More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_A0159 on replicon NC_004349
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004349  SO_A0159  multidrug efflux transporter  100 
 
 		 108 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0763675  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3425  small multidrug resistance protein  98.15 
 
 		 108 aa  209  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681644  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4225  small multidrug resistance protein  95.37 
 
 		 108 aa  206  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.023296 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0377  small multidrug resistance protein  87.96 
 
 		 108 aa  191  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0271  small multidrug resistance protein  85.19 
 
 		 108 aa  189  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1437  small multidrug resistance protein  75.93 
 
 		 108 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06909  hypothetical protein  71.56 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0408  quaternary ammonium compound-resistance protein  61.47 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  44.95 
 
 		 109 aa  98.2  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  43.56 
 
 		 110 aa  97.8  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  43.93 
 
 		 110 aa  96.7  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  43.93 
 
 		 110 aa  96.7  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  45.54 
 
 		 116 aa  94.7  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2543  small multidrug resistance protein  43.4 
 
 		 109 aa  93.6  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544067  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  40.74 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1684  multidrug transporter EmrE  43.4 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487331  normal  0.0413845 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1835  multidrug transporter EmrE  43.4 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.997367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1772  multidrug transporter EmrE  43.4 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.132035 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 		 109 aa  90.9  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1804  multidrug resistance protein, SMR family protein  41.58 
 
 		 110 aa  90.9  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1914  small multidrug resistance protein  41.58 
 
 		 110 aa  90.9  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2208  quaternary ammonium compound-resistance protein  41.58 
 
 		 110 aa  90.9  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.831863  normal  0.342211 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1501  multidrug transporter EmrE  42.45 
 
 		 112 aa  90.9  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21028  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1659  small multidrug resistance protein  40.19 
 
 		 112 aa  89.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119593  normal  0.110471 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1774  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  42.45 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324074  normal  0.0937038 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0437  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 113 aa  89.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.453624  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1088  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1769  small multidrug resistance protein  38.53 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  41.58 
 
 		 110 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3009  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 109 aa  87  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2946  small multidrug resistance protein  38.53 
 
 		 109 aa  86.7  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  37.61 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  37.61 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1826  small multidrug resistance protein  40.37 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal  0.470725 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0488  small multidrug resistance protein  38.89 
 
 		 110 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0280081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2603  small multidrug resistance protein  40.19 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1535  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 112 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1079  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 112 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1559  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 112 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219332  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  36.89 
 
 		 110 aa  83.6  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1245  SMR family multidrug efflux pump  41.9 
 
 		 112 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1730  SMR family multidrug efflux pump  41.9 
 
 		 112 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1984  SMR family multidrug efflux pump  41.9 
 
 		 112 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1815  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  41.9 
 
 		 112 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.701999  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1832  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  41.9 
 
 		 112 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.935098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0774  SMR family multidrug efflux pump  41.9 
 
 		 112 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15362  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0388  SMR family multidrug efflux pump  41.9 
 
 		 112 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4701  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1673  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107144 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2364  small multidrug resistance protein  40.19 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1481  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2502  quaternary ammonium efflux pump, 4 TMS small multidrug resistance (SMR) family, GacE  37.04 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85484  normal  0.536214 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1234  small multidrug resistance protein  41.58 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1735  small multidrug resistance protein  40.19 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1460  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  30.77 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  30.77 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2505  SMR family multidrug efflux pump  40.95 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4701  small multidrug resistance protein  39.39 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  30.48 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00740  multidrug efflux SMR transporter  46.67 
 
 		 90 aa  80.1  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1110  small multidrug resistance protein  41.3 
 
 		 109 aa  80.1  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200886  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  30.48 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  30.77 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1576  small multidrug resistance protein  36.11 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.554715  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3071  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 		 107 aa  80.1  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.425013  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  38 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  29.81 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  38 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0450  small multidrug resistance protein  39.39 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0813  multidrug efflux protein  38.32 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.109831  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2036  multidrug efflux protein  38.32 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1603  multidrug efflux protein  38.32 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352426 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  39.45 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3717  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2257  small multidrug resistance protein  40.19 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.709004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0150  quaternary ammonium compound-resistance protein QacEdelta1  38.46 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.928712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1584  multidrug efflux protein  38.46 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.339035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  35.78 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2887  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.014423 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2546  DMT superfamily multiple drug (quaternary ammonium compounds) efflux pump  32.08 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  38.14 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0541  small multidrug resistance protein  37.04 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.730216  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1617  small multidrug resistance protein  40.19 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  37.96 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3228  multidrug efflux protein  37.38 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0308245  hitchhiker  0.000780201 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  32.32 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0613  small multidrug resistance protein  40.66 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.375677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  31 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3321  small multidrug resistance protein  32.35 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00184251  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00493  multidrug efflux protein  36.45 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38630  cation/cationic drug transporter  36.19 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00498  hypothetical protein  36.45 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95244  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2408  multidrug efflux system protein MdtI  38.38 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00085161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2130  multidrug efflux system protein MdtI  38.38 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1583  SMR family multidrug efflux transporter  32.35 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.352831  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0828  small multidrug resistance protein  31.19 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.251219  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5725  SMR multidrug efflux transporter  37.96 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2019  multidrug efflux system protein MdtI  38.38 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.993103  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65990  SMR multidrug efflux transporter  37.96 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00317706  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>