215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_31080 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_31080  cation/cationic drug transporter  100 
 
 		 113 aa  212  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.234075  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3554  small multidrug resistance protein  67.65 
 
 		 107 aa  121  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3346  small multidrug resistance protein  60.58 
 
 		 108 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0550769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2987  small multidrug resistance protein  55.36 
 
 		 115 aa  105  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112994  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0987  small multidrug resistance efflux protein  53.33 
 
 		 107 aa  97.1  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25874  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2866  small multidrug resistance protein  51.38 
 
 		 114 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2910  small multidrug resistance protein  51.38 
 
 		 114 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2896  small multidrug resistance protein  51.38 
 
 		 114 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3345  small multidrug resistance protein  50.98 
 
 		 106 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0912633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31070  cation/cationic drug transporter  56 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.438868  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4527  small multidrug resistance protein  49.06 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0627  small multidrug resistance protein  42.06 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12490  cation/cationic drug transporter  46.6 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2988  small multidrug resistance protein  45.71 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282135  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6952  small multidrug resistance protein  47.62 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4975  small multidrug resistance protein  49.56 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0590431 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4976  small multidrug resistance protein  42.99 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0616597 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3553  small multidrug resistance protein  47.62 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1911  multidrug efflux system protein MdtJ  34.78 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01569  multidrug efflux system transporter  34.82 
 
 		 121 aa  66.6  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2043  small multidrug resistance protein  34.82 
 
 		 121 aa  66.6  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.899542  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1807  multidrug efflux system protein MdtJ  34.82 
 
 		 121 aa  66.6  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1599  multidrug efflux system protein MdtJ  34.82 
 
 		 121 aa  66.6  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.62917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2030  multidrug efflux system protein MdtJ  34.82 
 
 		 121 aa  66.6  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01559  hypothetical protein  34.82 
 
 		 121 aa  66.6  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1674  multidrug efflux system protein MdtJ  34.82 
 
 		 121 aa  66.6  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2310  multidrug efflux system protein MdtJ  34.82 
 
 		 121 aa  66.6  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1786  multidrug efflux system protein MdtJ  34.82 
 
 		 121 aa  66.6  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4478  quaternary ammonium compound-resistance protein  41.75 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.513  normal  0.735408 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2766  small multidrug resistance protein  35.34 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131803  normal  0.0168064 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1592  multidrug efflux system protein MdtJ  34.58 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.999303 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1858  multidrug efflux system protein MdtJ  34.58 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.636253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1651  multidrug efflux system protein MdtJ  34.58 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1691  multidrug efflux system protein MdtJ  34.58 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.190656  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1762  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1583  multidrug efflux system protein MdtJ  34.58 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.159233 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38630  cation/cationic drug transporter  39.22 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2364  small multidrug resistance protein  41.51 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2409  multidrug resistance protein MdtJ  35.04 
 
 		 147 aa  62  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00258719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2020  multidrug resistance protein MdtJ  35.04 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.993103  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2131  small multidrug resistance protein  35.04 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0339  small multidrug resistance protein  36.11 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3466  small multidrug resistance protein  37.96 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2036  multidrug efflux protein  39.45 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2543  small multidrug resistance protein  41.12 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544067  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1319  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0145783  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3228  multidrug efflux protein  39.45 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0308245  hitchhiker  0.000780201 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0813  multidrug efflux protein  38.53 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.109831  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3074  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219411  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0657  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00493  multidrug efflux protein  38.53 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  33.94 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00498  hypothetical protein  38.53 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95244  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  37.04 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  37.04 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1603  multidrug efflux protein  37.61 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352426 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1088  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4979  multidrug resistance protein  33.02 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0437  small multidrug resistance protein  37.37 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.453624  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  37.61 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  40.59 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0541  small multidrug resistance protein  33.02 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.730216  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  40.59 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0450  small multidrug resistance protein  37.37 
 
 		 109 aa  57  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2208  quaternary ammonium compound-resistance protein  37.25 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.831863  normal  0.342211 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  37.04 
 
 		 116 aa  57  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1804  multidrug resistance protein, SMR family protein  37.25 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1914  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1773  DMT superfamily multidrug efflux pump  40.38 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.251074  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0420  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  37.86 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1769  small multidrug resistance protein  36.36 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3716  small multidrug resistance protein  30.43 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0731  small multidrug efflux pump  33.33 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0871  small multidrug resistance protein  37.37 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4930  small multidrug resistance protein  33 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.984602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0488  small multidrug resistance protein  34 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0280081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0798  SMR family multidrug efflux transporter  34.95 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.621925  normal  0.0234862 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3071  small multidrug resistance protein  38.32 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.425013  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2867  small multidrug resistance protein  52.17 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2911  small multidrug resistance protein  52.17 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0536  small multidrug resistance protein  33 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568122  normal  0.0651219 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2897  small multidrug resistance protein  52.17 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216047  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  30.36 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1826  small multidrug resistance protein  35.35 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal  0.470725 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4802  small multidrug resistance protein  33 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.123188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  37.27 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  30.36 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  30.36 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  30.36 
 
 		 120 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  32.08 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  33.64 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  37.27 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  39 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  34.29 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3545  small multidrug resistance protein  31.3 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4755  small multidrug resistance protein  36.94 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.504307  normal  0.07446 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2603  small multidrug resistance protein  36.19 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  34.86 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>