More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4976 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4976  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 109 aa  205  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0616597 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2988  small multidrug resistance protein  56.88 
 
 		 108 aa  108  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282135  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12490  cation/cationic drug transporter  56.73 
 
 		 106 aa  102  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2896  small multidrug resistance protein  57.28 
 
 		 114 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2866  small multidrug resistance protein  57.28 
 
 		 114 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2910  small multidrug resistance protein  57.28 
 
 		 114 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3345  small multidrug resistance protein  53.77 
 
 		 106 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0912633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4975  small multidrug resistance protein  60.75 
 
 		 122 aa  94  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0590431 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2897  small multidrug resistance protein  57.47 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216047  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2867  small multidrug resistance protein  57.47 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2911  small multidrug resistance protein  57.47 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228874  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4527  small multidrug resistance protein  54.72 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3554  small multidrug resistance protein  51.92 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0987  small multidrug resistance efflux protein  51.4 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25874  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31070  cation/cationic drug transporter  49.52 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.438868  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3346  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 108 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0550769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2987  small multidrug resistance protein  47.22 
 
 		 115 aa  85.1  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112994  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1762  small multidrug resistance protein  45.63 
 
 		 108 aa  84.3  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3553  small multidrug resistance protein  54.21 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  45.45 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  45.45 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38630  cation/cationic drug transporter  40.38 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  40.37 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3074  small multidrug resistance protein  43.56 
 
 		 109 aa  76.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219411  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3071  small multidrug resistance protein  43.69 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.425013  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0627  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4478  quaternary ammonium compound-resistance protein  48.54 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.513  normal  0.735408 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2410  small multidrug resistance protein  38.68 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6952  small multidrug resistance protein  42.99 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2543  small multidrug resistance protein  41.82 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544067  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2364  small multidrug resistance protein  40.57 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0377  small multidrug resistance protein  32.11 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  39.8 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0828  small multidrug resistance protein  34.26 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.251219  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3259  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0437  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.453624  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1914  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1804  multidrug resistance protein, SMR family protein  38.24 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 		 110 aa  67  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2208  quaternary ammonium compound-resistance protein  38.24 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.831863  normal  0.342211 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  39.09 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  42.06 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1769  small multidrug resistance protein  35.51 
 
 		 109 aa  66.6  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06909  hypothetical protein  29.36 
 
 		 149 aa  66.6  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  41.12 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  41.12 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  36.79 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3466  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  35.19 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1826  small multidrug resistance protein  37.74 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal  0.470725 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  40.37 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  40.19 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3008  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0118  small multidrug resistance protein  34.58 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0774  SMR family multidrug efflux pump  37.61 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15362  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1815  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  37.61 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.701999  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1730  SMR family multidrug efflux pump  37.61 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1245  SMR family multidrug efflux pump  37.61 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0388  SMR family multidrug efflux pump  37.61 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1984  SMR family multidrug efflux pump  37.61 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1832  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  37.61 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.935098  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31080  cation/cationic drug transporter  42.99 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.234075  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2072  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2946  small multidrug resistance protein  35.45 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4263  small multidrug resistance protein  36.19 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0271  small multidrug resistance protein  30.28 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0339  small multidrug resistance protein  34.58 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1437  small multidrug resistance protein  29.36 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4225  small multidrug resistance protein  30.28 
 
 		 108 aa  62  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.023296 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0159  multidrug efflux transporter  30.28 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0763675  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0488  small multidrug resistance protein  39.25 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0280081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1088  small multidrug resistance protein  36.45 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0450  small multidrug resistance protein  37.74 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4755  small multidrug resistance protein  37.04 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.504307  normal  0.07446 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3425  small multidrug resistance protein  30.28 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681644  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0731  small multidrug efflux pump  36.36 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2505  SMR family multidrug efflux pump  38.53 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  31.07 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1884  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4979  small multidrug resistance protein  37.38 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.174415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0871  small multidrug resistance protein  34.58 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1319  small multidrug resistance protein  42.2 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0145783  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4930  small multidrug resistance protein  36.45 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.984602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1659  small multidrug resistance protein  35.19 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119593  normal  0.110471 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4802  small multidrug resistance protein  36.45 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.123188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2257  small multidrug resistance protein  34.29 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.709004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02486  hypothetical protein  37.37 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1617  small multidrug resistance protein  34.29 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  35.24 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2205  small multidrug resistance protein  39.45 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2603  small multidrug resistance protein  36.11 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1973  small multidrug resistance protein  36.36 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1584  multidrug efflux protein  54.41 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.339035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0150  quaternary ammonium compound-resistance protein QacEdelta1  54.41 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.928712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  38 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  34.31 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>