More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2131 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2131  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 147 aa  291  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2020  multidrug resistance protein MdtJ  100 
 
 		 147 aa  291  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.993103  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2409  multidrug resistance protein MdtJ  98.64 
 
 		 147 aa  286  6e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00258719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2766  small multidrug resistance protein  77.12 
 
 		 122 aa  179  9.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131803  normal  0.0168064 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1911  multidrug efflux system protein MdtJ  68.7 
 
 		 120 aa  155  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1651  multidrug efflux system protein MdtJ  66.67 
 
 		 120 aa  146  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1691  multidrug efflux system protein MdtJ  66.67 
 
 		 120 aa  146  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.190656  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1858  multidrug efflux system protein MdtJ  66.67 
 
 		 120 aa  146  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.636253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1592  multidrug efflux system protein MdtJ  66.67 
 
 		 120 aa  146  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.999303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1583  multidrug efflux system protein MdtJ  67.26 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.159233 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01569  multidrug efflux system transporter  67.57 
 
 		 121 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2043  small multidrug resistance protein  67.57 
 
 		 121 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.899542  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2310  multidrug efflux system protein MdtJ  67.57 
 
 		 121 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2030  multidrug efflux system protein MdtJ  67.57 
 
 		 121 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1807  multidrug efflux system protein MdtJ  67.57 
 
 		 121 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01559  hypothetical protein  67.57 
 
 		 121 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1599  multidrug efflux system protein MdtJ  67.57 
 
 		 121 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.62917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1786  multidrug efflux system protein MdtJ  67.57 
 
 		 121 aa  143  8.000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1674  multidrug efflux system protein MdtJ  67.57 
 
 		 121 aa  143  8.000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44520  putative drug efflux transporter  55.75 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.44142 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3791  putative drug efflux transporter  53.91 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.773212  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1360  small multidrug resistance protein  48.62 
 
 		 114 aa  95.5  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00509  cation transporter  41.74 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001962  spermidine export protein mdtJ  36.29 
 
 		 134 aa  84  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2060  small multidrug resistance protein  39.62 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2305  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.148395  normal  0.149185 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1812  small multidrug resistance protein  40.65 
 
 		 144 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2406  SMR family multidrug efflux pump  36.8 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.374447  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0063  small multidrug resistance protein  37.84 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0718  small multidrug resistance protein  33.05 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  34.48 
 
 		 120 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  31.03 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3554  small multidrug resistance protein  36.11 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  31.03 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  30.17 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  33.62 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  33.62 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  32.69 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1102  small multidrug resistance protein  35.05 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3071  small multidrug resistance protein  33.66 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.425013  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3466  small multidrug resistance protein  34.31 
 
 		 110 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0437  small multidrug resistance protein  35 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.453624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0360  multidrug resistance protein, Smr family  32.32 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1080  conserved hypothetical protein, putative multidrug resistance efflux protein  35.63 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.644229  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0313  SMR family multidrug efflux pump  31.31 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0296  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  31.31 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0300  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  31.31 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0328  SMR family multidrug efflux pump  31.31 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  32.67 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0374  multidrug resistance protein, Smr family  31.31 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0308  small multidrug resistance protein  30.3 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1476  SMR drug efflux transporter  30.23 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4946  multidrug resistance protein, Smr family  31.31 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0402  multidrug resistance protein, Smr family  31.31 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0151896  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1863  small multidrug resistance protein  34.38 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3346  small multidrug resistance protein  35.78 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0550769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  31.31 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0357  SMR family multidrug efflux pump  35.29 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1188  SMR family multidrug efflux pump  36.19 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  26.42 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  26.42 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1307  SMR family multidrug efflux pump  35.24 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0556  SMR family multidrug efflux pump  35.24 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0871  small multidrug resistance protein  28.87 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  32.32 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1973  small multidrug resistance protein  33.67 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4979  small multidrug resistance protein  31.37 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.174415  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4930  small multidrug resistance protein  31.37 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.984602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4802  small multidrug resistance protein  31.37 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.123188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0813  multidrug efflux protein  32.71 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.109831  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2036  multidrug efflux protein  32.71 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0307  small multidrug resistance protein  35.29 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0536  small multidrug resistance protein  32.32 
 
 		 110 aa  57  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568122  normal  0.0651219 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4057  small multidrug resistance protein  30.11 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.797471  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1603  multidrug efflux protein  31.78 
 
 		 110 aa  57  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352426 
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  32.35 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1584  multidrug efflux protein  31.73 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.339035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3228  multidrug efflux protein  32.71 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0308245  hitchhiker  0.000780201 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1095  SMR drug efflux transporter  29.09 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.1863  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  32.32 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  32.35 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0731  small multidrug efflux pump  28.71 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4527  small multidrug resistance protein  32.69 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  31.43 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  32 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0476  small multidrug resistance protein  35.87 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.651583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0986  small multidrug resistance protein  26.61 
 
 		 291 aa  54.7  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0150  quaternary ammonium compound-resistance protein QacEdelta1  30.91 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.928712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  36.27 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5663  small multidrug resistance protein  30.3 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.486536  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5196  small multidrug resistance protein  30.3 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31080  cation/cationic drug transporter  35.04 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.234075  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00493  multidrug efflux protein  30.84 
 
 		 110 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0853  small multidrug resistance protein  30.3 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0488  small multidrug resistance protein  31.37 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0280081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00498  hypothetical protein  30.84 
 
 		 110 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95244  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  27.1 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2364  small multidrug resistance protein  30.3 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  30.77 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40170  putative transporter  30.77 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>