261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2546 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2546  DMT superfamily multiple drug (quaternary ammonium compounds) efflux pump  100 
 
 		 119 aa  234  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1659  small multidrug resistance protein  45.05 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119593  normal  0.110471 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4701  small multidrug resistance protein  44.14 
 
 		 112 aa  92.8  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1535  small multidrug resistance protein  44.14 
 
 		 112 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1673  small multidrug resistance protein  44.14 
 
 		 112 aa  92  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107144 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1481  small multidrug resistance protein  44.14 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1079  small multidrug resistance protein  44.14 
 
 		 112 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1460  small multidrug resistance protein  44.14 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1559  small multidrug resistance protein  44.14 
 
 		 112 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219332  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0450  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 		 109 aa  89.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2502  quaternary ammonium efflux pump, 4 TMS small multidrug resistance (SMR) family, GacE  43.24 
 
 		 112 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85484  normal  0.536214 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2505  SMR family multidrug efflux pump  43.24 
 
 		 112 aa  88.6  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1735  small multidrug resistance protein  40.54 
 
 		 112 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512755  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1245  SMR family multidrug efflux pump  41.44 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1832  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  41.44 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.935098  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1984  SMR family multidrug efflux pump  41.44 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0774  SMR family multidrug efflux pump  41.44 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15362  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1730  SMR family multidrug efflux pump  41.44 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0388  SMR family multidrug efflux pump  41.44 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1815  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  41.44 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.701999  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1804  multidrug resistance protein, SMR family protein  37.74 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2208  quaternary ammonium compound-resistance protein  37.74 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.831863  normal  0.342211 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1914  small multidrug resistance protein  37.74 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2364  small multidrug resistance protein  43.69 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2603  small multidrug resistance protein  38.89 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1501  multidrug transporter EmrE  41.44 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21028  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  41.75 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1234  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1835  multidrug transporter EmrE  40.54 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.997367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1684  multidrug transporter EmrE  40.54 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487331  normal  0.0413845 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1772  multidrug transporter EmrE  40.54 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.132035 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1774  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  40.54 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324074  normal  0.0937038 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  40 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1576  small multidrug resistance protein  40.57 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.554715  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  37.14 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0159  multidrug efflux transporter  32.08 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0763675  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3009  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  35.58 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  35.58 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3425  small multidrug resistance protein  31.13 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681644  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2946  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  40.78 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  40.78 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  40.78 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2543  small multidrug resistance protein  38.89 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544067  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  38.46 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0271  small multidrug resistance protein  32.08 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1088  small multidrug resistance protein  35.92 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4225  small multidrug resistance protein  30.19 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.023296 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0437  small multidrug resistance protein  35 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.453624  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  38.1 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  38.1 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  37.61 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1437  small multidrug resistance protein  29.25 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0377  small multidrug resistance protein  31.13 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1826  small multidrug resistance protein  34.91 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal  0.470725 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  35.19 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  36.11 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  37.14 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1769  small multidrug resistance protein  35.85 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4701  small multidrug resistance protein  36.19 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1884  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0488  small multidrug resistance protein  31.48 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0280081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1584  multidrug efflux protein  37.86 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.339035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0150  quaternary ammonium compound-resistance protein QacEdelta1  38.24 
 
 		 115 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.928712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0118  small multidrug resistance protein  33.98 
 
 		 109 aa  67  0.00000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3008  small multidrug resistance protein  35.85 
 
 		 113 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3289  small multidrug resistance protein  34.65 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  35.51 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3321  small multidrug resistance protein  34.29 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00184251  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0828  small multidrug resistance protein  33.01 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.251219  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  33.96 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1638  efflux-multidrug resistance protein  35 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.381762  hitchhiker  0.000000419533 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06909  hypothetical protein  30.63 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3259  small multidrug resistance protein  35.85 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2887  small multidrug resistance protein  39.77 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.014423 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2072  small multidrug resistance protein  32.67 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  34.62 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1516  small multidrug resistance protein  36.54 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  34.91 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02486  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  34.62 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0541  small multidrug resistance protein  31.48 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.730216  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1196  small multidrug resistance protein  34.21 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65990  SMR multidrug efflux transporter  39.05 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00317706  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4930  small multidrug resistance protein  32.41 
 
 		 110 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.984602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1583  SMR family multidrug efflux transporter  34.62 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.352831  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4802  small multidrug resistance protein  32.41 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.123188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3071  small multidrug resistance protein  33.02 
 
 		 107 aa  63.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.425013  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0613  small multidrug resistance protein  33.64 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.375677  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4979  multidrug resistance protein  32.41 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0552  multidrug ABC transporter  39.74 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4979  small multidrug resistance protein  32.41 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.174415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1617  small multidrug resistance protein  33.96 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0536  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568122  normal  0.0651219 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2204  small multidrug resistance protein  39.74 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.148347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1762  small multidrug resistance protein  37.04 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>