279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2988 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2988  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 108 aa  202  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282135  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12490  cation/cationic drug transporter  61.17 
 
 		 106 aa  118  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4976  small multidrug resistance protein  56.88 
 
 		 109 aa  108  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0616597 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31070  cation/cationic drug transporter  53.7 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.438868  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2897  small multidrug resistance protein  57.61 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216047  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2867  small multidrug resistance protein  57.61 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2911  small multidrug resistance protein  57.61 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3345  small multidrug resistance protein  53.7 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0912633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3346  small multidrug resistance protein  50.89 
 
 		 108 aa  88.6  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0550769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2987  small multidrug resistance protein  51.89 
 
 		 115 aa  83.6  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112994  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0987  small multidrug resistance efflux protein  49.07 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25874  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4975  small multidrug resistance protein  52.44 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0590431 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3554  small multidrug resistance protein  46.73 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2896  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2866  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2910  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240481  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4527  small multidrug resistance protein  47.17 
 
 		 107 aa  76.6  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  39.09 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  38.18 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  38.18 
 
 		 120 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  39.09 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  38.18 
 
 		 120 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0627  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  38.18 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3553  small multidrug resistance protein  50.46 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  39.25 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  39.25 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1319  small multidrug resistance protein  45.28 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0145783  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6952  small multidrug resistance protein  42.99 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38630  cation/cationic drug transporter  40.2 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  39.09 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4478  quaternary ammonium compound-resistance protein  43.52 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.513  normal  0.735408 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31080  cation/cationic drug transporter  45.71 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.234075  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  40.82 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1762  small multidrug resistance protein  38.89 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  39.25 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  41.51 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3074  small multidrug resistance protein  37.62 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219411  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  41.35 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0986  small multidrug resistance protein  38.68 
 
 		 291 aa  62  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2946  small multidrug resistance protein  36.7 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2410  small multidrug resistance protein  38.68 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  37.04 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  37.74 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  37.04 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4701  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3071  small multidrug resistance protein  40.78 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.425013  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  36.7 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4263  small multidrug resistance protein  35.85 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  35.85 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  35.78 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0339  small multidrug resistance protein  34.65 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2072  small multidrug resistance protein  31.48 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0657  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0731  small multidrug efflux pump  35.58 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  36.45 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3466  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0437  small multidrug resistance protein  35.71 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.453624  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  37.5 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0828  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.251219  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1088  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0118  small multidrug resistance protein  34.55 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1719  small multidrug resistance protein  42.27 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241026 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1973  small multidrug resistance protein  35.92 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5493  small multidrug resistance protein  33.66 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.659529  normal  0.39797 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1617  small multidrug resistance protein  35.64 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2205  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0798  SMR family multidrug efflux transporter  33.33 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.621925  normal  0.0234862 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  37.37 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1196  small multidrug resistance protein  39.39 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0488  small multidrug resistance protein  34.65 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0280081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1095  SMR drug efflux transporter  35.64 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.1863  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3009  small multidrug resistance protein  37.38 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1826  small multidrug resistance protein  33.98 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal  0.470725 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2257  small multidrug resistance protein  34.65 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.709004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  35.29 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00493  multidrug efflux protein  35.92 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00498  hypothetical protein  35.92 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95244  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1659  small multidrug resistance protein  36.89 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119593  normal  0.110471 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0556  SMR family multidrug efflux pump  32.71 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0871  small multidrug resistance protein  34.62 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2305  small multidrug resistance protein  36.79 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.148395  normal  0.149185 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1603  multidrug efflux protein  34.95 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352426 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3228  multidrug efflux protein  34.95 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0308245  hitchhiker  0.000780201 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1307  SMR family multidrug efflux pump  32.71 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1102  small multidrug resistance protein  34.69 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2036  multidrug efflux protein  34.95 
 
 		 110 aa  52  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0813  multidrug efflux protein  34.95 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.109831  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1912  multidrug efflux system protein MdtI  37.37 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1188  SMR family multidrug efflux pump  31.78 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0159  multidrug efflux transporter  32.38 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0763675  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2364  small multidrug resistance protein  35.92 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  33.96 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  37.14 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2505  SMR family multidrug efflux pump  37.76 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2060  small multidrug resistance protein  38.89 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>