193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2987 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2987  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 115 aa  219  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112994  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3346  small multidrug resistance protein  55.34 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0550769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3554  small multidrug resistance protein  57.84 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31080  cation/cationic drug transporter  55.36 
 
 		 113 aa  95.9  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.234075  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3345  small multidrug resistance protein  59.6 
 
 		 106 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0912633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2866  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 114 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2910  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 114 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2896  small multidrug resistance protein  50 
 
 		 114 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12490  cation/cationic drug transporter  56.31 
 
 		 106 aa  90.5  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31070  cation/cationic drug transporter  55 
 
 		 106 aa  89.4  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.438868  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4976  small multidrug resistance protein  47.22 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0616597 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2988  small multidrug resistance protein  51.89 
 
 		 108 aa  83.6  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282135  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0987  small multidrug resistance efflux protein  45.71 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25874  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4975  small multidrug resistance protein  48.21 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0590431 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3553  small multidrug resistance protein  54.21 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4527  small multidrug resistance protein  46.67 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38630  cation/cationic drug transporter  36.7 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1762  small multidrug resistance protein  37.04 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0627  small multidrug resistance protein  38.89 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6952  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12480  cation/cationic drug transporter  54.64 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2867  small multidrug resistance protein  48.28 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2911  small multidrug resistance protein  48.28 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2897  small multidrug resistance protein  48.28 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216047  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  38.05 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  38.05 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2410  small multidrug resistance protein  42.16 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1911  multidrug efflux system protein MdtJ  29.57 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4478  quaternary ammonium compound-resistance protein  38.32 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.513  normal  0.735408 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  37.17 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  40.78 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  40.78 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4802  small multidrug resistance protein  36.7 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.123188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  37.74 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  37.74 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4930  small multidrug resistance protein  36.7 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.984602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4979  small multidrug resistance protein  36.7 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.174415  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01569  multidrug efflux system transporter  29.82 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2043  small multidrug resistance protein  29.82 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.899542  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1807  multidrug efflux system protein MdtJ  29.82 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2030  multidrug efflux system protein MdtJ  29.82 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1674  multidrug efflux system protein MdtJ  29.82 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1088  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1786  multidrug efflux system protein MdtJ  29.82 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1599  multidrug efflux system protein MdtJ  29.82 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.62917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2310  multidrug efflux system protein MdtJ  29.82 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01559  hypothetical protein  29.82 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2543  small multidrug resistance protein  38.39 
 
 		 109 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544067  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1858  multidrug efflux system protein MdtJ  30.43 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.636253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1691  multidrug efflux system protein MdtJ  30.43 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.190656  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1592  multidrug efflux system protein MdtJ  30.43 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.999303 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1651  multidrug efflux system protein MdtJ  30.43 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  35.51 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2364  small multidrug resistance protein  37.61 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0488  small multidrug resistance protein  35.78 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0280081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4701  small multidrug resistance protein  39.45 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1535  small multidrug resistance protein  38.53 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  36.89 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3071  small multidrug resistance protein  38.83 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.425013  normal  0.0220717 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2072  small multidrug resistance protein  36.94 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1079  small multidrug resistance protein  38.53 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0437  small multidrug resistance protein  34.26 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.453624  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  35.14 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1559  small multidrug resistance protein  38.53 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219332  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1826  small multidrug resistance protein  35.19 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal  0.470725 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1583  multidrug efflux system protein MdtJ  31.53 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.159233 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0536  small multidrug resistance protein  35.78 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568122  normal  0.0651219 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2766  small multidrug resistance protein  29.46 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131803  normal  0.0168064 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  34.23 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  36.04 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  31.25 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2603  small multidrug resistance protein  35.4 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0339  small multidrug resistance protein  33.64 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0657  small multidrug resistance protein  36.79 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  37.96 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  34.58 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1673  small multidrug resistance protein  37.61 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107144 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  31.25 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  30.09 
 
 		 120 aa  52.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2208  quaternary ammonium compound-resistance protein  32.71 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.831863  normal  0.342211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3074  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219411  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1460  small multidrug resistance protein  38.53 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1914  small multidrug resistance protein  32.71 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1360  small multidrug resistance protein  32.43 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1481  small multidrug resistance protein  38.53 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1804  multidrug resistance protein, SMR family protein  32.71 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1245  SMR family multidrug efflux pump  36.45 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1984  SMR family multidrug efflux pump  36.45 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  30.36 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1730  SMR family multidrug efflux pump  36.45 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0388  SMR family multidrug efflux pump  36.45 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1815  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  36.45 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.701999  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1832  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  36.45 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.935098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0774  SMR family multidrug efflux pump  36.45 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15362  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  30.36 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  30.36 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4701  small multidrug resistance protein  36.79 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  32.71 
 
 		 109 aa  50.8  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0450  small multidrug resistance protein  35.85 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.724767 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>