 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.928712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2766  small multidrug resistance protein  36.54 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131803  normal  0.0168064 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  37.27 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1911  multidrug efflux system protein MdtJ  35.24 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01569  multidrug efflux system transporter  37.14 
 
 		 121 aa  62  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2043  small multidrug resistance protein  37.14 
 
 		 121 aa  62  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.899542  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1786  multidrug efflux system protein MdtJ  37.14 
 
 		 121 aa  62  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2310  multidrug efflux system protein MdtJ  37.14 
 
 		 121 aa  62  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  37.96 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1674  multidrug efflux system protein MdtJ  37.14 
 
 		 121 aa  62  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1807  multidrug efflux system protein MdtJ  37.14 
 
 		 121 aa  62  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2030  multidrug efflux system protein MdtJ  37.14 
 
 		 121 aa  62  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01559  hypothetical protein  37.14 
 
 		 121 aa  62  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1599  multidrug efflux system protein MdtJ  37.14 
 
 		 121 aa  62  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.62917  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  41.67 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1592  multidrug efflux system protein MdtJ  33.65 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.999303 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1651  multidrug efflux system protein MdtJ  33.65 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3074  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219411  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1858  multidrug efflux system protein MdtJ  33.65 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.636253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1691  multidrug efflux system protein MdtJ  33.65 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.190656  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2867  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2911  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2897  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216047  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1583  multidrug efflux system protein MdtJ  32.41 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.159233 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2364  small multidrug resistance protein  38.18 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  35.19 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  41 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1088  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0437  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.453624  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2946  small multidrug resistance protein  38.89 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1319  small multidrug resistance protein  47.62 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0145783  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  40.37 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  36.11 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  36.11 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  33.65 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1659  small multidrug resistance protein  37.27 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119593  normal  0.110471 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1973  small multidrug resistance protein  37.04 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2543  small multidrug resistance protein  39.09 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544067  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2502  quaternary ammonium efflux pump, 4 TMS small multidrug resistance (SMR) family, GacE  37.14 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85484  normal  0.536214 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  37.04 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  37.96 
 
 		 109 aa  57  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1762  small multidrug resistance protein  39 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2603  small multidrug resistance protein  34.91 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3791  putative drug efflux transporter  35.58 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.773212  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3071  small multidrug resistance protein  39.58 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.425013  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44520  putative drug efflux transporter  35.58 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.44142 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1826  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal  0.470725 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4701  small multidrug resistance protein  37.62 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  34.62 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1735  small multidrug resistance protein  35.92 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1095  SMR drug efflux transporter  40.82 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.1863  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2060  small multidrug resistance protein  37.61 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0271  small multidrug resistance protein  31 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0488  small multidrug resistance protein  32.69 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0280081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1437  small multidrug resistance protein  30 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  32.38 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12480  cation/cationic drug transporter  51.46 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  32.38 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0541  small multidrug resistance protein  30.77 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.730216  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  32.38 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4225  small multidrug resistance protein  30 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.023296 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3321  small multidrug resistance protein  36.79 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00184251  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4979  multidrug resistance protein  30.77 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  32.38 
 
 		 120 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1638  efflux-multidrug resistance protein  36 
 
 		 109 aa  52.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.381762  hitchhiker  0.000000419533 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0377  small multidrug resistance protein  29 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  32.38 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2072  small multidrug resistance protein  40.62 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1769  small multidrug resistance protein  34.62 
 
 		 109 aa  52  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>