More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1858 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1592  multidrug efflux system protein MdtJ  100 
 
 
120 aa  229  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.999303 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1651  multidrug efflux system protein MdtJ  100 
 
 
120 aa  229  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1858  multidrug efflux system protein MdtJ  100 
 
 
120 aa  229  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.636253  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1691  multidrug efflux system protein MdtJ  99.17 
 
 
120 aa  228  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.190656  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1583  multidrug efflux system protein MdtJ  98.33 
 
 
120 aa  224  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.159233 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1911  multidrug efflux system protein MdtJ  83.33 
 
 
120 aa  194  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01569  multidrug efflux system transporter  83.9 
 
 
121 aa  188  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1599  multidrug efflux system protein MdtJ  83.9 
 
 
121 aa  188  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.62917  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2043  small multidrug resistance protein  83.9 
 
 
121 aa  188  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.899542  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01559  hypothetical protein  83.9 
 
 
121 aa  188  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1674  multidrug efflux system protein MdtJ  83.9 
 
 
121 aa  188  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1807  multidrug efflux system protein MdtJ  83.9 
 
 
121 aa  188  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2030  multidrug efflux system protein MdtJ  83.9 
 
 
121 aa  188  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712996  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2310  multidrug efflux system protein MdtJ  83.9 
 
 
121 aa  188  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1786  multidrug efflux system protein MdtJ  83.9 
 
 
121 aa  188  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2766  small multidrug resistance protein  69.64 
 
 
122 aa  154  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131803  normal  0.0168064 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2020  multidrug resistance protein MdtJ  66.67 
 
 
147 aa  146  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.993103  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2131  small multidrug resistance protein  66.67 
 
 
147 aa  146  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2409  multidrug resistance protein MdtJ  68.47 
 
 
147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00258719  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44520  putative drug efflux transporter  52.1 
 
 
122 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.44142 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3791  putative drug efflux transporter  52.14 
 
 
122 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.773212  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001962  spermidine export protein mdtJ  44.72 
 
 
134 aa  95.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00509  cation transporter  45.45 
 
 
125 aa  91.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0063  small multidrug resistance protein  41.46 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1360  small multidrug resistance protein  49.04 
 
 
114 aa  84.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24792  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2305  small multidrug resistance protein  41.58 
 
 
117 aa  80.5  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.148395  normal  0.149185 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1812  small multidrug resistance protein  37.7 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2406  SMR family multidrug efflux pump  33.88 
 
 
136 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.374447  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  35.04 
 
 
120 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2060  small multidrug resistance protein  34.62 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  35.04 
 
 
120 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0718  small multidrug resistance protein  33.62 
 
 
123 aa  67  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  35.04 
 
 
120 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  34.19 
 
 
120 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  34.19 
 
 
120 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  34.19 
 
 
120 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0357  SMR family multidrug efflux pump  38.1 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3346  small multidrug resistance protein  34.26 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0550769  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0360  multidrug resistance protein, Smr family  37.25 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0313  SMR family multidrug efflux pump  36.27 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0296  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  36.27 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0300  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  36.27 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0328  SMR family multidrug efflux pump  36.27 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1307  SMR family multidrug efflux pump  38.1 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0374  multidrug resistance protein, Smr family  36.27 
 
 
107 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4946  multidrug resistance protein, Smr family  36.27 
 
 
107 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0402  multidrug resistance protein, Smr family  38.1 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0151896  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3554  small multidrug resistance protein  33.65 
 
 
107 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0556  SMR family multidrug efflux pump  38.1 
 
 
113 aa  62  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1188  SMR family multidrug efflux pump  38.1 
 
 
113 aa  62  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0307  small multidrug resistance protein  36.19 
 
 
107 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0437  small multidrug resistance protein  32.41 
 
 
113 aa  60.8  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.453624  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0308  small multidrug resistance protein  35.29 
 
 
107 aa  60.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1102  small multidrug resistance protein  35.42 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  36.89 
 
 
110 aa  59.7  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  29.09 
 
 
110 aa  59.7  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  29.09 
 
 
110 aa  59.7  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  36.89 
 
 
110 aa  59.7  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  32.32 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  35.92 
 
 
110 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1080  conserved hypothetical protein, putative multidrug resistance efflux protein  36.19 
 
 
113 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.644229  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 
116 aa  57.4  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  35 
 
 
109 aa  57  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2987  small multidrug resistance protein  30.43 
 
 
115 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112994  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0476  small multidrug resistance protein  34.74 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.651583  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4930  small multidrug resistance protein  29.81 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.984602  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  35 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4979  small multidrug resistance protein  29.81 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.174415  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31080  cation/cationic drug transporter  34.58 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.234075  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1319  small multidrug resistance protein  38 
 
 
106 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0145783  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0536  small multidrug resistance protein  29.09 
 
 
110 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568122  normal  0.0651219 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4802  small multidrug resistance protein  29.81 
 
 
110 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.123188  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1476  SMR drug efflux transporter  32.94 
 
 
108 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4069  small multidrug resistance protein  34.34 
 
 
104 aa  54.7  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302029  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3071  small multidrug resistance protein  33.66 
 
 
107 aa  54.3  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.425013  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  36.45 
 
 
105 aa  54.7  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4289  sugE protein  34.34 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.093578  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4325  sugE protein  34.34 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.80388  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1950  small multidrug resistance protein  33.67 
 
 
105 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.498297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3957  small multidrug resistance protein; quaternary ammonium compound-resistance protein  34.34 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0085456  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3968  small multidrug resistance protein; quaternary ammonium compound-resistance protein  34.34 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4233  sugE protein  34.34 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4344  sugE protein  34.34 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.970862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0908  sugE protein  34.34 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000097747  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2325  small multidrug resistance protein  31.25 
 
 
107 aa  54.3  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  31.31 
 
 
112 aa  54.3  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2364  small multidrug resistance protein  29.91 
 
 
110 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0488  small multidrug resistance protein  27.1 
 
 
110 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0280081  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1863  small multidrug resistance protein  32.29 
 
 
123 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  31 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  35.45 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0118  small multidrug resistance protein  39.71 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0871  small multidrug resistance protein  31.25 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0828  small multidrug resistance protein  28.97 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.251219  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3466  small multidrug resistance protein  32.35 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1659  small multidrug resistance protein  28.28 
 
 
112 aa  52  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119593  normal  0.110471 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4755  small multidrug resistance protein  26.5 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.504307  normal  0.07446 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2410  small multidrug resistance protein  34.34 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4436  sugE protein  33.33 
 
 
104 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>